218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3714 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  100 
 
 		 1771 aa  3548    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  36.52 
 
 		 1011 aa  335  5e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1501  peptidase-like  32.11 
 
 		 1376 aa  160  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0114  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4326  hypothetical protein  28.61 
 
 		 511 aa  155  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  28.64 
 
 		 1057 aa  149  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3866  hypothetical protein  29.06 
 
 		 535 aa  149  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.991992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  35.34 
 
 		 1107 aa  143  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  32.36 
 
 		 1152 aa  139  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.31 
 
 		 1217 aa  134  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  37.1 
 
 		 1565 aa  134  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.03 
 
 		 1212 aa  129  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4605  hypothetical protein  27.48 
 
 		 571 aa  127  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.723744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3849  Parallel beta-helix repeat protein  27.71 
 
 		 526 aa  125  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  29.78 
 
 		 1750 aa  112  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  36.04 
 
 		 3197 aa  103  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6203  phospholipase/Carboxylesterase  31.2 
 
 		 292 aa  103  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0152  PKD  28.19 
 
 		 506 aa  103  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000535415  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  31.25 
 
 		 276 aa  102  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 635 aa  101  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  40.21 
 
 		 816 aa  100  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  29.62 
 
 		 268 aa  100  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  34.6 
 
 		 3197 aa  99  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2204  PKD  33.9 
 
 		 634 aa  98.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  25.87 
 
 		 3602 aa  97.8  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  33.56 
 
 		 635 aa  93.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  29.08 
 
 		 1597 aa  93.2  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  36.24 
 
 		 833 aa  92.8  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  38.17 
 
 		 623 aa  92  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  32.77 
 
 		 855 aa  91.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  40.11 
 
 		 1022 aa  91.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  36.63 
 
 		 848 aa  90.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  30.75 
 
 		 848 aa  90.5  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  33.19 
 
 		 260 aa  89.4  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  28.07 
 
 		 1204 aa  88.6  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.87 
 
 		 994 aa  87.8  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  41.5 
 
 		 1150 aa  85.9  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  38.61 
 
 		 868 aa  85.5  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3696  peptidase-like protein  29.28 
 
 		 261 aa  84.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.469025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3522  phospholipase/carboxylesterase  30.84 
 
 		 237 aa  84.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  29.69 
 
 		 1879 aa  82.4  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  27.98 
 
 		 734 aa  82.4  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  26.79 
 
 		 1916 aa  82.4  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  30.17 
 
 		 253 aa  81.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  31.1 
 
 		 1406 aa  82  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  31.75 
 
 		 243 aa  81.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 863 aa  81.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  37.86 
 
 		 868 aa  81.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  26.26 
 
 		 3927 aa  80.5  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  38.46 
 
 		 868 aa  79  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  35.61 
 
 		 873 aa  79  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  38.69 
 
 		 869 aa  78.6  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  53.68 
 
 		 712 aa  77.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0088  phospholipase/Carboxylesterase  26.6 
 
 		 255 aa  77.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  25.16 
 
 		 1969 aa  77  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  34.45 
 
 		 972 aa  77  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  27.95 
 
 		 468 aa  76.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  34.02 
 
 		 969 aa  76.3  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  33.5 
 
 		 868 aa  75.5  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  33.5 
 
 		 868 aa  75.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  35.29 
 
 		 792 aa  75.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  33.5 
 
 		 868 aa  75.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.16 
 
 		 850 aa  73.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  32.99 
 
 		 867 aa  73.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  29.44 
 
 		 985 aa  73.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  28.29 
 
 		 4120 aa  73.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3641  phospholipase/carboxylesterase  27.54 
 
 		 257 aa  72.8  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  26.27 
 
 		 4953 aa  72.8  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2487  parallel beta-helix repeat protein  25.77 
 
 		 462 aa  72  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.67625 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  26.4 
 
 		 277 aa  71.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  28.82 
 
 		 1268 aa  71.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  28.46 
 
 		 563 aa  71.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3746  peptidase-like  23.46 
 
 		 325 aa  70.5  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  30.34 
 
 		 1269 aa  69.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2615  hypothetical protein  27.56 
 
 		 470 aa  69.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  26.96 
 
 		 1146 aa  69.3  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  26.98 
 
 		 1081 aa  69.3  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  40.15 
 
 		 1418 aa  68.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  26.67 
 
 		 517 aa  68.6  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  23.81 
 
 		 218 aa  67.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  31.06 
 
 		 1302 aa  67  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  29.26 
 
 		 417 aa  67  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0514  phospholipase/carboxylesterase  27.88 
 
 		 249 aa  66.6  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.463342  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  27.89 
 
 		 1269 aa  66.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3911  peptidase-like protein  31.12 
 
 		 286 aa  65.9  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.363292  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  29.26 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  27.92 
 
 		 2066 aa  65.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2764  PKD domain containing protein  34.1 
 
 		 1084 aa  65.5  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4415  peptidase-like protein  25.94 
 
 		 384 aa  64.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  26.16 
 
 		 5337 aa  63.9  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  25.71 
 
 		 217 aa  63.9  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  28.65 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  28.81 
 
 		 706 aa  62.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  29.75 
 
 		 1987 aa  62.4  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  28.02 
 
 		 412 aa  62  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  41.84 
 
 		 884 aa  61.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3463  parallel beta-helix repeat protein  22.92 
 
 		 465 aa  61.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1180  hypothetical protein  37.18 
 
 		 902 aa  61.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  25.69 
 
 		 1607 aa  60.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  28.97 
 
 		 325 aa  60.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2052  Ig family protein  28.92 
 
 		 2506 aa  61.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.504555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>