108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1554 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1554  esterase YpfH  100 
 
 		 241 aa  476  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.694816 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2979  esterase YpfH  46.48 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.349492  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2845  esterase YpfH  45.25 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2604  esterase YpfH  45.25 
 
 		 232 aa  175  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1203  esterase YpfH  45.25 
 
 		 232 aa  175  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.176443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2620  esterase YpfH  45.25 
 
 		 232 aa  175  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3695  esterase YpfH  45.25 
 
 		 232 aa  175  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2753  esterase YpfH  45.25 
 
 		 232 aa  174  8e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3504  esterase YpfH  44.29 
 
 		 229 aa  174  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02365  predicted hydrolase  45.25 
 
 		 232 aa  174  9e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1196  phospholipase/Carboxylesterase  45.25 
 
 		 232 aa  174  9e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2969  esterase YpfH  44.89 
 
 		 231 aa  174  9e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.520422 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02327  hypothetical protein  45.25 
 
 		 232 aa  174  9e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1077  esterase YpfH  43.4 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.213936  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0789  phospholipase/carboxylesterase  45.13 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0528689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3173  esterase YpfH  40.76 
 
 		 205 aa  145  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0129  phospholipase/carboxylesterase  39.23 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1158  esterase YpfH  39.81 
 
 		 205 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.487845  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3967  esterase YpfH  40.28 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.769125  normal  0.0547466 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1888  phospholipase/Carboxylesterase  41.71 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4718  esterase YpfH  37.84 
 
 		 207 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5201  phospholipase/carboxylesterase  41.03 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879928  normal  0.366851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1130  putative hydrolase ypfH  37.57 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5529  phospholipase/Carboxylesterase  40.12 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.748493 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7027  phospholipase/Carboxylesterase  33.66 
 
 		 198 aa  88.2  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5255  phospholipase/Carboxylesterase  33.83 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2039  phospholipase/carboxylesterase  29.47 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2724  phospholipase/carboxylesterase  29.66 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124054  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2351  phospholipase/carboxylesterase  28.57 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1158  phospholipase/carboxylesterase  31.66 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0188854 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1326  phospholipase/carboxylesterase  33.72 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1688  putative phospholipase / carboxylesterase  30.77 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00377416  normal  0.0415953 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1965  phospholipase/carboxylesterase  31.28 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0342368  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1845  phospholipase/Carboxylesterase  30.64 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1900  phospholipase/Carboxylesterase  28.21 
 
 		 235 aa  62  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3842  phospholipase/carboxylesterase  32.52 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4879  phospholipase/carboxylesterase  30.73 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1633  esterase  30.57 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1189  phospholipase/Carboxylesterase  31.03 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2462  phospholipase/Carboxylesterase  25.63 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1006  phospholipase/carboxylesterase family protein  23.6 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03451  esterase  28.06 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1632  phospholipase/carboxylesterase  27.6 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0432  phospholipase/carboxylesterase  28.81 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.332711 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2728  phospholipase/carboxylesterase  28.1 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.56176  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2092  phospholipase/Carboxylesterase  26.39 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.907639 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1386  phospholipase/carboxylesterase  28.1 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2077  phospholipase/carboxylesterase  28.97 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0446  phospholipase/carboxylesterase  27.69 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0890683  normal  0.0467521 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0271  esterase  33.77 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2918  phospholipase/carboxylesterase  25.57 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4485  phospholipase/Carboxylesterase  28.23 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0242  esterase  33.77 
 
 		 190 aa  52  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7245  phospholipase/Carboxylesterase family protein  32.39 
 
 		 117 aa  52  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.431683  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03001  esterase  23.76 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66751  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3946  phospholipase/carboxylesterase  31.43 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3244  phospholipase/carboxylesterase  29.31 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2061  phospholipase/Carboxylesterase  25.84 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1698  phospholipase/Carboxylesterase  33.68 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24861  esterase  33.94 
 
 		 201 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2537  phospholipase/carboxylesterase  27.19 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1893  phospholipase/Carboxylesterase  22.75 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4300  phospholipase/carboxylesterase  31.28 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4066  phospholipase/carboxylesterase  31.28 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2101  phospholipase/carboxylesterase  28.38 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1983  phospholipase/Carboxylesterase  32.87 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1071  carboxylesterase  27.68 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2297  phospholipase/carboxylesterase  28.25 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.563406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3456  phospholipase/carboxylesterase  32.7 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3304  phospholipase/Carboxylesterase  26.61 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0935  phospholipase/carboxylesterase family protein  25.32 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0569  phospholipase/Carboxylesterase  32.93 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5170  phospholipase/Carboxylesterase  28.26 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1982  phospholipase/carboxylesterase  34.48 
 
 		 227 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3966  phospholipase/carboxylesterase  31.07 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.346189  normal  0.196094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  27.64 
 
 		 204 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  27.64 
 
 		 204 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0811  phospholipase/Carboxylesterase  27.49 
 
 		 220 aa  45.4  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.120747  normal  0.850191 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1296  carboxylesterase  25.14 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1167  carboxylesterase, putative  27.23 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00098882  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2404  carboxylesterase, putative  27.75 
 
 		 319 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0171467  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3402  carboxylesterase  26.8 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2197  carboxylesterase  27.47 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610315  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1685  phospholipase/Carboxylesterase  26.56 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0645369  normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1610  phospholipase/carboxylesterase  27.23 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.247692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0272  putative carboxylesterase  27.23 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0149548  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1942  phospholipase/carboxylesterase  27.23 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1958  phospholipase/carboxylesterase  27.23 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0275939  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4429  carboxylesterase  25.14 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.708757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2495  phospholipase/carboxylesterase  26.9 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.402748  normal  0.915999 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4553  carboxylesterase  25.14 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2107  carboxylesterase  27.23 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.213325  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2641  phospholipase/carboxylesterase  23.86 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419247  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4181  phospholipase/carboxylesterase  23.65 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3241  phospholipase/carboxylesterase  23.47 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.774909  normal  0.296389 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02941  esterase  25.65 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.545653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0317  serine esterase  28.04 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441133 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1691  serine esterase  29.19 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1861  phospholipase/carboxylesterase  28.16 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4511  phospholipase/carboxylesterase  28.64 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.642593 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>