More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0409 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  45.11 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02216  phospholipase/carboxylesterase superfamily  42.86 
 
 		 245 aa  205  8e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.195432  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  45.78 
 
 		 217 aa  189  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0944  hypothetical protein  43.66 
 
 		 265 aa  181  8.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992264  normal  0.367367 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  41.78 
 
 		 218 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  37.9 
 
 		 417 aa  163  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  37.5 
 
 		 417 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  39.82 
 
 		 253 aa  155  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  37.5 
 
 		 276 aa  145  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6506  phospholipase/Carboxylesterase  33.45 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0298565  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  35.51 
 
 		 405 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  38.03 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  33.2 
 
 		 886 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0514  phospholipase/carboxylesterase  35.34 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.463342  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3641  phospholipase/carboxylesterase  32.39 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  29.54 
 
 		 468 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  38.03 
 
 		 260 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0088  phospholipase/Carboxylesterase  29.18 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  31.71 
 
 		 412 aa  124  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1124  phospholipase/Carboxylesterase  31.95 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2160  peptidase-like protein  30.33 
 
 		 474 aa  122  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.762197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4144  phospholipase/carboxylesterase  32.57 
 
 		 217 aa  109  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.111836 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  32.74 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3742  peptidase-like protein  28.09 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  28.76 
 
 		 563 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3522  phospholipase/carboxylesterase  27.76 
 
 		 237 aa  95.1  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  28.89 
 
 		 2334 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3037  hypothetical protein  32.58 
 
 		 850 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5819  hypothetical protein  35.77 
 
 		 816 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438939  decreased coverage  0.00192823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0548  phospholipase/Carboxylesterase  32.46 
 
 		 358 aa  82  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185297  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  32.02 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1603  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.53 
 
 		 328 aa  79  0.00000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  29.82 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3746  peptidase-like  33.77 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1106  hypothetical protein  28.45 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6203  phospholipase/Carboxylesterase  27.8 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1229  hypothetical protein  35.92 
 
 		 816 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737589  hitchhiker  0.00225369 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4415  peptidase-like protein  31.78 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  26.4 
 
 		 1771 aa  72.8  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2978  hypothetical protein  26.05 
 
 		 777 aa  70.1  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  30.41 
 
 		 372 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  29.91 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2781  hypothetical protein  34.53 
 
 		 796 aa  65.1  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216427  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0185  hypothetical protein  28.06 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000162284  hitchhiker  0.000128495 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0883  hypothetical protein  30.32 
 
 		 682 aa  63.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.888299  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1987  hypothetical protein  28.04 
 
 		 700 aa  63.5  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0535  esterase, PHB depolymerase family  29.59 
 
 		 338 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.660761  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  30.05 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  28.71 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  32 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  30.04 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0092  phospholipase/Carboxylesterase  24.78 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.898581  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  28.85 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  24.15 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  30.82 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  27.37 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3767  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.9 
 
 		 680 aa  59.3  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0780  hypothetical protein  25 
 
 		 752 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.893714 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0784  hypothetical protein  25 
 
 		 752 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0799  hypothetical protein  25 
 
 		 752 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.666809  normal  0.067283 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  30.48 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  27.01 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0790  hypothetical protein  26.9 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  29.17 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0718  hypothetical protein  26.9 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08036  hypothetical protein  22.77 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119993  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.11 
 
 		 688 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  27.69 
 
 		 374 aa  57  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2193  hypothetical protein  29.49 
 
 		 674 aa  56.6  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1578  putative esterase  27.62 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.469655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.36 
 
 		 695 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  26.64 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.03 
 
 		 642 aa  55.8  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35564  predicted protein  36.44 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  31.37 
 
 		 634 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.11 
 
 		 619 aa  55.8  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  27.83 
 
 		 406 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  26.42 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1859  putative esterase  28.57 
 
 		 383 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.54 
 
 		 429 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  30.4 
 
 		 645 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1449  phospholipase/Carboxylesterase  28.26 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.189744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.8 
 
 		 631 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4614  phospholipase/Carboxylesterase  23.79 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0498  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.18 
 
 		 575 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0154886  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0897  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.8 
 
 		 600 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.835581  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.71 
 
 		 594 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1251  putative esterase  25.32 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1754  hypothetical protein  24.26 
 
 		 841 aa  53.9  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2447  phospholipase/carboxylesterase  28.37 
 
 		 214 aa  53.9  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252523  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3798  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.78 
 
 		 634 aa  53.9  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  23.22 
 
 		 544 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  30.43 
 
 		 369 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.79 
 
 		 597 aa  53.5  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000276973  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4281  PHB depolymerase family esterase  26.86 
 
 		 403 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43308  predicted protein  27.91 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2909  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28 
 
 		 735 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.4 
 
 		 607 aa  53.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530992  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43004  predicted protein  27.91 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0939164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>