41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4718 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4718  esterase YpfH  100 
 
 		 207 aa  410  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3967  esterase YpfH  76.33 
 
 		 212 aa  308  2.9999999999999997e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.769125  normal  0.0547466 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1554  esterase YpfH  37.56 
 
 		 241 aa  135  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.694816 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2979  esterase YpfH  33.33 
 
 		 228 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.349492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3504  esterase YpfH  32.72 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1077  esterase YpfH  30.39 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.213936  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2620  esterase YpfH  32.84 
 
 		 232 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1203  esterase YpfH  32.84 
 
 		 232 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.176443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2845  esterase YpfH  32.84 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3695  esterase YpfH  32.84 
 
 		 232 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2753  esterase YpfH  32.84 
 
 		 232 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2604  esterase YpfH  32.84 
 
 		 232 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1196  phospholipase/Carboxylesterase  32.35 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02365  predicted hydrolase  32.35 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02327  hypothetical protein  32.35 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2969  esterase YpfH  30.61 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.520422 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1158  esterase YpfH  29.69 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.487845  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0789  phospholipase/carboxylesterase  34.85 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0528689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3173  esterase YpfH  28.12 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1888  phospholipase/Carboxylesterase  30.29 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0129  phospholipase/carboxylesterase  23.47 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0063  phospholipase/carboxylesterase  33.15 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03451  esterase  25.25 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2724  phospholipase/carboxylesterase  32.33 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124054  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1685  phospholipase/Carboxylesterase  26.37 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0645369  normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2039  phospholipase/carboxylesterase  27.08 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1633  esterase  25.85 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7027  phospholipase/Carboxylesterase  25.64 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0092  phospholipase/Carboxylesterase  20.19 
 
 		 248 aa  45.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.898581  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1698  phospholipase/Carboxylesterase  29.89 
 
 		 222 aa  45.1  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  27.27 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4181  phospholipase/carboxylesterase  24.16 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5511  phospholipase/Carboxylesterase  26.26 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5017  phospholipase/Carboxylesterase  24.59 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122217  normal  0.0411034 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08036  hypothetical protein  21.5 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119993  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34870  predicted esterase  26.67 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.786447  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02941  esterase  27.46 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.545653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3855  phospholipase/Carboxylesterase  33.33 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1158  phospholipase/carboxylesterase  26.06 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0188854 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  27.95 
 
 		 276 aa  42  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5170  phospholipase/Carboxylesterase  29.91 
 
 		 255 aa  41.2  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.649523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>