178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0890 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  100 
 
 
417 aa  859    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  96.64 
 
 
417 aa  835    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  51.1 
 
 
412 aa  432  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  40.92 
 
 
405 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0514  phospholipase/carboxylesterase  51.54 
 
 
249 aa  243  3.9999999999999997e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.463342  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  37.9 
 
 
277 aa  162  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0088  phospholipase/Carboxylesterase  40.09 
 
 
255 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1124  phospholipase/Carboxylesterase  36.96 
 
 
257 aa  159  9e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3641  phospholipase/carboxylesterase  34.19 
 
 
257 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  37.55 
 
 
468 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0185  hypothetical protein  26.98 
 
 
446 aa  158  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000162284  hitchhiker  0.000128495 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  36.02 
 
 
218 aa  153  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0718  hypothetical protein  26.85 
 
 
452 aa  153  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0790  hypothetical protein  26.85 
 
 
452 aa  153  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2160  peptidase-like protein  38.74 
 
 
474 aa  146  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.762197 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  36.86 
 
 
217 aa  142  8e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6506  phospholipase/Carboxylesterase  33.47 
 
 
264 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0298565  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  31.72 
 
 
253 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  34.82 
 
 
276 aa  129  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  32.89 
 
 
268 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3742  peptidase-like protein  34.84 
 
 
326 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1603  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.99 
 
 
328 aa  123  5e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02216  phospholipase/carboxylesterase superfamily  30 
 
 
245 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.195432  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  28.88 
 
 
261 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3522  phospholipase/carboxylesterase  31.74 
 
 
237 aa  116  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  29.59 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  29.1 
 
 
563 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  29.95 
 
 
886 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0944  hypothetical protein  29.39 
 
 
265 aa  98.6  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992264  normal  0.367367 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  29.46 
 
 
243 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4144  phospholipase/carboxylesterase  29.87 
 
 
217 aa  90.5  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.111836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4415  peptidase-like protein  29.86 
 
 
384 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3746  peptidase-like  27.01 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  27.13 
 
 
2334 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  28.36 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  26.83 
 
 
357 aa  72.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0548  phospholipase/Carboxylesterase  25.1 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185297  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  29.26 
 
 
1771 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1106  hypothetical protein  25.12 
 
 
355 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.64 
 
 
628 aa  63.2  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25 
 
 
594 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  28.99 
 
 
406 aa  60.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2781  hypothetical protein  26.15 
 
 
796 aa  60.1  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216427  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  29.8 
 
 
355 aa  58.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6203  phospholipase/Carboxylesterase  26.13 
 
 
292 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0822  hypothetical protein  30.15 
 
 
565 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.390074 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  25 
 
 
678 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4281  PHB depolymerase family esterase  26.18 
 
 
403 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.19 
 
 
429 aa  57.4  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1052  phospholipase/carboxylesterase  21.39 
 
 
365 aa  57  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  27.8 
 
 
343 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.18 
 
 
652 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  32.43 
 
 
363 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2978  hypothetical protein  22.88 
 
 
777 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2092  phospholipase/Carboxylesterase  26.46 
 
 
224 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.907639 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2918  phospholipase/carboxylesterase  22.38 
 
 
218 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  25.65 
 
 
359 aa  53.9  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  26.51 
 
 
1002 aa  53.1  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5656  peptidase-like protein  37.88 
 
 
162 aa  53.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.246418 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  26.29 
 
 
372 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  26.67 
 
 
414 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  26.92 
 
 
396 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3037  hypothetical protein  27.74 
 
 
850 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4615  PHB depolymerase family esterase  26.29 
 
 
359 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  28.05 
 
 
363 aa  52.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.49 
 
 
615 aa  51.2  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1969  esterase, PHB depolymerase  26.5 
 
 
373 aa  51.2  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127109  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  30.34 
 
 
378 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0535  esterase, PHB depolymerase family  28.49 
 
 
338 aa  51.2  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.660761  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2940  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.39 
 
 
689 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000010034  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  27.23 
 
 
367 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0784  hypothetical protein  23.96 
 
 
752 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0799  hypothetical protein  23.96 
 
 
752 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.666809  normal  0.067283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0780  hypothetical protein  23.96 
 
 
752 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.893714 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.65 
 
 
907 aa  50.4  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.48 
 
 
645 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.48 
 
 
645 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  27.07 
 
 
312 aa  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  25.62 
 
 
387 aa  50.1  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3911  peptidase-like protein  25.23 
 
 
286 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.363292  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  26.97 
 
 
419 aa  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3798  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.94 
 
 
634 aa  50.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  23.84 
 
 
325 aa  50.1  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  25.13 
 
 
370 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3767  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.25 
 
 
680 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1893  phospholipase/Carboxylesterase  25.37 
 
 
223 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  22.64 
 
 
396 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  28.78 
 
 
317 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.53 
 
 
374 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35564  predicted protein  29.77 
 
 
285 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189568  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7065  esterase, PHB depolymerase family  24.91 
 
 
426 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  24.26 
 
 
335 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2820  esterase, PHB depolymerase family  21.9 
 
 
352 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000611867  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5819  hypothetical protein  26.81 
 
 
816 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438939  decreased coverage  0.00192823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  29.29 
 
 
395 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.39 
 
 
706 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  25.99 
 
 
263 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.3 
 
 
705 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.05 
 
 
645 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4614  phospholipase/Carboxylesterase  24.87 
 
 
238 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.376672 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>