54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3746 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3746  peptidase-like  100 
 
 		 325 aa  679    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  31.58 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  29.77 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  29.15 
 
 		 218 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  28.74 
 
 		 276 aa  95.9  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  37.5 
 
 		 260 aa  93.2  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  35.61 
 
 		 217 aa  89.7  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  27.01 
 
 		 417 aa  83.2  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  27.34 
 
 		 417 aa  82.4  0.000000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  25.7 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3522  phospholipase/carboxylesterase  27.84 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  26.64 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  26.07 
 
 		 886 aa  79  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  33.77 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3742  peptidase-like protein  35.04 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0088  phospholipase/Carboxylesterase  23.76 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  35.25 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2160  peptidase-like protein  33.33 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.762197 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6203  phospholipase/Carboxylesterase  27.46 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  25.81 
 
 		 468 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  26.13 
 
 		 563 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  23.46 
 
 		 1771 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  25.35 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02216  phospholipase/carboxylesterase superfamily  29.14 
 
 		 245 aa  68.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.195432  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0514  phospholipase/carboxylesterase  34.65 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.463342  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3641  phospholipase/carboxylesterase  24.81 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6506  phospholipase/Carboxylesterase  25.08 
 
 		 264 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0298565  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4415  peptidase-like protein  23.98 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4144  phospholipase/carboxylesterase  30.07 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.111836 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  27.19 
 
 		 2334 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0944  hypothetical protein  29.2 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992264  normal  0.367367 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1124  phospholipase/Carboxylesterase  23.65 
 
 		 257 aa  54.3  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1229  hypothetical protein  42.25 
 
 		 816 aa  53.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737589  hitchhiker  0.00225369 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0185  hypothetical protein  25.43 
 
 		 446 aa  52  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000162284  hitchhiker  0.000128495 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2538  putative esterase  25.2 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  34.15 
 
 		 795 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0718  hypothetical protein  25 
 
 		 452 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0790  hypothetical protein  25 
 
 		 452 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3037  hypothetical protein  39.06 
 
 		 850 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5819  hypothetical protein  39.44 
 
 		 816 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438939  decreased coverage  0.00192823 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  42.59 
 
 		 659 aa  46.6  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1987  hypothetical protein  20.49 
 
 		 700 aa  46.2  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  22.96 
 
 		 286 aa  46.2  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1052  phospholipase/carboxylesterase  28.97 
 
 		 365 aa  46.2  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1408  putative esterase  22.18 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0188455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1149  Acylaminoacyl-peptidase  44.68 
 
 		 618 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0889139 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  35.44 
 
 		 1002 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  25.1 
 
 		 640 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5656  peptidase-like protein  46.43 
 
 		 162 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.246418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  23.5 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4144  putative esterase  32.81 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  31.82 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2922  carboxylesterase  36.62 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.33 
 
 		 632 aa  43.5  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>