161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2890 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2890  ATPase  100 
 
 
274 aa  572  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.418152  hitchhiker  0.00752314 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2308  putative esterase  51.13 
 
 
270 aa  291  9e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0649  putative esterase  39.04 
 
 
268 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0397008  normal  0.263924 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2341  putative esterase  28.63 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416263  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1530  putative esterase  27.78 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547916  normal  0.0514313 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0957  putative esterase  26.38 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1255  putative esterase  27.31 
 
 
301 aa  96.3  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.469623 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0523  putative esterase  27.16 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00718904  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4526  putative esterase  26.67 
 
 
286 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5051  putative esterase  26.67 
 
 
282 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3253  putative esterase  26.02 
 
 
295 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5115  putative esterase  26.02 
 
 
295 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5166  putative esterase  26.39 
 
 
295 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0186  putative esterase  27.35 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1260  putative esterase  28.63 
 
 
265 aa  90.5  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3261  putative esterase  32.32 
 
 
199 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.119726  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3530  putative esterase  25.21 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4144  putative esterase  26.67 
 
 
296 aa  87  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6266  putative esterase  27.35 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5901  putative esterase  25.94 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  27.01 
 
 
640 aa  83.6  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1987  putative esterase  26.11 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3614  putative esterase  25.38 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0970  putative esterase  25.95 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1536  putative esterase  28 
 
 
341 aa  82  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.88087  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4810  putative esterase  24.8 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1043  putative esterase  25.85 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2109  putative esterase  25.94 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0655634  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  27.07 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5713  putative esterase  25.22 
 
 
272 aa  77  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129647  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0708  putative esterase  24.59 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4242  putative esterase  22.27 
 
 
638 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.630883  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1883  putative esterase  24.47 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  26.07 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1940  esterase  27.68 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000237899  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0345  putative esterase  24.79 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02190  predicted esterase  25.34 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2825  putative esterase  24.02 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0297  putative esterase  24.82 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.203768  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1101  putative esterase  30.07 
 
 
341 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1192  putative esterase  29.41 
 
 
343 aa  68.9  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.477503  normal  0.314946 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1582  putative esterase  23.91 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3878  putative esterase  21.75 
 
 
560 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0986  putative esterase  29.59 
 
 
335 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.903435  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1407  putative esterase  25.32 
 
 
640 aa  66.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00376031  normal  0.509577 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1774  putative esterase  25.65 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000148005  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3361  putative esterase  24.41 
 
 
369 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.151349 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1371  putative esterase  23.64 
 
 
254 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000125757  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1221  enterochelin esterase and related enzyme  24.1 
 
 
341 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.416855 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1483  esterase  27.51 
 
 
263 aa  62.8  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3836  putative esterase  30.3 
 
 
332 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3201  putative esterase  24.58 
 
 
312 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1644  putative esterase  26.64 
 
 
328 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10530  hypothetical protein  27.6 
 
 
300 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2723  putative esterase  22.17 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2354  tributyrin esterase EstA, putative  22.78 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3780  putative esterase  29.55 
 
 
332 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0425  esterase, putative  21.74 
 
 
256 aa  58.9  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.2797 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0425  putative esterase  28.15 
 
 
337 aa  58.9  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2653  putative esterase  23.5 
 
 
253 aa  58.9  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2709  putative esterase  23.5 
 
 
253 aa  58.9  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2245  tributyrin esterase EstA, putative  20.59 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1256  putative esterase  28.09 
 
 
375 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10789  hypothetical protein  28.99 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  24.62 
 
 
837 aa  56.6  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1289  putative esterase  22.17 
 
 
290 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1557  esterase  22.46 
 
 
264 aa  55.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0108  putative esterase  22.05 
 
 
369 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4946  putative esterase  26.55 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580943  normal  0.169227 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0835  putative esterase  20.49 
 
 
401 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2544  putative esterase  22.17 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110736  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1456  esterase, putative  23.38 
 
 
281 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0267  putative esterase  22.17 
 
 
281 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0537  putative esterase  22.17 
 
 
281 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1370  putative esterase  22.17 
 
 
281 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1290  putative esterase  22.17 
 
 
281 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1030  putative esterase  22.17 
 
 
281 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1012  hypothetical protein  27.92 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0439007  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1031  hypothetical protein  27.92 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4037  putative esterase  23.48 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.205002 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3922  putative esterase  28.03 
 
 
333 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.079767  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1578  putative esterase  21.69 
 
 
295 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.469655 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1440  putative esterase  22.55 
 
 
316 aa  53.9  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.532369  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1701  hypothetical protein  25.22 
 
 
291 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.202768  normal  0.542752 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1996  carboxylesterase  27.21 
 
 
296 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0583  S-formylglutathione hydrolase  28.75 
 
 
284 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.952467 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1254  putative esterase  24.89 
 
 
385 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2411  putative esterase  25 
 
 
368 aa  53.1  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000101635  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3759  putative esterase  22.66 
 
 
317 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4609  putative esterase  22.66 
 
 
317 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.006335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2656  putative esterase  24.7 
 
 
299 aa  52.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5695  putative esterase  22.66 
 
 
317 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712363 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37670  predicted esterase  22.08 
 
 
258 aa  52.8  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4136  putative esterase  24.34 
 
 
327 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1185  tributyrin esterase  22.89 
 
 
262 aa  52  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4097  putative esterase  24.34 
 
 
327 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1251  putative esterase  25.22 
 
 
341 aa  50.8  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4570  putative esterase  31.43 
 
 
279 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4658  putative esterase  31.43 
 
 
279 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4953  putative esterase  31.43 
 
 
279 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.154842 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>