195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5249 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  100 
 
 		 243 aa  493  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  37.19 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  37.02 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  36.27 
 
 		 260 aa  128  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  33.82 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  32.7 
 
 		 468 aa  111  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  35.29 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  32.38 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3522  phospholipase/carboxylesterase  30 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  32.74 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  29.91 
 
 		 417 aa  99  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  29.46 
 
 		 417 aa  98.2  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3641  phospholipase/carboxylesterase  29.18 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  30.94 
 
 		 412 aa  96.7  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02216  phospholipase/carboxylesterase superfamily  28.09 
 
 		 245 aa  95.5  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.195432  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0514  phospholipase/carboxylesterase  33.19 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.463342  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  28.84 
 
 		 886 aa  92.8  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  25.61 
 
 		 261 aa  89.4  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1124  phospholipase/Carboxylesterase  26.52 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0088  phospholipase/Carboxylesterase  28.22 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2160  peptidase-like protein  29.74 
 
 		 474 aa  83.2  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.762197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4144  phospholipase/carboxylesterase  27.98 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.111836 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  31.75 
 
 		 1771 aa  81.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  29.87 
 
 		 405 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0944  hypothetical protein  27.59 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992264  normal  0.367367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6203  phospholipase/Carboxylesterase  31.58 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3742  peptidase-like protein  27.65 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3746  peptidase-like  25.35 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3696  peptidase-like protein  32.58 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.469025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6506  phospholipase/Carboxylesterase  27.51 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0298565  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  25.33 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  27.78 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  30.1 
 
 		 406 aa  65.5  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  32.06 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  26.44 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  27.62 
 
 		 563 aa  63.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4415  peptidase-like protein  31.82 
 
 		 384 aa  62.4  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0364  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  25.23 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1987  hypothetical protein  31.4 
 
 		 700 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  25.58 
 
 		 655 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  33.85 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  27.55 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  27.02 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1578  putative esterase  27.59 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.469655 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0160  prolyl oligopeptidase family protein  25.97 
 
 		 655 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  26.49 
 
 		 1002 aa  55.8  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  46 
 
 		 795 aa  55.5  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  25.71 
 
 		 471 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  24.47 
 
 		 544 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0167  prolyl oligopeptidase family protein  25.2 
 
 		 655 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0165  prolyl oligopeptidase family protein  25.2 
 
 		 654 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  27.94 
 
 		 2334 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0187  putative prolyl oligopeptidase family protein  25.2 
 
 		 654 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  29.85 
 
 		 317 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  32.84 
 
 		 322 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1256  putative esterase  28.36 
 
 		 375 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0158  prolyl oligopeptidase family protein  24.81 
 
 		 655 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6266  putative esterase  30.77 
 
 		 276 aa  52.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4136  putative esterase  31.39 
 
 		 327 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4097  putative esterase  31.39 
 
 		 327 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  29.94 
 
 		 326 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1984  esterase, PHB depolymerase family  27.98 
 
 		 337 aa  52.4  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000502853  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0209  putative prolyl oligopeptidase family protein  25.2 
 
 		 652 aa  52  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  28.37 
 
 		 640 aa  52  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1603  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.72 
 
 		 328 aa  52  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  30.57 
 
 		 367 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  29.29 
 
 		 286 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4497  putative esterase  24.81 
 
 		 314 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4946  putative esterase  29.33 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580943  normal  0.169227 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0153  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.05 
 
 		 654 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  30.51 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4039  putative esterase  24.06 
 
 		 314 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5132  prolyl oligopeptidase family protein  23.64 
 
 		 654 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6756  phospholipase/carboxylesterase  28.31 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal  0.369639 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1701  hypothetical protein  26.63 
 
 		 291 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.202768  normal  0.542752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3911  peptidase-like protein  30.58 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.363292  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1043  putative esterase  28.9 
 
 		 274 aa  50.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  28.27 
 
 		 276 aa  49.7  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  33.33 
 
 		 363 aa  49.7  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2825  putative esterase  25.75 
 
 		 319 aa  49.3  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08036  hypothetical protein  27.96 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0185  hypothetical protein  30.88 
 
 		 446 aa  48.9  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000162284  hitchhiker  0.000128495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.3 
 
 		 344 aa  48.9  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  25.89 
 
 		 414 aa  48.5  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  27.88 
 
 		 659 aa  48.5  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  27.54 
 
 		 343 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  24.9 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1232  putative esterase  28.08 
 
 		 311 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  31.34 
 
 		 392 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  27.81 
 
 		 461 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  23.64 
 
 		 652 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4173  phospholipase/carboxylesterase  23.35 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0790  hypothetical protein  30.5 
 
 		 452 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1079  peptidase  24.75 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  27.34 
 
 		 395 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  31.54 
 
 		 387 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1229  hypothetical protein  40 
 
 		 816 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737589  hitchhiker  0.00225369 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  48.94 
 
 		 323 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  30 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0718  hypothetical protein  30.5 
 
 		 452 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>