218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0708 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0708  putative esterase  100 
 
 
285 aa  585  1e-166  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1407  putative esterase  59.71 
 
 
640 aa  328  7e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00376031  normal  0.509577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4242  putative esterase  57.61 
 
 
638 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.630883  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3878  putative esterase  58.14 
 
 
560 aa  303  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0345  putative esterase  55.38 
 
 
305 aa  282  5.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  46.15 
 
 
490 aa  265  7e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  49.63 
 
 
837 aa  260  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  47.31 
 
 
501 aa  256  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1408  putative esterase  37.4 
 
 
388 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0188455  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3245  putative esterase  38.4 
 
 
392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.458402  normal  0.0540976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0108  putative esterase  39.11 
 
 
369 aa  166  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1859  putative esterase  38.87 
 
 
383 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1414  putative esterase  38.15 
 
 
375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0835  putative esterase  36.27 
 
 
401 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1256  putative esterase  37.45 
 
 
375 aa  158  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.645173 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03603  predicted xylanase  35.19 
 
 
398 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03547  hypothetical protein  35.19 
 
 
398 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4248  glycoside hydrolase family 13 domain protein  35.19 
 
 
389 aa  156  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4275  glycoside hydrolase family 13 protein  35.19 
 
 
389 aa  156  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4228  putative esterase  35.19 
 
 
364 aa  156  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3222  putative esterase  36.61 
 
 
376 aa  153  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.349427  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1254  putative esterase  35.41 
 
 
385 aa  152  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1707  putative esterase  33.58 
 
 
394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1670  putative esterase  35.97 
 
 
395 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0331  putative esterase  35.83 
 
 
392 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0101321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1412  putative esterase  36.12 
 
 
359 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2433  glycoside hydrolase family 13 domain protein  33.82 
 
 
388 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1411  putative esterase  35.77 
 
 
372 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474659  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2738  glycoside hydrolase family 13 domain protein  34.23 
 
 
394 aa  136  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1413  putative esterase  35.17 
 
 
388 aa  135  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0091  putative esterase  33.2 
 
 
882 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3614  putative esterase  29.74 
 
 
315 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  29.55 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32905  hypothetical protein  29.01 
 
 
526 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.954654  hitchhiker  0.000184596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2799  hypothetical protein  29.01 
 
 
526 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  31.73 
 
 
640 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1043  putative esterase  29.84 
 
 
274 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  34.52 
 
 
276 aa  98.2  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6266  putative esterase  26.98 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5713  putative esterase  25.78 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129647  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2656  putative esterase  27.68 
 
 
299 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3201  putative esterase  27.97 
 
 
312 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2544  putative esterase  31.47 
 
 
290 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110736  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1289  putative esterase  31.47 
 
 
290 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0267  putative esterase  31.47 
 
 
281 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0537  putative esterase  31.47 
 
 
281 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1370  putative esterase  31.47 
 
 
281 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1290  putative esterase  31.47 
 
 
281 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1030  putative esterase  31.47 
 
 
281 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1456  esterase, putative  31.03 
 
 
281 aa  91.3  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0297  putative esterase  35.67 
 
 
342 aa  90.5  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.203768  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4037  putative esterase  28.35 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.205002 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1987  putative esterase  28.86 
 
 
270 aa  89.4  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1232  putative esterase  29.36 
 
 
311 aa  89  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417705  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3759  putative esterase  30.21 
 
 
317 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5695  putative esterase  30.21 
 
 
317 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712363 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4609  putative esterase  30.21 
 
 
317 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.006335 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2825  putative esterase  29.79 
 
 
319 aa  85.9  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4497  putative esterase  29.36 
 
 
314 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0649  putative esterase  25.1 
 
 
268 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0397008  normal  0.263924 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4039  putative esterase  28.94 
 
 
314 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4097  putative esterase  23.25 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4136  putative esterase  23.25 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16290  enterochelin esterase-like enzyme  38.28 
 
 
430 aa  81.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521339  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5901  putative esterase  27.23 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5166  putative esterase  27.09 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0523  putative esterase  26.23 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00718904  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1883  putative esterase  24.18 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2341  putative esterase  26.52 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416263  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4946  putative esterase  27.71 
 
 
295 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580943  normal  0.169227 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3253  putative esterase  26.69 
 
 
295 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5115  putative esterase  26.69 
 
 
295 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4810  putative esterase  26.09 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1701  hypothetical protein  25.7 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.202768  normal  0.542752 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3463  Carbohydrate-binding family 9  28.57 
 
 
691 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0207696  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1255  putative esterase  26.82 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.469623 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2890  ATPase  24.59 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.418152  hitchhiker  0.00752314 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5051  putative esterase  27.03 
 
 
282 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4526  putative esterase  27.03 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1536  putative esterase  33.79 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.88087  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  31.94 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1007  putative esterase  26.46 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2411  putative esterase  29.78 
 
 
368 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000101635  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0978  putative esterase  26.46 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0767  putative esterase  26.79 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.313177  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4144  putative esterase  26.04 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3530  putative esterase  26.47 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1741  esterase/lipase-like protein  26.24 
 
 
631 aa  72.4  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0611967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1101  putative esterase  29.09 
 
 
341 aa  72  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1251  putative esterase  29.56 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2109  putative esterase  27.66 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0655634  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2308  putative esterase  23.14 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0970  putative esterase  26.72 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2504  putative esterase  28.5 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.807754  normal  0.0850862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3361  putative esterase  30.86 
 
 
369 aa  69.3  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.151349 
 
 
-
 
NC_002950  PG0425  esterase, putative  26.29 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.2797 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0083  putative esterase  27.57 
 
 
379 aa  68.9  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1112  putative esterase  27.68 
 
 
409 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291043  normal  0.610364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0667  putative esterase  25.3 
 
 
320 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1774  putative esterase  27.16 
 
 
267 aa  67  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000148005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>