136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2744 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2744  putative esterase  100 
 
 
366 aa  727    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1546  putative esterase  68.25 
 
 
351 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828639  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0767  putative esterase  46.65 
 
 
395 aa  288  1e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.313177  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16290  enterochelin esterase-like enzyme  33.64 
 
 
430 aa  106  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521339  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2110  putative esterase  31.61 
 
 
410 aa  102  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.512527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3395  putative esterase  31.68 
 
 
434 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0186858  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3545  putative esterase  29.55 
 
 
446 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.290679 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3573  putative esterase  29.28 
 
 
432 aa  97.8  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.742612  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3331  putative esterase  26.61 
 
 
436 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0826062  normal  0.299687 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4184  putative esterase  25.55 
 
 
444 aa  92.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2999  putative esterase  29.12 
 
 
450 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2984  putative esterase  29.12 
 
 
449 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191096  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3028  putative esterase  29.12 
 
 
449 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352145  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  25.29 
 
 
276 aa  88.2  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4531  putative esterase  28.52 
 
 
440 aa  87  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.770584  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1365  putative esterase  29.43 
 
 
460 aa  86.7  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7948  putative esterase  30.42 
 
 
389 aa  86.3  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3201  putative esterase  24.67 
 
 
312 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2335  putative esterase  30.7 
 
 
436 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000261928 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3614  putative esterase  26.85 
 
 
315 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5166  putative esterase  32.1 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  25.3 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2602  putative esterase  31.58 
 
 
448 aa  79.7  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00037083  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3253  putative esterase  31.69 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5115  putative esterase  31.69 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6266  putative esterase  29.25 
 
 
276 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0079  putative esterase  34.58 
 
 
360 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11656  hypothetical protein  26.59 
 
 
489 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.46235 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1987  putative esterase  24.79 
 
 
270 aa  75.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0523  putative esterase  32.53 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00718904  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4810  putative esterase  27.66 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5713  putative esterase  30.4 
 
 
272 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129647  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5051  putative esterase  33.2 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5901  putative esterase  32.13 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4526  putative esterase  33.2 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1036  hypothetical protein  24.55 
 
 
459 aa  73.9  0.000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2341  putative esterase  27.02 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416263  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2656  putative esterase  26.03 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1536  putative esterase  35.98 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.88087  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  25.83 
 
 
837 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0978  putative esterase  25.55 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3364  putative esterase  29.73 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.403252 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1007  putative esterase  25.55 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0626  putative esterase  27.76 
 
 
374 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0835  putative esterase  26.02 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1289  putative esterase  28.93 
 
 
290 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2544  putative esterase  28.93 
 
 
290 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110736  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  27.55 
 
 
501 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1370  putative esterase  28.93 
 
 
281 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1254  putative esterase  25.51 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4497  putative esterase  27.92 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1232  putative esterase  28.75 
 
 
311 aa  67  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417705  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0267  putative esterase  28.93 
 
 
281 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0537  putative esterase  28.93 
 
 
281 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1290  putative esterase  28.93 
 
 
281 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1030  putative esterase  28.93 
 
 
281 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1456  esterase, putative  28.93 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3759  putative esterase  28.93 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4609  putative esterase  28.93 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.006335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5695  putative esterase  28.93 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712363 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0708  putative esterase  28.57 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4037  putative esterase  27.92 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.205002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4144  putative esterase  26.56 
 
 
296 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4039  putative esterase  27.5 
 
 
314 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1411  putative esterase  29.79 
 
 
372 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474659  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3530  putative esterase  30.54 
 
 
302 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2411  putative esterase  30.28 
 
 
368 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000101635  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_002950  PG0425  esterase, putative  28.45 
 
 
256 aa  65.1  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.2797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0649  putative esterase  28.39 
 
 
268 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0397008  normal  0.263924 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3878  putative esterase  24 
 
 
560 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1101  putative esterase  30.92 
 
 
341 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1407  putative esterase  25.62 
 
 
640 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00376031  normal  0.509577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1255  putative esterase  27.27 
 
 
301 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.469623 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2308  putative esterase  27.19 
 
 
270 aa  63.9  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3361  putative esterase  29.2 
 
 
369 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.151349 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  27.27 
 
 
490 aa  63.5  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  24.56 
 
 
640 aa  63.9  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02190  predicted esterase  27.75 
 
 
279 aa  63.2  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4946  putative esterase  26.67 
 
 
295 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580943  normal  0.169227 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1221  enterochelin esterase and related enzyme  30.9 
 
 
341 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.416855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  26.15 
 
 
708 aa  62.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1414  putative esterase  28.21 
 
 
375 aa  62.8  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1043  putative esterase  26.56 
 
 
274 aa  62.8  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3245  putative esterase  26.74 
 
 
392 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.458402  normal  0.0540976 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1192  putative esterase  31.36 
 
 
343 aa  62.4  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.477503  normal  0.314946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4242  putative esterase  27.82 
 
 
638 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.630883  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0425  putative esterase  29.34 
 
 
337 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0331  putative esterase  25.32 
 
 
392 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0101321 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0297  putative esterase  33.09 
 
 
342 aa  60.8  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.203768  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1408  putative esterase  24.9 
 
 
388 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0188455  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2109  putative esterase  31.3 
 
 
280 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0655634  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1701  hypothetical protein  26.56 
 
 
291 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.202768  normal  0.542752 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06770  predicted esterase  30.87 
 
 
312 aa  59.3  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1256  putative esterase  25.21 
 
 
375 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0345  putative esterase  30.25 
 
 
305 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0954  putative esterase  33.1 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327277  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1412  putative esterase  28.35 
 
 
359 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0970  putative esterase  21.52 
 
 
261 aa  57.4  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1883  putative esterase  26.83 
 
 
269 aa  56.6  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1251  putative esterase  30.89 
 
 
341 aa  56.2  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>