More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0255 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  100 
 
 		 503 aa  996    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  39.8 
 
 		 505 aa  307  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  43.68 
 
 		 530 aa  298  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  44.16 
 
 		 530 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  46.2 
 
 		 640 aa  294  3e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  42.67 
 
 		 486 aa  286  5e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  51.34 
 
 		 487 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  47.01 
 
 		 483 aa  258  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  42.53 
 
 		 475 aa  256  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  42.61 
 
 		 476 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  43.37 
 
 		 462 aa  237  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  40.7 
 
 		 504 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  32.55 
 
 		 476 aa  179  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  36.09 
 
 		 524 aa  176  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02500  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  38.66 
 
 		 308 aa  154  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  34.1 
 
 		 397 aa  141  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  27.24 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  27.15 
 
 		 309 aa  136  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  27.15 
 
 		 309 aa  136  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.15 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  27.49 
 
 		 305 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3265  beta-lactamase  33.81 
 
 		 304 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000437182  hitchhiker  0.000159955 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  25.95 
 
 		 305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  26.9 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4964  beta-lactamase  32 
 
 		 335 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663595  normal  0.0104106 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.12 
 
 		 305 aa  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  33.23 
 
 		 323 aa  129  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  28.67 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  26.55 
 
 		 305 aa  124  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  32.33 
 
 		 400 aa  123  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  28.57 
 
 		 598 aa  123  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  27.05 
 
 		 305 aa  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.62 
 
 		 415 aa  121  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  29.47 
 
 		 337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  27.69 
 
 		 313 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  24.91 
 
 		 305 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  23.36 
 
 		 387 aa  117  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  29.18 
 
 		 389 aa  116  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1811  beta-lactamase  32.4 
 
 		 356 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.72 
 
 		 419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  26.82 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  28.57 
 
 		 315 aa  114  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1250  Beta-lactamase  32.11 
 
 		 338 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  27.74 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3388  beta-lactamase  30.63 
 
 		 342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  27.92 
 
 		 315 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  27.6 
 
 		 315 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3687  beta-lactamase  28.61 
 
 		 342 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.057596  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  29.81 
 
 		 380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  29.81 
 
 		 380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  28.57 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  27.84 
 
 		 315 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  27.42 
 
 		 315 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  27.42 
 
 		 315 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  31.03 
 
 		 389 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  28.76 
 
 		 314 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  28.2 
 
 		 328 aa  106  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  31.14 
 
 		 414 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  25.59 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.92 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  31.1 
 
 		 401 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.56 
 
 		 419 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  28.16 
 
 		 371 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  26.51 
 
 		 396 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.67 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3770  beta-lactamase  26.54 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000344014  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  28.08 
 
 		 416 aa  102  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  28.89 
 
 		 366 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  28.39 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.18 
 
 		 419 aa  100  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.71 
 
 		 419 aa  99.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  32.32 
 
 		 410 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  29.32 
 
 		 371 aa  99.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  32.87 
 
 		 360 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  28.88 
 
 		 374 aa  99.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1083  beta-lactamase  29.07 
 
 		 328 aa  99  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.18 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2235  hypothetical protein  30.13 
 
 		 346 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.79 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0910  beta-lactamase  30.13 
 
 		 353 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.4 
 
 		 419 aa  97.8  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.4 
 
 		 419 aa  97.8  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  27.3 
 
 		 372 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.18 
 
 		 419 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  28.22 
 
 		 384 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  27.12 
 
 		 383 aa  96.7  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1198  beta-lactamase  29.03 
 
 		 333 aa  96.7  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.98564  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.88 
 
 		 419 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  26.43 
 
 		 380 aa  95.1  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  29.29 
 
 		 405 aa  94.4  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  27.27 
 
 		 456 aa  93.6  8e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.66 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  28.71 
 
 		 359 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  26.91 
 
 		 390 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  30.41 
 
 		 396 aa  91.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  27.62 
 
 		 359 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  29.21 
 
 		 412 aa  90.9  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  28.03 
 
 		 327 aa  90.9  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1376  hypothetical protein  27.59 
 
 		 431 aa  90.1  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  28.67 
 
 		 378 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>