More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1013 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  100 
 
 
598 aa  1210    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  41.37 
 
 
387 aa  279  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  34.58 
 
 
305 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  34.92 
 
 
305 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  33.9 
 
 
305 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  35.38 
 
 
305 aa  162  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  34.49 
 
 
305 aa  160  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  31.49 
 
 
380 aa  160  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  31.49 
 
 
380 aa  160  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  34.15 
 
 
309 aa  160  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  34.15 
 
 
309 aa  160  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.49 
 
 
305 aa  159  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  33.56 
 
 
305 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.56 
 
 
305 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  30.28 
 
 
363 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  34.83 
 
 
305 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  32.28 
 
 
315 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  31.73 
 
 
389 aa  144  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  31.78 
 
 
313 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  30.59 
 
 
328 aa  140  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  31.23 
 
 
315 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  30.38 
 
 
315 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  30.91 
 
 
315 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  29.1 
 
 
530 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  30.6 
 
 
315 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  30.91 
 
 
315 aa  137  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  30.91 
 
 
315 aa  137  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  28.92 
 
 
524 aa  136  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  30.39 
 
 
315 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  28.43 
 
 
486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  25.16 
 
 
366 aa  134  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  26.65 
 
 
640 aa  133  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  30.38 
 
 
314 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  29.87 
 
 
505 aa  132  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  30.15 
 
 
340 aa  128  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  31.5 
 
 
396 aa  128  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  28.28 
 
 
530 aa  128  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  28.57 
 
 
503 aa  126  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  28.31 
 
 
374 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  27.16 
 
 
327 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  28.18 
 
 
483 aa  124  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  30.18 
 
 
401 aa  124  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  28.71 
 
 
323 aa  124  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  28.48 
 
 
462 aa  123  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1811  beta-lactamase  29.46 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  30.24 
 
 
412 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4964  beta-lactamase  29.62 
 
 
335 aa  120  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663595  normal  0.0104106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  32.04 
 
 
475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.37 
 
 
415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  26.6 
 
 
389 aa  115  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  27.52 
 
 
395 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  29.47 
 
 
387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.85 
 
 
419 aa  112  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  25.73 
 
 
504 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  27.81 
 
 
397 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  27.33 
 
 
359 aa  110  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  28.33 
 
 
371 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1198  beta-lactamase  25.79 
 
 
333 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.98564  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  26.14 
 
 
360 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  27.6 
 
 
362 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  26.6 
 
 
384 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  28.07 
 
 
337 aa  107  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  27.33 
 
 
378 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  27.44 
 
 
390 aa  105  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3687  beta-lactamase  28.08 
 
 
342 aa  104  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.057596  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.73 
 
 
449 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  26.44 
 
 
359 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2259  beta-lactamase  23.44 
 
 
337 aa  103  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777809  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.67 
 
 
476 aa  103  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1250  Beta-lactamase  26.82 
 
 
338 aa  103  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  28.62 
 
 
309 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1083  beta-lactamase  26.5 
 
 
328 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  27.42 
 
 
372 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  26.95 
 
 
456 aa  102  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  27.22 
 
 
371 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  25 
 
 
505 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  25 
 
 
475 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  26.95 
 
 
413 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  27.96 
 
 
368 aa  101  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  28.13 
 
 
400 aa  100  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  23.77 
 
 
382 aa  99  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3388  beta-lactamase  28.22 
 
 
342 aa  99.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  26.5 
 
 
417 aa  97.1  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  25.97 
 
 
396 aa  95.5  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.4 
 
 
391 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.16 
 
 
425 aa  94.4  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.91 
 
 
405 aa  94.4  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  27.48 
 
 
487 aa  92.8  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  26.48 
 
 
368 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  25.48 
 
 
432 aa  90.9  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  26.46 
 
 
384 aa  90.5  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  27.94 
 
 
405 aa  90.5  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.77 
 
 
395 aa  90.1  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  24.4 
 
 
414 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  25.17 
 
 
389 aa  88.6  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  27.13 
 
 
405 aa  88.6  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  25.45 
 
 
447 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  25.46 
 
 
491 aa  88.2  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  25.45 
 
 
447 aa  88.2  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  25.45 
 
 
447 aa  88.2  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>