More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4822 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  87.08 
 
 		 467 aa  798    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  100 
 
 		 473 aa  938    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  88.37 
 
 		 466 aa  806    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  99.15 
 
 		 473 aa  929    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  81.46 
 
 		 481 aa  746    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  99.15 
 
 		 473 aa  929    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  87.95 
 
 		 467 aa  811    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  42.86 
 
 		 468 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  42.7 
 
 		 453 aa  325  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  43.23 
 
 		 475 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  42.7 
 
 		 456 aa  316  7e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  42.01 
 
 		 472 aa  316  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  42.31 
 
 		 459 aa  300  5e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  38.68 
 
 		 443 aa  296  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1041  hypothetical protein  40.58 
 
 		 440 aa  293  3e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  38.25 
 
 		 491 aa  291  2e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1007  hypothetical protein  40.36 
 
 		 440 aa  291  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  34.52 
 
 		 449 aa  283  7.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  42.14 
 
 		 468 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  40.32 
 
 		 455 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  40.55 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3570  beta-lactamase  37.45 
 
 		 479 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230187  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2249  beta-lactamase  34.95 
 
 		 468 aa  222  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  35.14 
 
 		 522 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  43.56 
 
 		 383 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1816  beta-lactamase  33.62 
 
 		 494 aa  211  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.403938 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  38.63 
 
 		 374 aa  211  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  38.53 
 
 		 432 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1749  Beta-lactamase  36.94 
 
 		 496 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  38.68 
 
 		 360 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2093  beta-lactamase  35.12 
 
 		 497 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  39.2 
 
 		 371 aa  168  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  38.34 
 
 		 359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  37.38 
 
 		 368 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  37.73 
 
 		 371 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  37.76 
 
 		 384 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  35.24 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  37.13 
 
 		 362 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  38.87 
 
 		 378 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  38.51 
 
 		 372 aa  151  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  38.87 
 
 		 359 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  30.3 
 
 		 459 aa  145  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  31.82 
 
 		 396 aa  127  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  31.95 
 
 		 366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  31.76 
 
 		 414 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  28.8 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  33.62 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  29.24 
 
 		 401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  30.2 
 
 		 380 aa  113  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  30.2 
 
 		 380 aa  113  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  29.83 
 
 		 416 aa  113  9e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  31.67 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  27.09 
 
 		 397 aa  110  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  30.27 
 
 		 328 aa  109  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.13 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  26.35 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  24.01 
 
 		 305 aa  107  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  29.47 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  28.26 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  30.41 
 
 		 374 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.99 
 
 		 415 aa  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  25.07 
 
 		 384 aa  103  6e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  23.36 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  28.28 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  24.04 
 
 		 305 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  27.89 
 
 		 524 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  31.69 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  28.01 
 
 		 530 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  23.03 
 
 		 305 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  29.49 
 
 		 447 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  29.07 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  23.45 
 
 		 305 aa  100  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.14 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  23.03 
 
 		 305 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  23.03 
 
 		 309 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  23.03 
 
 		 309 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  28.87 
 
 		 505 aa  98.2  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  28.66 
 
 		 447 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  28.66 
 
 		 447 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.37 
 
 		 305 aa  96.3  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  27.78 
 
 		 400 aa  96.3  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  28.83 
 
 		 475 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.7 
 
 		 305 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  22.44 
 
 		 305 aa  95.1  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  24.48 
 
 		 383 aa  94.4  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  27.63 
 
 		 390 aa  94  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  28.9 
 
 		 504 aa  93.2  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  28.57 
 
 		 327 aa  92.8  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.4 
 
 		 419 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  27.19 
 
 		 640 aa  92  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  25.28 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  27.64 
 
 		 530 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.7 
 
 		 419 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.78 
 
 		 442 aa  91.3  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  29.66 
 
 		 396 aa  91.3  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.8 
 
 		 449 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25 
 
 		 419 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.29 
 
 		 395 aa  90.5  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.7 
 
 		 419 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>