110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0088 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0088  phospholipase/Carboxylesterase  100 
 
 
255 aa  528  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3641  phospholipase/carboxylesterase  37.7 
 
 
257 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6506  phospholipase/Carboxylesterase  36.98 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0298565  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  38.79 
 
 
412 aa  163  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1124  phospholipase/Carboxylesterase  38.13 
 
 
257 aa  162  7e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  39.19 
 
 
468 aa  161  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  40.09 
 
 
417 aa  161  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  39.22 
 
 
417 aa  158  9e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2160  peptidase-like protein  35.83 
 
 
474 aa  153  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.762197 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3742  peptidase-like protein  37.44 
 
 
326 aa  152  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0514  phospholipase/carboxylesterase  34.98 
 
 
249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.463342  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  34.7 
 
 
253 aa  143  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  33.2 
 
 
405 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  37.27 
 
 
217 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  33.48 
 
 
268 aa  133  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  32.6 
 
 
218 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  31.54 
 
 
277 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  31.11 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  33.79 
 
 
276 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02216  phospholipase/carboxylesterase superfamily  30.18 
 
 
245 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.195432  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  29.25 
 
 
563 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3522  phospholipase/carboxylesterase  28.97 
 
 
237 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  26.19 
 
 
886 aa  90.9  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4144  phospholipase/carboxylesterase  31.53 
 
 
217 aa  89.4  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.111836 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0944  hypothetical protein  26.84 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992264  normal  0.367367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  24.69 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  28.22 
 
 
243 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  28.81 
 
 
2334 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  26.6 
 
 
1771 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4415  peptidase-like protein  29.68 
 
 
384 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3746  peptidase-like  23.76 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6203  phospholipase/Carboxylesterase  27.57 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0822  hypothetical protein  31.72 
 
 
565 aa  62.4  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.390074 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1603  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.88 
 
 
328 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  26.5 
 
 
326 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2306  phospholipase/carboxylesterase  26.2 
 
 
235 aa  52.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412885  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2297  phospholipase/carboxylesterase  23.67 
 
 
238 aa  52  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.563406  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  25.89 
 
 
370 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2781  hypothetical protein  27.27 
 
 
796 aa  49.3  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216427  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  27.09 
 
 
355 aa  48.9  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  26.92 
 
 
645 aa  48.9  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.46 
 
 
429 aa  48.9  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1255  putative esterase  26.9 
 
 
301 aa  48.9  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.469623 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5901  putative esterase  27.21 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5819  hypothetical protein  28.99 
 
 
816 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438939  decreased coverage  0.00192823 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0686  phospholipase/carboxylesterase  26.09 
 
 
232 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0185  hypothetical protein  22.99 
 
 
446 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000162284  hitchhiker  0.000128495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5713  putative esterase  26.9 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129647  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2194  carboxylesterase  44.44 
 
 
289 aa  47.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3558  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.34 
 
 
870 aa  46.6  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212097  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3253  putative esterase  25.5 
 
 
295 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.48 
 
 
645 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5115  putative esterase  25.5 
 
 
295 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0754  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.06 
 
 
724 aa  46.6  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.125402  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5166  putative esterase  25.5 
 
 
295 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  24.39 
 
 
381 aa  46.2  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3140  phospholipase/carboxylesterase  22.99 
 
 
240 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0649605  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  26.09 
 
 
414 aa  45.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.12 
 
 
845 aa  45.8  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3798  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.31 
 
 
634 aa  45.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.23 
 
 
645 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.23 
 
 
645 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.46 
 
 
634 aa  45.4  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.23 
 
 
645 aa  45.4  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  28.12 
 
 
263 aa  45.4  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  23.03 
 
 
343 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0784  hypothetical protein  28.1 
 
 
752 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0799  hypothetical protein  28.1 
 
 
752 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.666809  normal  0.067283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0780  hypothetical protein  28.1 
 
 
752 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.893714 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3530  putative esterase  25.15 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  24.79 
 
 
367 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  30.63 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1208  phospholipase/Carboxylesterase  25.81 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4144  putative esterase  29.03 
 
 
296 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1158  phospholipase/carboxylesterase  25.97 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0188854 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1229  carboxylesterase  42.11 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3037  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.89 
 
 
847 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581469  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0814  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.57 
 
 
765 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000313146  hitchhiker  0.0000639736 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  24.87 
 
 
471 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8816  esterase-like protein  26.82 
 
 
373 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144603  normal  0.0319733 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1221  enterochelin esterase and related enzyme  28.17 
 
 
341 aa  43.9  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.416855 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  26.98 
 
 
396 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  25.63 
 
 
372 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2940  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.33 
 
 
689 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000010034  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.86 
 
 
716 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996189  normal  0.0472619 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3625  putative esterase  21.18 
 
 
283 aa  43.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000216129  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2978  hypothetical protein  24.37 
 
 
777 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1530  putative esterase  24.87 
 
 
295 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547916  normal  0.0514313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1217  dienelactone hydrolase domain-containing protein  27.91 
 
 
310 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135691  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1578  putative esterase  27.27 
 
 
295 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.469655 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
270 aa  42.7  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1229  hypothetical protein  27.45 
 
 
816 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737589  hitchhiker  0.00225369 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3037  hypothetical protein  27.64 
 
 
850 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  24.64 
 
 
316 aa  42.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0718  hypothetical protein  22.85 
 
 
452 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0790  hypothetical protein  22.85 
 
 
452 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0353  hypothetical protein  26.56 
 
 
261 aa  42.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.528975 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  24.26 
 
 
280 aa  42.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1241  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  22.58 
 
 
721 aa  42.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  27.27 
 
 
708 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.386767 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>