More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0204 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  87.15 
 
 
467 aa  806    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  100 
 
 
466 aa  929    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  87.53 
 
 
473 aa  797    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  81.04 
 
 
481 aa  733    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  85.62 
 
 
467 aa  790    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  87.1 
 
 
473 aa  792    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  87.1 
 
 
473 aa  792    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  42.74 
 
 
468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  42.76 
 
 
453 aa  326  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  43.86 
 
 
475 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  43.02 
 
 
456 aa  318  1e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  43.15 
 
 
472 aa  315  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1041  hypothetical protein  40.44 
 
 
440 aa  302  7.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  38.82 
 
 
443 aa  302  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1007  hypothetical protein  40.22 
 
 
440 aa  300  5e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  42.14 
 
 
459 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  38.74 
 
 
491 aa  289  6e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  35.04 
 
 
449 aa  285  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  41.69 
 
 
468 aa  264  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  41.44 
 
 
455 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3570  beta-lactamase  37.97 
 
 
479 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230187  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  41.69 
 
 
378 aa  239  8e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2249  beta-lactamase  35.27 
 
 
468 aa  226  8e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  34.79 
 
 
522 aa  219  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  40.29 
 
 
374 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  43.42 
 
 
383 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1816  beta-lactamase  32.54 
 
 
494 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.403938 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  38.06 
 
 
432 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1749  Beta-lactamase  36.98 
 
 
496 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2093  beta-lactamase  36.07 
 
 
497 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  37.03 
 
 
360 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  39.2 
 
 
371 aa  170  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  36.74 
 
 
359 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  38.85 
 
 
371 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  36.97 
 
 
384 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  36.88 
 
 
368 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  35.49 
 
 
362 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  39.31 
 
 
378 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  35.02 
 
 
368 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  30.4 
 
 
459 aa  152  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  38.66 
 
 
372 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  38.17 
 
 
359 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  31.02 
 
 
396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  31.1 
 
 
416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  31.07 
 
 
414 aa  120  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  32.77 
 
 
414 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  31.83 
 
 
366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  30.19 
 
 
389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  32.26 
 
 
323 aa  113  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  32.07 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  27.38 
 
 
397 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.13 
 
 
419 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.18 
 
 
415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  30.61 
 
 
328 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  30.49 
 
 
505 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  32.36 
 
 
374 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  25.67 
 
 
395 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  28.79 
 
 
475 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  29.93 
 
 
447 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  26.03 
 
 
384 aa  102  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  30.5 
 
 
399 aa  102  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  23.34 
 
 
305 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  29.14 
 
 
447 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  29.14 
 
 
447 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  29.65 
 
 
505 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  23.53 
 
 
305 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  29.97 
 
 
380 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  29.97 
 
 
380 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  30.32 
 
 
396 aa  100  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  27.54 
 
 
363 aa  99.8  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  27.82 
 
 
413 aa  99.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  22.65 
 
 
305 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  22.65 
 
 
305 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  23.53 
 
 
305 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  24.05 
 
 
305 aa  97.4  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  23.53 
 
 
309 aa  97.1  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  23.53 
 
 
309 aa  97.1  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.18 
 
 
305 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  29.35 
 
 
524 aa  96.3  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  25.52 
 
 
383 aa  95.5  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  27.48 
 
 
530 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.65 
 
 
419 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  27.02 
 
 
640 aa  94.7  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.8 
 
 
425 aa  94.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.18 
 
 
305 aa  94  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  30.28 
 
 
410 aa  94  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.99 
 
 
419 aa  94  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  28.36 
 
 
405 aa  93.6  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  28.96 
 
 
327 aa  93.6  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  27.4 
 
 
390 aa  93.2  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.51 
 
 
419 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.51 
 
 
419 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.93 
 
 
419 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.43 
 
 
419 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  22.15 
 
 
305 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  28.81 
 
 
412 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.01 
 
 
419 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.65 
 
 
419 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.29 
 
 
449 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  26.1 
 
 
530 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>