229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2109 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  100 
 
 		 453 aa  917    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_004310  BR1041  hypothetical protein  58.98 
 
 		 440 aa  522  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1007  hypothetical protein  58.98 
 
 		 440 aa  521  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  56.32 
 
 		 443 aa  518  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  57.14 
 
 		 475 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  56.68 
 
 		 472 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  51.65 
 
 		 468 aa  455  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  54.36 
 
 		 459 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  43.75 
 
 		 466 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  42.73 
 
 		 473 aa  315  8e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  42.52 
 
 		 473 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  42.52 
 
 		 473 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  41.67 
 
 		 467 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  42.2 
 
 		 467 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  40.97 
 
 		 481 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  38.34 
 
 		 456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  35.86 
 
 		 491 aa  240  4e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  33.41 
 
 		 449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3570  beta-lactamase  39.21 
 
 		 479 aa  230  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230187  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  35.29 
 
 		 455 aa  213  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.46 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  40.97 
 
 		 374 aa  197  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  38.48 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  42.76 
 
 		 383 aa  193  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2249  beta-lactamase  32.77 
 
 		 468 aa  184  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1816  beta-lactamase  33.33 
 
 		 494 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.403938 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  38.83 
 
 		 432 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  40.79 
 
 		 368 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  33.41 
 
 		 522 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  40.86 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  38.36 
 
 		 359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  39.38 
 
 		 360 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  42.76 
 
 		 384 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  38.08 
 
 		 371 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  41.58 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  41.28 
 
 		 371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  39.43 
 
 		 368 aa  163  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  40.86 
 
 		 378 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  41.46 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1749  Beta-lactamase  32.38 
 
 		 496 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  29.58 
 
 		 459 aa  150  6e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2093  beta-lactamase  30.14 
 
 		 497 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  31.17 
 
 		 416 aa  113  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  28.96 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  29.97 
 
 		 413 aa  108  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  29.64 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  26.27 
 
 		 384 aa  106  7e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  29.63 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  29.63 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  26.69 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  27.86 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  29.89 
 
 		 363 aa  97.8  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  30.42 
 
 		 414 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  31.47 
 
 		 412 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  27.92 
 
 		 389 aa  96.3  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  28.42 
 
 		 389 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  29.7 
 
 		 414 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  25.4 
 
 		 305 aa  94  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  28.27 
 
 		 524 aa  93.6  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  25.93 
 
 		 505 aa  92.8  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  27.4 
 
 		 530 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  28.16 
 
 		 401 aa  91.3  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  27.4 
 
 		 328 aa  90.1  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  26.64 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  27.65 
 
 		 366 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  26.49 
 
 		 309 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  25.53 
 
 		 305 aa  88.6  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  26.49 
 
 		 309 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  29.45 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  27.7 
 
 		 397 aa  88.2  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.16 
 
 		 305 aa  87  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  25.56 
 
 		 305 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.78 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  25.44 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  25.17 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  25.35 
 
 		 640 aa  83.6  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  27.8 
 
 		 505 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  24.58 
 
 		 305 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  24.25 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.74 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  27.93 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  25.36 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  23.33 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.09 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  26.8 
 
 		 530 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  28.18 
 
 		 327 aa  79.7  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  25 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  32.41 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.42 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  28.97 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.57 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  25.44 
 
 		 598 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.75 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  28.22 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.67 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  28.68 
 
 		 483 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.22 
 
 		 476 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.44 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.05 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  26.52 
 
 		 447 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>