203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3759 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  91.03 
 
 
369 aa  643    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  88.04 
 
 
369 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  91.33 
 
 
365 aa  684    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  91.33 
 
 
365 aa  684    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3230  PHB depolymerase family esterase  99.19 
 
 
369 aa  738    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  91.33 
 
 
365 aa  684    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3759  PHB depolymerase family esterase  100 
 
 
369 aa  743    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209534 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1480  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  64.19 
 
 
382 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289263  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1676  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  64.19 
 
 
382 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2562  depolymerase  64.19 
 
 
382 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2425  PHB depolymerase family esterase  64.19 
 
 
382 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0301  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  68.77 
 
 
367 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  59.1 
 
 
398 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0865  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  68.77 
 
 
367 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  69.52 
 
 
364 aa  451  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0332  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  68.77 
 
 
364 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  58.42 
 
 
398 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  58.01 
 
 
398 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7221  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  50.14 
 
 
363 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201442  normal  0.80823 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5937  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  54.7 
 
 
421 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5573  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  54.7 
 
 
421 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5982  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  48.2 
 
 
358 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221901  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6278  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  54.08 
 
 
358 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6439  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  54.46 
 
 
445 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1012  polyhydroxyalkanoate depolymerase domain-containing protein  45.5 
 
 
427 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2235  polyhydroxyalkanoate depolymerase domain-containing protein  45.5 
 
 
427 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00861555  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5954  PHB depolymerase family esterase  52.05 
 
 
438 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  47.6 
 
 
344 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2094  PHB depolymerase family esterase  43.6 
 
 
362 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2039  PHB depolymerase family esterase  43.6 
 
 
362 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249198  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  46.5 
 
 
344 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  46.13 
 
 
343 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3949  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  40.59 
 
 
357 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.994388 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3626  esterase, PHB depolymerase  39.52 
 
 
362 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155827  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1940  PHB depolymerase family esterase  35.43 
 
 
433 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  38.65 
 
 
343 aa  189  7e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4018  hypothetical protein  38.02 
 
 
355 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  37.31 
 
 
396 aa  177  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  38.95 
 
 
312 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  36.79 
 
 
414 aa  166  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  37.54 
 
 
359 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  36.26 
 
 
367 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  36.5 
 
 
372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  39.36 
 
 
387 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  38.32 
 
 
355 aa  162  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7065  esterase, PHB depolymerase family  40.65 
 
 
426 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185362  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  40 
 
 
410 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1969  esterase, PHB depolymerase  42.14 
 
 
373 aa  159  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127109  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  38.03 
 
 
429 aa  159  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2204  esterase, PHB depolymerase  36.69 
 
 
367 aa  159  9e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.667331  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  33.33 
 
 
429 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  34.04 
 
 
378 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3360  esterase, PHB depolymerase family  39.51 
 
 
419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.995755 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  38.24 
 
 
396 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6240  PHB depolymerase family esterase  37.8 
 
 
466 aa  152  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.721378 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  36.73 
 
 
419 aa  152  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0535  esterase, PHB depolymerase family  38.05 
 
 
338 aa  152  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.660761  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4281  PHB depolymerase family esterase  40.93 
 
 
403 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  37.23 
 
 
406 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5706  PHB depolymerase family esterase  39.58 
 
 
438 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137114  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1484  esterase, PHB depolymerase family  40.88 
 
 
425 aa  150  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220911  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  31.03 
 
 
544 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1761  esterase, PHB depolymerase family  39.42 
 
 
422 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1483  PHB depolymerase family esterase  39.42 
 
 
422 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0485134  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3819  PHB depolymerase family esterase  38.55 
 
 
419 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4127  esterase, PHB depolymerase family  37.82 
 
 
419 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3867  esterase, PHB depolymerase  35.48 
 
 
404 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.10201  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4102  hypothetical protein  38.6 
 
 
385 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.943667 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6025  PHB depolymerase family esterase  39.57 
 
 
416 aa  143  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950963  normal  0.103792 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  33.15 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4273  esterase, PHB depolymerase  36.9 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4615  PHB depolymerase family esterase  50 
 
 
359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5379  putative esterase, PHB depolymerase  35.59 
 
 
411 aa  136  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.449035 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  30.99 
 
 
374 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  29.91 
 
 
334 aa  133  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1984  esterase, PHB depolymerase family  34.64 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000502853  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  31.76 
 
 
343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  32.35 
 
 
395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1658  hypothetical protein  37.23 
 
 
342 aa  126  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  32.69 
 
 
450 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  34.55 
 
 
419 aa  123  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  37.86 
 
 
368 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  37.13 
 
 
417 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2820  esterase, PHB depolymerase family  31.4 
 
 
352 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000611867  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0209  esterase, PHB depolymerase family  35.35 
 
 
342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  37.17 
 
 
394 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  32.33 
 
 
363 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  36.98 
 
 
317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31730  esterase, PHB depolymerase family  32.05 
 
 
331 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  34.27 
 
 
392 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  29.44 
 
 
366 aa  109  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0935  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  31.97 
 
 
343 aa  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  33.76 
 
 
414 aa  107  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  31.75 
 
 
529 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  32.18 
 
 
392 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1658  esterase, PHB depolymerase family  33.47 
 
 
363 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.044626  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  32.62 
 
 
381 aa  99  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3146  PHB depolymerase family esterase  31.91 
 
 
308 aa  95.5  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616621  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3195  PHB depolymerase family esterase  31.91 
 
 
308 aa  95.5  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0520  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  29.32 
 
 
315 aa  86.3  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.213794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>