174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0912 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  96.64 
 
 		 417 aa  835    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  100 
 
 		 417 aa  859    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  52.08 
 
 		 412 aa  440  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  41.18 
 
 		 405 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0514  phospholipase/carboxylesterase  49.39 
 
 		 249 aa  245  9e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.463342  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  37.5 
 
 		 277 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0088  phospholipase/Carboxylesterase  39.22 
 
 		 255 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1124  phospholipase/Carboxylesterase  36.52 
 
 		 257 aa  157  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  37.55 
 
 		 468 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3641  phospholipase/carboxylesterase  33.33 
 
 		 257 aa  155  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0185  hypothetical protein  27.45 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000162284  hitchhiker  0.000128495 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  35.17 
 
 		 218 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0718  hypothetical protein  27.31 
 
 		 452 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0790  hypothetical protein  27.31 
 
 		 452 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2160  peptidase-like protein  38.74 
 
 		 474 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.762197 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  36.86 
 
 		 217 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  32.16 
 
 		 253 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6506  phospholipase/Carboxylesterase  32.41 
 
 		 264 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0298565  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  35.27 
 
 		 276 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  32.46 
 
 		 268 aa  129  8.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3742  peptidase-like protein  34.84 
 
 		 326 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1603  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.99 
 
 		 328 aa  123  7e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02216  phospholipase/carboxylesterase superfamily  30 
 
 		 245 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.195432  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3522  phospholipase/carboxylesterase  32.17 
 
 		 237 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  28.52 
 
 		 261 aa  116  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  31.38 
 
 		 260 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  29.51 
 
 		 563 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  29.49 
 
 		 886 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  29.91 
 
 		 243 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0944  hypothetical protein  29.39 
 
 		 265 aa  97.8  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992264  normal  0.367367 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4144  phospholipase/carboxylesterase  29 
 
 		 217 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.111836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4415  peptidase-like protein  30.33 
 
 		 384 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3746  peptidase-like  27.34 
 
 		 325 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  27.53 
 
 		 2334 aa  77  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0548  phospholipase/Carboxylesterase  25.91 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185297  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  28.36 
 
 		 357 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  26.83 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  29.26 
 
 		 1771 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1106  hypothetical protein  25.12 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.64 
 
 		 628 aa  63.5  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.42 
 
 		 594 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2781  hypothetical protein  24.87 
 
 		 796 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216427  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  28.5 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6203  phospholipase/Carboxylesterase  26.58 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  25.4 
 
 		 678 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2978  hypothetical protein  23.73 
 
 		 777 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0822  hypothetical protein  29.41 
 
 		 565 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.390074 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  29.29 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1052  phospholipase/carboxylesterase  21.89 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.67 
 
 		 429 aa  57  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  28.25 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.55 
 
 		 652 aa  56.6  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2918  phospholipase/carboxylesterase  25 
 
 		 218 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4281  PHB depolymerase family esterase  25.45 
 
 		 403 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2092  phospholipase/Carboxylesterase  26.46 
 
 		 224 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.907639 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  31.53 
 
 		 363 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3798  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.16 
 
 		 634 aa  53.5  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3911  peptidase-like protein  26.13 
 
 		 286 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.363292  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3037  hypothetical protein  28.47 
 
 		 850 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.78 
 
 		 907 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.62 
 
 		 615 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  25.13 
 
 		 359 aa  52.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5656  peptidase-like protein  36.36 
 
 		 162 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.246418 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  25.9 
 
 		 1002 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  31.03 
 
 		 378 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  25.77 
 
 		 372 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0784  hypothetical protein  23.96 
 
 		 752 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4615  PHB depolymerase family esterase  25.82 
 
 		 359 aa  51.6  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0799  hypothetical protein  23.96 
 
 		 752 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.666809  normal  0.067283 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  26.64 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0780  hypothetical protein  23.96 
 
 		 752 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.893714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.65 
 
 		 677 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0535  esterase, PHB depolymerase family  27.96 
 
 		 338 aa  51.2  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.660761  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35564  predicted protein  25.31 
 
 		 285 aa  50.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189568  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  28.05 
 
 		 363 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  26.44 
 
 		 396 aa  50.4  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1969  esterase, PHB depolymerase  24.9 
 
 		 373 aa  50.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127109  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  26.32 
 
 		 312 aa  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.48 
 
 		 645 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  23.53 
 
 		 370 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  23.11 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.02 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  26.56 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.48 
 
 		 645 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1893  phospholipase/Carboxylesterase  24.63 
 
 		 223 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  29.5 
 
 		 317 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  26.43 
 
 		 263 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  25.12 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3767  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.25 
 
 		 680 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2940  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.58 
 
 		 689 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000010034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  26.7 
 
 		 367 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.64 
 
 		 705 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3696  peptidase-like protein  25.41 
 
 		 261 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.469025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5819  hypothetical protein  27.54 
 
 		 816 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438939  decreased coverage  0.00192823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  30 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  24.49 
 
 		 795 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  29.5 
 
 		 381 aa  47.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7065  esterase, PHB depolymerase family  24.54 
 
 		 426 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185362  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  26.23 
 
 		 204 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  26.23 
 
 		 204 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>