203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3857 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  100 
 
 
414 aa  843    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  67.04 
 
 
355 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  61.76 
 
 
359 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  50.64 
 
 
396 aa  338  8e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  44.8 
 
 
429 aa  322  7e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  50.69 
 
 
367 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  50 
 
 
372 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  47.68 
 
 
387 aa  302  9e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3867  esterase, PHB depolymerase  46.31 
 
 
404 aa  301  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.10201  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4273  esterase, PHB depolymerase  46.53 
 
 
394 aa  300  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  51.29 
 
 
429 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1969  esterase, PHB depolymerase  50.28 
 
 
373 aa  292  6e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127109  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5379  putative esterase, PHB depolymerase  54.92 
 
 
411 aa  282  9e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.449035 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3819  PHB depolymerase family esterase  53.79 
 
 
419 aa  280  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4127  esterase, PHB depolymerase family  53.98 
 
 
419 aa  280  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6025  PHB depolymerase family esterase  55.04 
 
 
416 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950963  normal  0.103792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6240  PHB depolymerase family esterase  55.2 
 
 
466 aa  278  9e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.721378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7065  esterase, PHB depolymerase family  52.54 
 
 
426 aa  276  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5706  PHB depolymerase family esterase  53.45 
 
 
438 aa  276  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137114  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2204  esterase, PHB depolymerase  52.35 
 
 
367 aa  275  7e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.667331  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  52.67 
 
 
396 aa  275  8e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4281  PHB depolymerase family esterase  45.55 
 
 
403 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  48.67 
 
 
312 aa  269  7e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3360  esterase, PHB depolymerase family  54.24 
 
 
419 aa  268  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.995755 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  41.37 
 
 
419 aa  266  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  49.63 
 
 
406 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1484  esterase, PHB depolymerase family  42.21 
 
 
425 aa  250  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220911  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  52.08 
 
 
410 aa  249  5e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  45.64 
 
 
544 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1483  PHB depolymerase family esterase  40.92 
 
 
422 aa  247  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0485134  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1761  esterase, PHB depolymerase family  40.92 
 
 
422 aa  246  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1984  esterase, PHB depolymerase family  48.57 
 
 
337 aa  239  9e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000502853  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4102  hypothetical protein  48.85 
 
 
385 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.943667 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  45.14 
 
 
378 aa  226  6e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0209  esterase, PHB depolymerase family  47.04 
 
 
342 aa  209  8e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4615  PHB depolymerase family esterase  46.99 
 
 
359 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2820  esterase, PHB depolymerase family  39.22 
 
 
352 aa  186  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000611867  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  35.95 
 
 
334 aa  179  8e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  36.45 
 
 
398 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4018  hypothetical protein  37.29 
 
 
355 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  35.38 
 
 
398 aa  170  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  35.11 
 
 
398 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  37.04 
 
 
369 aa  167  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  37 
 
 
365 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  37 
 
 
365 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  37 
 
 
365 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  38.35 
 
 
374 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  35.12 
 
 
369 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0301  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  36.07 
 
 
367 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0865  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  36.07 
 
 
367 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  35 
 
 
364 aa  156  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1480  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  36.07 
 
 
382 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289263  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1676  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  36.07 
 
 
382 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2562  depolymerase  36.07 
 
 
382 aa  156  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2425  PHB depolymerase family esterase  36.07 
 
 
382 aa  156  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0332  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  36.07 
 
 
364 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1940  PHB depolymerase family esterase  37.55 
 
 
433 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  35.87 
 
 
343 aa  149  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  34.29 
 
 
343 aa  149  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  36.55 
 
 
370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  33.89 
 
 
344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  35.42 
 
 
394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3759  PHB depolymerase family esterase  36.79 
 
 
369 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209534 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3230  PHB depolymerase family esterase  36.79 
 
 
369 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  33.56 
 
 
344 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0535  esterase, PHB depolymerase family  33.67 
 
 
338 aa  142  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.660761  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3626  esterase, PHB depolymerase  38.85 
 
 
362 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155827  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  34.58 
 
 
343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  32.69 
 
 
366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6278  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  34.56 
 
 
358 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3949  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  38.24 
 
 
357 aa  136  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.994388 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7221  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  34.53 
 
 
363 aa  136  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201442  normal  0.80823 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1012  polyhydroxyalkanoate depolymerase domain-containing protein  34.91 
 
 
427 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5982  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  34.19 
 
 
358 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221901  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  34.19 
 
 
317 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5573  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  34.39 
 
 
421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2235  polyhydroxyalkanoate depolymerase domain-containing protein  34.18 
 
 
427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00861555  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5954  PHB depolymerase family esterase  36.33 
 
 
438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159743 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5937  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  34.39 
 
 
421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  32.6 
 
 
414 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  37.13 
 
 
368 aa  131  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2094  PHB depolymerase family esterase  34.23 
 
 
362 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2039  PHB depolymerase family esterase  34.23 
 
 
362 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249198  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  33.46 
 
 
395 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6439  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  34.45 
 
 
445 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  32.71 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  34.06 
 
 
392 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  33.77 
 
 
419 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  32.58 
 
 
529 aa  123  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  32.23 
 
 
392 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  35.38 
 
 
417 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31730  esterase, PHB depolymerase family  33.05 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0935  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  31.15 
 
 
343 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  30.8 
 
 
363 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  32.77 
 
 
450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3146  PHB depolymerase family esterase  32.59 
 
 
308 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616621  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3195  PHB depolymerase family esterase  32.59 
 
 
308 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1658  hypothetical protein  29.93 
 
 
342 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3281  PHB depolymerase family esterase  31.7 
 
 
308 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.123573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0666  PHB depolymerase family esterase  31.7 
 
 
308 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.19814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>