76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7245 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7245  phospholipase/Carboxylesterase family protein  100 
 
 		 117 aa  237  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.431683  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7027  phospholipase/Carboxylesterase  41.01 
 
 		 198 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5255  phospholipase/Carboxylesterase  38.85 
 
 		 213 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0129  phospholipase/carboxylesterase  41 
 
 		 208 aa  70.1  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1888  phospholipase/Carboxylesterase  49.3 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3173  esterase YpfH  38.14 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1158  esterase YpfH  36.44 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.487845  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2979  esterase YpfH  30.94 
 
 		 228 aa  63.9  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.349492  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1130  putative hydrolase ypfH  36.23 
 
 		 219 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2039  phospholipase/carboxylesterase  37.63 
 
 		 223 aa  63.5  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1845  phospholipase/Carboxylesterase  37.63 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5529  phospholipase/Carboxylesterase  35 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.748493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4879  phospholipase/carboxylesterase  38.71 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1077  esterase YpfH  30.66 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.213936  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5201  phospholipase/carboxylesterase  34.78 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879928  normal  0.366851 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1189  phospholipase/Carboxylesterase  42.55 
 
 		 221 aa  62  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0789  phospholipase/carboxylesterase  37.63 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0528689 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3504  esterase YpfH  34.75 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02327  hypothetical protein  32.37 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1196  phospholipase/Carboxylesterase  32.37 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02365  predicted hydrolase  32.37 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2845  esterase YpfH  34.45 
 
 		 232 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3695  esterase YpfH  34.45 
 
 		 232 aa  57  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2620  esterase YpfH  34.45 
 
 		 232 aa  57  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1203  esterase YpfH  34.45 
 
 		 232 aa  57  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.176443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2753  esterase YpfH  34.45 
 
 		 232 aa  57  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2604  esterase YpfH  34.45 
 
 		 232 aa  57  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2351  phospholipase/carboxylesterase  36.63 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1900  phospholipase/Carboxylesterase  34.04 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3946  phospholipase/carboxylesterase  31.93 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2969  esterase YpfH  32.12 
 
 		 231 aa  53.5  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.520422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1254  carboxylesterase  35.42 
 
 		 219 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1632  phospholipase/carboxylesterase  35.11 
 
 		 224 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0903  carboxylesterase  35.42 
 
 		 218 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.892603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0446  phospholipase/carboxylesterase  34.38 
 
 		 243 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0890683  normal  0.0467521 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1554  esterase YpfH  32.39 
 
 		 241 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.694816 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1326  phospholipase/carboxylesterase  34.04 
 
 		 222 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1006  phospholipase/carboxylesterase family protein  31.13 
 
 		 214 aa  51.6  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4553  carboxylesterase  33.33 
 
 		 218 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4429  carboxylesterase  33.33 
 
 		 218 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.708757 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1296  carboxylesterase  33.33 
 
 		 218 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14080  carboxylesterase  33.33 
 
 		 215 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1386  phospholipase/carboxylesterase  36.08 
 
 		 220 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2728  phospholipase/carboxylesterase  36.08 
 
 		 220 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.56176  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1158  phospholipase/carboxylesterase  34.65 
 
 		 221 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0188854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0972  phospholipase/carboxylesterase  33.33 
 
 		 218 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0432  phospholipase/carboxylesterase  32.65 
 
 		 233 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.332711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1246  carboxylesterase  32.35 
 
 		 215 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2724  phospholipase/carboxylesterase  35.96 
 
 		 237 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124054  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3241  phospholipase/carboxylesterase  30.85 
 
 		 222 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.774909  normal  0.296389 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4182  carboxylesterase  31.31 
 
 		 223 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1688  putative phospholipase / carboxylesterase  28.85 
 
 		 223 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00377416  normal  0.0415953 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0181  phospholipase/carboxylesterase  32.26 
 
 		 213 aa  46.2  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1965  phospholipase/carboxylesterase  33.65 
 
 		 221 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0342368  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3842  phospholipase/carboxylesterase  44.9 
 
 		 236 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1071  carboxylesterase  30.21 
 
 		 219 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3561  carboxylesterase  31.25 
 
 		 219 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.839773 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04140  carboxylesterase  31.96 
 
 		 222 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3639  Carboxylesterase  31.63 
 
 		 223 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1113  phospholipase/carboxylesterase  33.64 
 
 		 224 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.668569  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0054  carboxylesterase  32.65 
 
 		 248 aa  43.5  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.691003  normal  0.104617 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4297  carboxylesterase  29.9 
 
 		 232 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.378403  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2136  carboxylesterase  34.34 
 
 		 224 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000191828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1494  phospholipase/carboxylesterase  30.11 
 
 		 256 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.259302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11300  Carboxylesterase I  28.12 
 
 		 219 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4377  phospholipase/carboxylesterase  33.67 
 
 		 233 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234043 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2462  phospholipase/Carboxylesterase  35.11 
 
 		 225 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1272  Carboxylesterase  32.65 
 
 		 220 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2022  carboxylesterase  32.32 
 
 		 226 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000559029  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0935  phospholipase/carboxylesterase family protein  29.03 
 
 		 213 aa  41.2  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2130  carboxylesterase  43.14 
 
 		 222 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.939077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0345  carboxylesterase  32.32 
 
 		 223 aa  40.8  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2412  phospholipase/carboxylesterase  29.9 
 
 		 227 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2077  phospholipase/carboxylesterase  42.86 
 
 		 220 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2404  carboxylesterase, putative  31.63 
 
 		 319 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0171467  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3402  carboxylesterase  27.55 
 
 		 220 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>