139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2433 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2738  glycoside hydrolase family 13 domain protein  94.68 
 
 		 394 aa  742    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2433  glycoside hydrolase family 13 domain protein  100 
 
 		 388 aa  803    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1670  putative esterase  74.26 
 
 		 395 aa  589  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1707  putative esterase  71.32 
 
 		 394 aa  585  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4275  glycoside hydrolase family 13 protein  71.61 
 
 		 389 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03603  predicted xylanase  71.36 
 
 		 398 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4248  glycoside hydrolase family 13 domain protein  71.36 
 
 		 389 aa  558  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03547  hypothetical protein  71.36 
 
 		 398 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4228  putative esterase  73.77 
 
 		 364 aa  548  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1256  putative esterase  33.08 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3222  putative esterase  32.59 
 
 		 376 aa  173  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.349427  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1254  putative esterase  31.74 
 
 		 385 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1407  putative esterase  30.89 
 
 		 640 aa  170  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00376031  normal  0.509577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1859  putative esterase  31.74 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4242  putative esterase  29.16 
 
 		 638 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.630883  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1408  putative esterase  28.68 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0188455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0331  putative esterase  30.71 
 
 		 392 aa  159  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0835  putative esterase  31.55 
 
 		 401 aa  155  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1412  putative esterase  32.07 
 
 		 359 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0108  putative esterase  32.4 
 
 		 369 aa  152  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1414  putative esterase  31.07 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1413  putative esterase  31.39 
 
 		 388 aa  149  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0708  putative esterase  33.82 
 
 		 285 aa  140  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3245  putative esterase  29.07 
 
 		 392 aa  136  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.458402  normal  0.0540976 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3878  putative esterase  31.75 
 
 		 560 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0091  putative esterase  28.07 
 
 		 882 aa  122  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  31.46 
 
 		 837 aa  105  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  30.95 
 
 		 501 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0345  putative esterase  29.67 
 
 		 305 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1411  putative esterase  27.01 
 
 		 372 aa  99.8  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  27.78 
 
 		 490 aa  97.8  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  30.92 
 
 		 640 aa  84  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  24.91 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  28.57 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0425  putative esterase  32.39 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32905  hypothetical protein  27.8 
 
 		 526 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.954654  hitchhiker  0.000184596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2799  hypothetical protein  27.41 
 
 		 526 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1536  putative esterase  30 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.88087  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3614  putative esterase  26.02 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1232  putative esterase  29.29 
 
 		 311 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3759  putative esterase  29.29 
 
 		 317 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4609  putative esterase  29.29 
 
 		 317 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.006335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5695  putative esterase  29.29 
 
 		 317 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712363 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4037  putative esterase  27.86 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.205002 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4497  putative esterase  27.86 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4946  putative esterase  26.16 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580943  normal  0.169227 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1456  esterase, putative  27.7 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1701  hypothetical protein  22.62 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.202768  normal  0.542752 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1289  putative esterase  28.87 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2544  putative esterase  28.87 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110736  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4039  putative esterase  27.14 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0267  putative esterase  28.87 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0537  putative esterase  28.87 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1370  putative esterase  28.87 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1290  putative esterase  28.87 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1030  putative esterase  28.87 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1101  putative esterase  30.41 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0297  putative esterase  27.98 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.203768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0939  hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  26.09 
 
 		 478 aa  66.2  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5724  putative esterase  27.68 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.818383  normal  0.882563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2411  putative esterase  30.26 
 
 		 368 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000101635  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3899  putative esterase  30.34 
 
 		 333 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0419016 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1192  putative esterase  30.91 
 
 		 343 aa  62  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.477503  normal  0.314946 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3922  putative esterase  27.27 
 
 		 333 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.079767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2669  Carbohydrate-binding family 9  26.7 
 
 		 535 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2504  putative esterase  29.88 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.807754  normal  0.0850862 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0594  putative esterase  24.14 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0986  putative esterase  28.05 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.903435  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1221  enterochelin esterase and related enzyme  29.38 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.416855 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3780  putative esterase  27.27 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4097  putative esterase  22.91 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4136  putative esterase  22.91 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3836  putative esterase  26.7 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  29.07 
 
 		 708 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1987  putative esterase  24.23 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1473  putative esterase  23.3 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2656  putative esterase  24.2 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0954  putative esterase  29.68 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2449  putative esterase  25.3 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.922476  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1478  putative esterase  24.46 
 
 		 355 aa  57  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.500131  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3201  putative esterase  24.81 
 
 		 312 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1043  putative esterase  26.4 
 
 		 274 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1351  putative esterase  25.12 
 
 		 298 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3861  enterochelin esterase and related enzymes-like  25.53 
 
 		 352 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0524  putative esterase  25.99 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.629135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2708  hypothetical protein  23.29 
 
 		 541 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000932167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3361  putative esterase  24.17 
 
 		 369 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.151349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5713  putative esterase  23.1 
 
 		 272 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0785  enterochelin esterase and related enzymes  24.67 
 
 		 336 aa  53.5  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00898852  normal  0.0802904 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2744  putative esterase  25.86 
 
 		 366 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2825  putative esterase  32.31 
 
 		 319 aa  53.1  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6337  putative esterase  28.14 
 
 		 434 aa  53.5  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1594  putative esterase  22.69 
 
 		 409 aa  52.8  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48746  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1644  putative esterase  27.59 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0767  putative esterase  26.11 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.313177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3463  Carbohydrate-binding family 9  23.24 
 
 		 691 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0207696  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2509  esterase  24.1 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2470  esterase  24.1 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000007439  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2694  esterase  24.1 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.360793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3950  putative esterase  22.55 
 
 		 397 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.449201 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>