77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0790 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0790  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  935    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0185  hypothetical protein  98.67 
 
 		 446 aa  916    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000162284  hitchhiker  0.000128495 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0718  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  935    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1603  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.39 
 
 		 328 aa  345  1e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  26.85 
 
 		 417 aa  153  7e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5656  peptidase-like protein  64.49 
 
 		 162 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.246418 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  27.31 
 
 		 417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  29.65 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  27.43 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0514  phospholipase/carboxylesterase  29.89 
 
 		 249 aa  92.4  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.463342  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1604  hypothetical protein  47.83 
 
 		 71 aa  67.8  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  26.22 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  29.13 
 
 		 886 aa  63.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1124  phospholipase/Carboxylesterase  21.74 
 
 		 257 aa  62  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  25.22 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  28.74 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3641  phospholipase/carboxylesterase  23.5 
 
 		 257 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  26.21 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  24.44 
 
 		 468 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  26.57 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  27.52 
 
 		 369 aa  53.5  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  26.84 
 
 		 392 aa  53.5  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  30.58 
 
 		 335 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02216  phospholipase/carboxylesterase superfamily  22.27 
 
 		 245 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.195432  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  28.86 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  28.86 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  28.86 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  27.27 
 
 		 392 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3746  peptidase-like  25 
 
 		 325 aa  50.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2160  peptidase-like protein  26.46 
 
 		 474 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.762197 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  25.12 
 
 		 2334 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  23.98 
 
 		 398 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  26.92 
 
 		 260 aa  49.7  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  37.1 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  26.42 
 
 		 253 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4415  peptidase-like protein  25.3 
 
 		 384 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  30.5 
 
 		 243 aa  47.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3911  peptidase-like protein  32.86 
 
 		 286 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.363292  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  33.33 
 
 		 656 aa  47  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3759  PHB depolymerase family esterase  28.42 
 
 		 369 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209534 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  23.08 
 
 		 357 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1547  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  25 
 
 		 492 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  26.85 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  23.31 
 
 		 268 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0458  putative esterase  23.27 
 
 		 237 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  27.85 
 
 		 529 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3230  PHB depolymerase family esterase  27.89 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  23.78 
 
 		 398 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3742  peptidase-like protein  24.87 
 
 		 326 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  26 
 
 		 492 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381426  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  26.17 
 
 		 436 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06093  Acetylxylan esterase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS5]  41.27 
 
 		 306 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00247339 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1183  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.67 
 
 		 910 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0824  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  24.63 
 
 		 492 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0168099  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  31.65 
 
 		 489 aa  44.3  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5954  PHB depolymerase family esterase  26.42 
 
 		 438 aa  44.3  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159743 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1740  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  24.63 
 
 		 492 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.548806  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0624  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  24.63 
 
 		 492 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.520528  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  23.35 
 
 		 394 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1570  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  24.63 
 
 		 492 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0529  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  24.63 
 
 		 492 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1342  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  24.63 
 
 		 492 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.968046  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  40.82 
 
 		 423 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  26.14 
 
 		 1771 aa  43.9  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  25.17 
 
 		 406 aa  43.9  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  39.34 
 
 		 795 aa  43.5  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2562  depolymerase  24.48 
 
 		 382 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.13 
 
 		 286 aa  43.5  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1480  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  24.48 
 
 		 382 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289263  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1676  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  24.48 
 
 		 382 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254076  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2425  PHB depolymerase family esterase  24.48 
 
 		 382 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0332  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  24.48 
 
 		 364 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0865  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  24.48 
 
 		 367 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  38.3 
 
 		 544 aa  43.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0301  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  24.48 
 
 		 367 aa  43.5  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  40.43 
 
 		 363 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  25.98 
 
 		 414 aa  43.1  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>