More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4078 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  100 
 
 		 380 aa  775    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  100 
 
 		 380 aa  775    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  45.55 
 
 		 328 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  44.11 
 
 		 374 aa  239  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_003296  RS03702  hypothetical protein  79.85 
 
 		 139 aa  225  8e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.255314  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  39.88 
 
 		 366 aa  219  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  39.16 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03703  hypothetical protein  79.82 
 
 		 116 aa  192  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.505696  normal  0.773408 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  31.49 
 
 		 598 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  35.57 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  31.25 
 
 		 305 aa  160  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  33.74 
 
 		 524 aa  159  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  30.21 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  29.17 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  29.17 
 
 		 305 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  30.56 
 
 		 305 aa  157  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  29.17 
 
 		 309 aa  156  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  29.17 
 
 		 309 aa  156  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.51 
 
 		 305 aa  155  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.17 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  29.17 
 
 		 305 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  28.82 
 
 		 305 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  35.59 
 
 		 475 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  27.24 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  30.3 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  29.75 
 
 		 530 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  35.06 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  31.79 
 
 		 505 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  30 
 
 		 640 aa  129  8.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  30.19 
 
 		 396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  24.93 
 
 		 387 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  30.79 
 
 		 384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  32.33 
 
 		 359 aa  126  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  30.75 
 
 		 530 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  30.33 
 
 		 371 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  28.99 
 
 		 475 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.34 
 
 		 476 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  30.77 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  30.41 
 
 		 504 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  29.94 
 
 		 486 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  29.73 
 
 		 371 aa  114  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  29.68 
 
 		 462 aa  113  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  29.97 
 
 		 368 aa  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  30.77 
 
 		 473 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  29.15 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  29.81 
 
 		 503 aa  110  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  31.15 
 
 		 412 aa  109  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  29.05 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  29 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  29.02 
 
 		 475 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  30.24 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  29.39 
 
 		 467 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  25.23 
 
 		 340 aa  106  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  29.63 
 
 		 453 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  30.72 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.85 
 
 		 449 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  29.91 
 
 		 473 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  29.17 
 
 		 483 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  29.91 
 
 		 473 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  29.97 
 
 		 378 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  29.93 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29 
 
 		 419 aa  103  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1749  Beta-lactamase  30.7 
 
 		 496 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  27.04 
 
 		 315 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  27.04 
 
 		 315 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  25.48 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  27.38 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  30.11 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1198  beta-lactamase  30.59 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.98564  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  29.86 
 
 		 481 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  26.71 
 
 		 315 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  28.31 
 
 		 472 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  28.75 
 
 		 401 aa  99.8  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  32.26 
 
 		 396 aa  99.8  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  26.71 
 
 		 315 aa  99.4  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  28.46 
 
 		 467 aa  99.8  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  28.57 
 
 		 505 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  29.12 
 
 		 487 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  24.6 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  26.38 
 
 		 315 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1083  beta-lactamase  28.25 
 
 		 328 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  27.54 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  27.08 
 
 		 389 aa  97.4  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  27.17 
 
 		 468 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  29.55 
 
 		 459 aa  97.4  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3770  beta-lactamase  27.78 
 
 		 428 aa  96.7  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000344014  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  30.07 
 
 		 417 aa  96.7  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2235  hypothetical protein  29.35 
 
 		 346 aa  96.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  26.38 
 
 		 315 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  28.25 
 
 		 337 aa  96.3  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0910  beta-lactamase  29.35 
 
 		 353 aa  96.3  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2093  beta-lactamase  31.82 
 
 		 497 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  28.71 
 
 		 455 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3265  beta-lactamase  33.33 
 
 		 304 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000437182  hitchhiker  0.000159955 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  30.47 
 
 		 309 aa  94  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  29.66 
 
 		 378 aa  93.2  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  27.53 
 
 		 374 aa  93.2  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2416  beta-lactamase  28.49 
 
 		 376 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  25.32 
 
 		 476 aa  92.8  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  25.41 
 
 		 315 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>