42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3037 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1229  hypothetical protein  53.52 
 
 
816 aa  871    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737589  hitchhiker  0.00225369 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5819  hypothetical protein  53.51 
 
 
816 aa  891    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438939  decreased coverage  0.00192823 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3037  hypothetical protein  100 
 
 
850 aa  1753    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  25 
 
 
563 aa  97.4  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  32.58 
 
 
277 aa  87.8  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04286  conserved hypothetical protein  22.11 
 
 
861 aa  86.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.207639 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  33.77 
 
 
217 aa  75.9  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1987  hypothetical protein  20.75 
 
 
700 aa  75.1  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02216  phospholipase/carboxylesterase superfamily  27.43 
 
 
245 aa  66.6  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.195432  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  29.41 
 
 
218 aa  66.2  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  26.71 
 
 
886 aa  62.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0780  hypothetical protein  33.04 
 
 
752 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.893714 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0799  hypothetical protein  32.17 
 
 
752 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.666809  normal  0.067283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0784  hypothetical protein  32.17 
 
 
752 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0883  hypothetical protein  43.64 
 
 
682 aa  55.1  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.888299  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  27.33 
 
 
261 aa  54.3  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25940  hypothetical protein  32.28 
 
 
214 aa  53.9  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.375139 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  24.41 
 
 
253 aa  53.9  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  25.11 
 
 
268 aa  53.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  28.47 
 
 
417 aa  52  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  27.74 
 
 
417 aa  52  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2781  hypothetical protein  34.52 
 
 
796 aa  51.6  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216427  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2978  hypothetical protein  22.03 
 
 
777 aa  50.8  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3746  peptidase-like  39.06 
 
 
325 aa  50.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  27.41 
 
 
276 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0514  phospholipase/carboxylesterase  30.16 
 
 
249 aa  49.3  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.463342  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  27.07 
 
 
645 aa  48.5  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2160  peptidase-like protein  25.49 
 
 
474 aa  47.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.762197 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.71 
 
 
688 aa  47.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  28.19 
 
 
795 aa  46.6  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  36.25 
 
 
243 aa  47  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.32 
 
 
645 aa  47  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  31.15 
 
 
1002 aa  47  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.63 
 
 
645 aa  46.2  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  27.74 
 
 
405 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.63 
 
 
645 aa  45.8  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3742  peptidase-like protein  24.84 
 
 
326 aa  45.8  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.63 
 
 
645 aa  45.8  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7674  putative polyhydroxy-alkanoate/butyrate(PHA/PHB) depolymerase  31 
 
 
529 aa  44.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  45.76 
 
 
260 aa  44.7  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2890  ATPase  31.25 
 
 
274 aa  44.7  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.418152  hitchhiker  0.00752314 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  26.75 
 
 
334 aa  44.3  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>