219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA0824 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0824  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  100 
 
 		 492 aa  987    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0168099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1740  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  100 
 
 		 492 aa  987    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.548806  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  87.4 
 
 		 492 aa  857    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1342  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  100 
 
 		 492 aa  987    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.968046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0529  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  100 
 
 		 492 aa  987    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1547  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  99.8 
 
 		 492 aa  986    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1570  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  99.8 
 
 		 492 aa  986    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0624  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  100 
 
 		 492 aa  987    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.520528  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3289  PHB depolymerase family esterase  33.89 
 
 		 683 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0658  PHB depolymerase family esterase  33.89 
 
 		 683 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.726264 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2065  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  54.73 
 
 		 506 aa  133  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140778  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2417  Fibronectin type III domain protein  41.49 
 
 		 485 aa  106  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1238  fibronectin, type III domain-containing protein  46.85 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.109718  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  31.34 
 
 		 355 aa  98.6  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  29.37 
 
 		 529 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  32.28 
 
 		 378 aa  90.9  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  31.02 
 
 		 450 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  28.15 
 
 		 419 aa  87.8  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  28.83 
 
 		 363 aa  86.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  28.1 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  35 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  28.37 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  28.04 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  27.27 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  27.13 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2204  esterase, PHB depolymerase  28.83 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.667331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  26.61 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  27.74 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  27.74 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  27.74 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  30.32 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  27.34 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  27.37 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31730  esterase, PHB depolymerase family  29.5 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  33.57 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  26.07 
 
 		 369 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  31.97 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  27.4 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  26.28 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  33.33 
 
 		 544 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  31.65 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  26.79 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  32.37 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  31.15 
 
 		 367 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  27.64 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7221  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  31.58 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201442  normal  0.80823 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  52.5 
 
 		 1137 aa  72  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  30.41 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  30.23 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6240  PHB depolymerase family esterase  30.45 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.721378 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  26.01 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  52.56 
 
 		 1209 aa  70.1  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  33.33 
 
 		 429 aa  69.7  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  33.55 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5954  PHB depolymerase family esterase  31.43 
 
 		 438 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2820  esterase, PHB depolymerase family  28.66 
 
 		 352 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000611867  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  31.85 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  28.48 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  32.79 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  34.43 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  34.96 
 
 		 282 aa  67  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0301  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  31.97 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0865  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  31.97 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1480  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  31.97 
 
 		 382 aa  67  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289263  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1676  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  31.97 
 
 		 382 aa  67  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2562  depolymerase  31.97 
 
 		 382 aa  67  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2425  PHB depolymerase family esterase  31.97 
 
 		 382 aa  67  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0332  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  31.97 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  28.93 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  25.58 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  48.72 
 
 		 1121 aa  65.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4102  hypothetical protein  33.1 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.943667 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1658  esterase, PHB depolymerase family  27.68 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.044626  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4281  PHB depolymerase family esterase  25.8 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5982  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  24.49 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  25.76 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6278  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  24.91 
 
 		 358 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3759  PHB depolymerase family esterase  27.63 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209534 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  32.47 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  52.17 
 
 		 1298 aa  62  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  53.95 
 
 		 648 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  53.85 
 
 		 680 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3230  PHB depolymerase family esterase  26.67 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  30.13 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1969  esterase, PHB depolymerase  27.44 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127109  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1940  PHB depolymerase family esterase  26.59 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  28.62 
 
 		 656 aa  60.5  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  40.74 
 
 		 465 aa  60.1  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  32.04 
 
 		 703 aa  59.7  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  39.08 
 
 		 483 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6439  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.04 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4362  PHB depolymerase family esterase  22.38 
 
 		 576 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1484  esterase, PHB depolymerase family  24.91 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220911  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5573  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  27.98 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5937  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.98 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1012  polyhydroxyalkanoate depolymerase domain-containing protein  26.86 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2235  polyhydroxyalkanoate depolymerase domain-containing protein  26.95 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00861555  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34810  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  32.79 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0935  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  25.68 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  40.24 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>