More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2731 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  100 
 
 		 640 aa  1338    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  57.06 
 
 		 505 aa  428  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  54.52 
 
 		 486 aa  404  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  52.62 
 
 		 530 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  51.1 
 
 		 530 aa  379  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  47.35 
 
 		 483 aa  298  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  44.79 
 
 		 462 aa  295  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  49.68 
 
 		 487 aa  295  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  47.28 
 
 		 503 aa  293  5e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3614  putative esterase  42.68 
 
 		 315 aa  276  9e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  46.11 
 
 		 504 aa  270  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  47.99 
 
 		 286 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  37.26 
 
 		 476 aa  257  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  39.31 
 
 		 475 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  34.43 
 
 		 476 aa  192  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  33.53 
 
 		 524 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1255  putative esterase  34.46 
 
 		 301 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.469623 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02500  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  35.85 
 
 		 308 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  33.81 
 
 		 276 aa  148  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2544  putative esterase  33.58 
 
 		 290 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110736  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1456  esterase, putative  33.58 
 
 		 281 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1290  putative esterase  33.58 
 
 		 281 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1370  putative esterase  33.58 
 
 		 281 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1030  putative esterase  33.58 
 
 		 281 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0267  putative esterase  33.58 
 
 		 281 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0537  putative esterase  33.58 
 
 		 281 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1289  putative esterase  33.58 
 
 		 290 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2341  putative esterase  33.95 
 
 		 289 aa  143  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416263  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2656  putative esterase  33.08 
 
 		 299 aa  140  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4037  putative esterase  31.2 
 
 		 307 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.205002 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5713  putative esterase  32.96 
 
 		 272 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5695  putative esterase  31.11 
 
 		 317 aa  138  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712363 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1232  putative esterase  30.74 
 
 		 311 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3759  putative esterase  31.11 
 
 		 317 aa  138  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4609  putative esterase  31.11 
 
 		 317 aa  138  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.006335 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4039  putative esterase  30.74 
 
 		 314 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4946  putative esterase  34.2 
 
 		 295 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580943  normal  0.169227 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  30.65 
 
 		 397 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4497  putative esterase  30.37 
 
 		 314 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3265  beta-lactamase  32.68 
 
 		 304 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000437182  hitchhiker  0.000159955 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1701  hypothetical protein  33.22 
 
 		 291 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.202768  normal  0.542752 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  26.65 
 
 		 598 aa  133  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4144  putative esterase  33.69 
 
 		 296 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1254  putative esterase  31.25 
 
 		 385 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  28.92 
 
 		 323 aa  131  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  29.02 
 
 		 363 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2825  putative esterase  30.08 
 
 		 319 aa  130  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4810  putative esterase  33.21 
 
 		 273 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  30 
 
 		 380 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  30 
 
 		 380 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3770  beta-lactamase  30.56 
 
 		 428 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000344014  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  30.32 
 
 		 366 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1987  putative esterase  30.83 
 
 		 270 aa  127  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0297  putative esterase  31.31 
 
 		 342 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.203768  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4526  putative esterase  30.66 
 
 		 286 aa  125  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5051  putative esterase  30.66 
 
 		 282 aa  125  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  28.62 
 
 		 396 aa  124  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1530  putative esterase  30.18 
 
 		 295 aa  123  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547916  normal  0.0514313 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3253  putative esterase  31.34 
 
 		 295 aa  123  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5115  putative esterase  31.34 
 
 		 295 aa  123  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3530  putative esterase  29.78 
 
 		 302 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5166  putative esterase  30.97 
 
 		 295 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0108  putative esterase  28.41 
 
 		 369 aa  122  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  26.06 
 
 		 305 aa  122  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  26.09 
 
 		 305 aa  120  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1043  putative esterase  32.57 
 
 		 274 aa  120  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0523  putative esterase  30.15 
 
 		 296 aa  120  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00718904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  26.45 
 
 		 340 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5901  putative esterase  29.48 
 
 		 283 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  30.14 
 
 		 412 aa  119  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  24.3 
 
 		 305 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  25.18 
 
 		 305 aa  118  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6266  putative esterase  29.66 
 
 		 276 aa  118  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1883  putative esterase  32.32 
 
 		 269 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  25.35 
 
 		 305 aa  117  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  24.3 
 
 		 309 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  24.3 
 
 		 309 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.89 
 
 		 419 aa  116  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  27.69 
 
 		 328 aa  116  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  28.29 
 
 		 389 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  24.91 
 
 		 305 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  31.12 
 
 		 360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  30.71 
 
 		 708 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.94 
 
 		 305 aa  115  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0835  putative esterase  29.66 
 
 		 401 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.47 
 
 		 415 aa  114  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1256  putative esterase  31.38 
 
 		 375 aa  114  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  27.92 
 
 		 315 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  29.18 
 
 		 505 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1414  putative esterase  32.49 
 
 		 375 aa  114  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  28.62 
 
 		 315 aa  113  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  27.27 
 
 		 371 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  23.12 
 
 		 387 aa  113  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0425  esterase, putative  29.3 
 
 		 256 aa  112  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.2797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  27.22 
 
 		 368 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  27.61 
 
 		 337 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  25.68 
 
 		 395 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  28.93 
 
 		 416 aa  112  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  28.1 
 
 		 384 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  27.83 
 
 		 400 aa  111  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>