71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_25940 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_25940  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  436  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.375139 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  42.5 
 
 
281 aa  161  5.0000000000000005e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  29.33 
 
 
268 aa  91.7  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  32.14 
 
 
258 aa  91.3  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.29 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  28.11 
 
 
248 aa  75.1  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  27.14 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  26.63 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  29.44 
 
 
274 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  30.58 
 
 
269 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  26.78 
 
 
246 aa  58.9  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  22.61 
 
 
274 aa  58.5  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
273 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  27.03 
 
 
274 aa  56.6  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  22.46 
 
 
257 aa  55.1  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3037  hypothetical protein  32.28 
 
 
850 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  26.56 
 
 
259 aa  53.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  23.32 
 
 
255 aa  52  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  30 
 
 
248 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  26.6 
 
 
276 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  26.6 
 
 
276 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3763  peptidase S15  28.92 
 
 
667 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  27.64 
 
 
252 aa  48.5  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3036  hypothetical protein  28.92 
 
 
667 aa  48.5  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  25.96 
 
 
264 aa  48.1  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1680  dipeptidyl-peptidase  32.56 
 
 
670 aa  48.1  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2060  dipeptidyl-peptidase  32.56 
 
 
670 aa  47.8  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 
265 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4571  PGAP1 family protein  25.56 
 
 
260 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.28491 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  31.12 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  31.12 
 
 
254 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  33.64 
 
 
690 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0413  peptidase S15  37.21 
 
 
690 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.928819 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  24.86 
 
 
311 aa  47  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  30.32 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 
305 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5051  PGAP1 family protein  27.72 
 
 
259 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  29.34 
 
 
253 aa  46.6  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  35.23 
 
 
316 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3196  PGAP1 family protein  27.72 
 
 
259 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 
374 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  31.82 
 
 
668 aa  45.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  28.34 
 
 
580 aa  44.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  32.9 
 
 
239 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  31.25 
 
 
249 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  29.35 
 
 
316 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  25 
 
 
294 aa  44.3  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03205  Alpha/beta superfamily hydrolase  23.75 
 
 
281 aa  43.9  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  32.61 
 
 
402 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2823  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  29.25 
 
 
298 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.628077  hitchhiker  0.0000422692 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  35 
 
 
402 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2876  hydrolase family protein  34.69 
 
 
335 aa  43.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.720611  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2224  hypothetical protein  29.11 
 
 
267 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
297 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0074  hypothetical protein  26.74 
 
 
244 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4098  protein of unknown function UPF0227  28.8 
 
 
222 aa  42.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0478  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  26.95 
 
 
388 aa  42.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0525  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
289 aa  42.4  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.720757 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  28.37 
 
 
677 aa  42.4  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1534  alpha/beta hydrolase  28.57 
 
 
294 aa  42.4  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  33.33 
 
 
674 aa  42.4  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2979  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  33.33 
 
 
418 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  38.16 
 
 
295 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  32.04 
 
 
678 aa  42.4  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1475  hydrolase family protein  32.93 
 
 
335 aa  42.4  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2842  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  33.33 
 
 
419 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1669  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  28.87 
 
 
331 aa  42  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133823  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  29.35 
 
 
254 aa  42  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3783  hypothetical protein  29.87 
 
 
354 aa  41.6  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  32.35 
 
 
674 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  44.44 
 
 
270 aa  41.2  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>