227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3304 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_3304  phospholipase/Carboxylesterase  100 
 
 
225 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2100  phospholipase/Carboxylesterase  62.1 
 
 
221 aa  261  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1614  phospholipase/carboxylesterase  61.64 
 
 
221 aa  260  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2495  phospholipase/carboxylesterase  60.09 
 
 
221 aa  254  9e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.402748  normal  0.915999 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2306  phospholipase/carboxylesterase  62.93 
 
 
235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412885  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2297  phospholipase/carboxylesterase  57.53 
 
 
238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.563406  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1861  phospholipase/carboxylesterase  53.95 
 
 
228 aa  226  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2931  phospholipase/carboxylesterase  39.91 
 
 
222 aa  148  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1955  phospholipase/carboxylesterase  40.47 
 
 
222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3244  phospholipase/carboxylesterase  32.65 
 
 
245 aa  120  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0092  phospholipase/Carboxylesterase  28.04 
 
 
248 aa  118  7.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.898581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2918  phospholipase/carboxylesterase  34.01 
 
 
218 aa  109  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2954  phospholipase/carboxylesterase  36.46 
 
 
223 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.231462  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  32.73 
 
 
238 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08036  hypothetical protein  27.98 
 
 
215 aa  104  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119993  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2447  phospholipase/carboxylesterase  28.43 
 
 
214 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252523  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2128  phospholipase/carboxylesterase  31.37 
 
 
231 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282469  hitchhiker  0.000267211 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0811  phospholipase/Carboxylesterase  34.18 
 
 
220 aa  99  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.120747  normal  0.850191 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3306  phospholipase/carboxylesterase family protein  29.91 
 
 
240 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703144  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2061  phospholipase/Carboxylesterase  29.3 
 
 
223 aa  96.7  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2092  phospholipase/Carboxylesterase  29 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.907639 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3140  phospholipase/carboxylesterase  28.5 
 
 
240 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0649605  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2537  phospholipase/carboxylesterase  30.56 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3456  phospholipase/carboxylesterase  34.22 
 
 
229 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231793  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1698  phospholipase/Carboxylesterase  32.29 
 
 
222 aa  92.4  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4300  phospholipase/carboxylesterase  34.22 
 
 
229 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4066  phospholipase/carboxylesterase  34.22 
 
 
229 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3459  phospholipase/carboxylesterase  32.42 
 
 
247 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal  0.676516 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4511  phospholipase/carboxylesterase  33.89 
 
 
228 aa  88.6  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.642593 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3966  phospholipase/carboxylesterase  32.04 
 
 
229 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.346189  normal  0.196094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1691  serine esterase  28.07 
 
 
227 aa  87  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0569  phospholipase/Carboxylesterase  35.86 
 
 
218 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1893  phospholipase/Carboxylesterase  29.13 
 
 
223 aa  87  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1982  phospholipase/carboxylesterase  32.63 
 
 
227 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0317  serine esterase  27.36 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441133 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0572  phospholipase/Carboxylesterase  35.86 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.637211  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1208  phospholipase/Carboxylesterase  26.54 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2101  phospholipase/carboxylesterase  26.76 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0540  phospholipase/carboxylesterase  36.14 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0982945  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4485  phospholipase/Carboxylesterase  29.7 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04140  carboxylesterase  27.68 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2462  phospholipase/Carboxylesterase  25.13 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0395  Carboxylesterase  28.57 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1167  carboxylesterase, putative  25 
 
 
228 aa  72  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00098882  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1610  phospholipase/carboxylesterase  25 
 
 
228 aa  72  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.247692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0272  putative carboxylesterase  25 
 
 
228 aa  72  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0149548  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1942  phospholipase/carboxylesterase  25 
 
 
228 aa  72  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1958  phospholipase/carboxylesterase  25 
 
 
228 aa  72  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0275939  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2412  phospholipase/carboxylesterase  28.38 
 
 
227 aa  71.6  0.000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2107  carboxylesterase  25.45 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.213325  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2498  phospholipase/carboxylesterase  32.61 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1899  Carboxylesterase  26.24 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0365567  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2197  carboxylesterase  28 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610315  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  27.89 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  27.89 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3420  phospholipase/Carboxylesterase  28.42 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0305  phospholipase/carboxylesterase  33.66 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2404  carboxylesterase, putative  24.09 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0171467  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1907  carboxylesterase  26.47 
 
 
226 aa  64.7  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000226911  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0940  phospholipase/Carboxylesterase  26.58 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127105  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3173  esterase YpfH  28.28 
 
 
205 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1158  esterase YpfH  29.29 
 
 
205 aa  62.8  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.487845  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3813  phospholipase/carboxylesterase  29.26 
 
 
230 aa  62.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0993955  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0054  carboxylesterase  28.02 
 
 
248 aa  62.4  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.691003  normal  0.104617 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1079  phospholipase/carboxylesterase  26.87 
 
 
250 aa  62.4  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1006  phospholipase/carboxylesterase family protein  25.99 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06070  predicted esterase  38.89 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.998593  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0345  carboxylesterase  27.1 
 
 
223 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11300  Carboxylesterase I  25.36 
 
 
219 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1073  phospholipase/Carboxylesterase  29.21 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12720  predicted esterase  32.2 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.699828  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3782  carboxylesterase  24.57 
 
 
222 aa  59.7  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1341  phospholipase/carboxylesterase  29.22 
 
 
279 aa  60.1  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.226633 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3258  phospholipase/carboxylesterase  25.45 
 
 
228 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5170  phospholipase/Carboxylesterase  29.21 
 
 
255 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1107  carboxylesterase  27.59 
 
 
225 aa  59.7  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.175918  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1688  putative phospholipase / carboxylesterase  28.99 
 
 
223 aa  59.3  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00377416  normal  0.0415953 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1674  carboxylesterase  26.75 
 
 
223 aa  59.3  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843799  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1983  phospholipase/Carboxylesterase  27.88 
 
 
217 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1480  esterase  35.77 
 
 
252 aa  58.9  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00152  putative phospholipase/carboxylesterase family protein  25.97 
 
 
223 aa  58.9  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5201  phospholipase/carboxylesterase  32.45 
 
 
277 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879928  normal  0.366851 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3533  Carboxylesterase  25.55 
 
 
219 aa  58.5  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.755115  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3402  carboxylesterase  26.79 
 
 
220 aa  58.5  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1999  phospholipase/carboxylesterase family protein  25.12 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0355  phospholipase/Carboxylesterase  26.02 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0220103  normal  0.29368 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4182  carboxylesterase  26.13 
 
 
223 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2641  phospholipase/carboxylesterase  25.82 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419247  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0959  phospholipase/carboxylesterase  29 
 
 
193 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.258344  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4199  phospholipase/carboxylesterase  27.55 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.588182  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2054  phospholipase/carboxylesterase  32.26 
 
 
381 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2728  phospholipase/carboxylesterase  29.56 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.56176  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1364  phospholipase/Carboxylesterase  35.96 
 
 
216 aa  57  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000864483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2724  phospholipase/carboxylesterase  26.29 
 
 
237 aa  56.6  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124054  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1327  phospholipase/carboxylesterase  36.84 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1950  carboxylesterase  24.31 
 
 
223 aa  56.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000802695  normal  0.0250693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4934  phospholipase/carboxylesterase  29.95 
 
 
210 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00035929 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3946  phospholipase/carboxylesterase  25.25 
 
 
219 aa  56.2  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2136  carboxylesterase  28.21 
 
 
224 aa  56.2  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000191828  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1633  carboxylesterase  24.05 
 
 
223 aa  55.8  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>