More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0780 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  100 
 
 		 436 aa  893    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  53.06 
 
 		 442 aa  456  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  53.63 
 
 		 423 aa  418  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  55.22 
 
 		 422 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  49.26 
 
 		 432 aa  395  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  47.63 
 
 		 518 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  59.64 
 
 		 451 aa  332  8e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  48.11 
 
 		 656 aa  296  3e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  47.7 
 
 		 489 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  41.3 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  39.72 
 
 		 450 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  35.6 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  38.1 
 
 		 414 aa  189  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06093  Acetylxylan esterase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS5]  35.5 
 
 		 306 aa  186  6e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00247339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  36.81 
 
 		 417 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0371  esterase, PHB depolymerase  33.33 
 
 		 394 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31730  esterase, PHB depolymerase family  36.16 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  33.97 
 
 		 392 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  31.56 
 
 		 392 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  33.09 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  30.14 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  32.44 
 
 		 343 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  32.85 
 
 		 529 aa  150  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1463  esterase, PHB depolymerase family  32.95 
 
 		 363 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0308241  normal  0.241375 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9052  polyhydroxybutyrate depolymerase  30.94 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4301  PHB depolymerase family esterase  31.48 
 
 		 368 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  60.78 
 
 		 393 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  47.16 
 
 		 688 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  59.26 
 
 		 494 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  51.72 
 
 		 727 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  47.45 
 
 		 846 aa  126  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  60 
 
 		 596 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1658  esterase, PHB depolymerase family  31.7 
 
 		 363 aa  123  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.044626  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3195  PHB depolymerase family esterase  30.22 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3146  PHB depolymerase family esterase  30.22 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.616621  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1658  hypothetical protein  31.12 
 
 		 342 aa  121  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  50.78 
 
 		 609 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  54.81 
 
 		 628 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  55 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  55 
 
 		 420 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  48.85 
 
 		 794 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  54 
 
 		 590 aa  116  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  56.73 
 
 		 925 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  52.48 
 
 		 778 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  52 
 
 		 588 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  56.44 
 
 		 743 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  58.42 
 
 		 488 aa  114  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  50 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0935  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  27.95 
 
 		 343 aa  110  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  51.49 
 
 		 984 aa  110  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  51.92 
 
 		 854 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  60.47 
 
 		 460 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  53.47 
 
 		 681 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  60.87 
 
 		 1209 aa  109  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  60.87 
 
 		 763 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  54.9 
 
 		 608 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  48.54 
 
 		 775 aa  106  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36.09 
 
 		 998 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  46.28 
 
 		 1007 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  46.97 
 
 		 942 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  47.69 
 
 		 812 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  44.8 
 
 		 486 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  49 
 
 		 623 aa  103  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  45.83 
 
 		 773 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  47.17 
 
 		 913 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  52.04 
 
 		 938 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  48.51 
 
 		 935 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  49 
 
 		 842 aa  102  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  55.32 
 
 		 562 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  46.15 
 
 		 934 aa  102  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  41.96 
 
 		 880 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  56.52 
 
 		 403 aa  101  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  44.86 
 
 		 436 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  53.26 
 
 		 743 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  47.62 
 
 		 785 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  42.28 
 
 		 543 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 894 aa  99  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  48 
 
 		 966 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  48.31 
 
 		 499 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  61.25 
 
 		 1137 aa  98.2  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  50.52 
 
 		 485 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3536  cellulose-binding family II  54 
 
 		 389 aa  97.1  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0870492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  44.76 
 
 		 533 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  42.45 
 
 		 669 aa  97.1  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  48.31 
 
 		 474 aa  97.1  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  48.51 
 
 		 979 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  45.87 
 
 		 744 aa  96.7  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  58.14 
 
 		 1298 aa  96.7  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  44.55 
 
 		 1128 aa  96.7  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  43.81 
 
 		 851 aa  96.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  45 
 
 		 767 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  43.56 
 
 		 894 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  41.12 
 
 		 864 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  42.72 
 
 		 990 aa  94.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  45.54 
 
 		 633 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0520  putative polyhydroxyalkanoate depolymerase  29.54 
 
 		 315 aa  94.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.213794 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  46 
 
 		 488 aa  94.7  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  40.37 
 
 		 875 aa  93.6  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  46 
 
 		 580 aa  93.6  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  42.28 
 
 		 681 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>