More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4039 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4497  putative esterase  98.41 
 
 
314 aa  634    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4039  putative esterase  100 
 
 
314 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1232  putative esterase  89.81 
 
 
311 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417705  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5695  putative esterase  94.16 
 
 
317 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712363 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3759  putative esterase  94.16 
 
 
317 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4609  putative esterase  94.16 
 
 
317 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.006335 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4037  putative esterase  85.03 
 
 
307 aa  532  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.205002 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2544  putative esterase  82.81 
 
 
290 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110736  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1456  esterase, putative  81.78 
 
 
281 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1370  putative esterase  82.81 
 
 
281 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1289  putative esterase  82.42 
 
 
290 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1290  putative esterase  82.81 
 
 
281 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1030  putative esterase  82.81 
 
 
281 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0267  putative esterase  82.81 
 
 
281 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0537  putative esterase  82.81 
 
 
281 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1701  hypothetical protein  68.36 
 
 
291 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.202768  normal  0.542752 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4946  putative esterase  67.58 
 
 
295 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580943  normal  0.169227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2656  putative esterase  50.19 
 
 
299 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  38.24 
 
 
708 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  32.68 
 
 
276 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3614  putative esterase  31.15 
 
 
315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0297  putative esterase  33.33 
 
 
342 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.203768  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  30.74 
 
 
640 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  32.55 
 
 
286 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1251  putative esterase  29.21 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3530  putative esterase  32.3 
 
 
302 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2341  putative esterase  29.84 
 
 
289 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416263  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1254  putative esterase  28.67 
 
 
385 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5166  putative esterase  30.56 
 
 
295 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0523  putative esterase  31.52 
 
 
296 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00718904  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5901  putative esterase  31.4 
 
 
283 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3253  putative esterase  30.56 
 
 
295 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5115  putative esterase  30.56 
 
 
295 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5051  putative esterase  29.57 
 
 
282 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4526  putative esterase  29.57 
 
 
286 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1859  putative esterase  30.08 
 
 
383 aa  97.1  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2825  putative esterase  25.98 
 
 
319 aa  94  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1987  putative esterase  27.92 
 
 
270 aa  94  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1407  putative esterase  26.91 
 
 
640 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00376031  normal  0.509577 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 
837 aa  93.2  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1412  putative esterase  32.72 
 
 
359 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1414  putative esterase  30.13 
 
 
375 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1255  putative esterase  28.23 
 
 
301 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.469623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4144  putative esterase  27.49 
 
 
296 aa  90.1  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1256  putative esterase  27.78 
 
 
375 aa  89.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3878  putative esterase  34.69 
 
 
560 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0835  putative esterase  26.21 
 
 
401 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2504  putative esterase  34.42 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.807754  normal  0.0850862 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2109  putative esterase  30.99 
 
 
280 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0655634  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0331  putative esterase  29.96 
 
 
392 aa  87  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0101321 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0108  putative esterase  27.2 
 
 
369 aa  87  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1260  putative esterase  29.87 
 
 
265 aa  87  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1530  putative esterase  27.13 
 
 
295 aa  86.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547916  normal  0.0514313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1411  putative esterase  37.25 
 
 
372 aa  86.3  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474659  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5713  putative esterase  28.11 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129647  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  28.62 
 
 
501 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0708  putative esterase  28.94 
 
 
285 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4097  putative esterase  35.76 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4136  putative esterase  35.76 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1043  putative esterase  30.8 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4242  putative esterase  37.75 
 
 
638 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.630883  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0186  putative esterase  27.83 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0091  putative esterase  33.33 
 
 
882 aa  81.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6266  putative esterase  27.64 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0345  putative esterase  34.04 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0425  esterase, putative  28.4 
 
 
256 aa  79  0.00000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.2797 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  28.12 
 
 
490 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3478  putative esterase  34.46 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429701  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1112  putative esterase  27.84 
 
 
409 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291043  normal  0.610364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3201  putative esterase  25.84 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1546  putative esterase  29.67 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828639  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3320  esterase-like protein  27.98 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.494197  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1854  esterase  23.9 
 
 
264 aa  75.5  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.118207  hitchhiker  0.0000115459 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1707  putative esterase  30 
 
 
394 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0767  putative esterase  27.52 
 
 
395 aa  75.1  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.313177  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3222  putative esterase  27.89 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.349427  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4810  putative esterase  29.86 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4275  glycoside hydrolase family 13 protein  24.9 
 
 
389 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4248  glycoside hydrolase family 13 domain protein  24.9 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4228  putative esterase  24.9 
 
 
364 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03603  predicted xylanase  24.9 
 
 
398 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03547  hypothetical protein  24.9 
 
 
398 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1101  putative esterase  36.36 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06770  predicted esterase  35.94 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1883  putative esterase  26.53 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0970  putative esterase  25.22 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1413  putative esterase  23.46 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16290  enterochelin esterase-like enzyme  33.54 
 
 
430 aa  70.5  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.521339  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0939  hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  30.23 
 
 
478 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11314  hypothetical protein  33.8 
 
 
456 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2433  glycoside hydrolase family 13 domain protein  27.14 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0723  putative esterase  30.54 
 
 
200 aa  68.9  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.173587  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1774  putative esterase  25.69 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000148005  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1408  putative esterase  28.74 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0188455  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1007  putative esterase  29.05 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17410  putative esterase  27.17 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02190  predicted esterase  31.39 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0978  putative esterase  29.05 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1582  putative esterase  25.28 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1644  putative esterase  28.65 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>