More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1494 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  100 
 
 		 505 aa  1028    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  41.16 
 
 		 414 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  44.1 
 
 		 414 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  40.48 
 
 		 390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  37.57 
 
 		 401 aa  246  6e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  38.63 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  35.53 
 
 		 405 aa  223  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  34.27 
 
 		 413 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  35.96 
 
 		 447 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  35.17 
 
 		 447 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  35.17 
 
 		 447 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  32.75 
 
 		 412 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.9 
 
 		 419 aa  188  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  34.23 
 
 		 416 aa  176  8e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  30.18 
 
 		 395 aa  176  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.04 
 
 		 415 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  36.18 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.81 
 
 		 425 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.38 
 
 		 449 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.7 
 
 		 405 aa  159  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  33.76 
 
 		 397 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.27 
 
 		 467 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.27 
 
 		 467 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4092  hypothetical protein  70.59 
 
 		 104 aa  150  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.68 
 
 		 397 aa  150  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.53 
 
 		 452 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.95 
 
 		 444 aa  146  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4047  beta-lactamase  68.27 
 
 		 111 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.98227 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6326  hypothetical protein  68.63 
 
 		 102 aa  144  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.681991 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.41 
 
 		 445 aa  140  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5609  hypothetical protein  68 
 
 		 103 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  31.86 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.97 
 
 		 442 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.29 
 
 		 395 aa  136  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  28.37 
 
 		 382 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0824  hypothetical protein  64 
 
 		 103 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.299347 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.6 
 
 		 449 aa  133  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2933  hypothetical protein  64.36 
 
 		 107 aa  131  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0184973  normal  0.826578 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.06 
 
 		 442 aa  131  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4512  hypothetical protein  64.71 
 
 		 103 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.84 
 
 		 448 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.58 
 
 		 443 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  27.88 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1927  hypothetical protein  64.71 
 
 		 103 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.011093 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1246  hypothetical protein  63.73 
 
 		 103 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1272  hypothetical protein  63.73 
 
 		 103 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12483 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1228  hypothetical protein  65.66 
 
 		 99 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3291  hypothetical protein  64 
 
 		 108 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3168  hypothetical protein  63.64 
 
 		 99 aa  127  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.81 
 
 		 439 aa  127  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1163  hypothetical protein  63.64 
 
 		 99 aa  126  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.450464  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1473  hypothetical protein  59.22 
 
 		 104 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.192982  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  31.51 
 
 		 417 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0887  hypothetical protein  61.76 
 
 		 103 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1369  hypothetical protein  61.76 
 
 		 103 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.775913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  29.85 
 
 		 389 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1347  hypothetical protein  62.75 
 
 		 103 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0599686 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  29.33 
 
 		 415 aa  123  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  30.72 
 
 		 410 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.86 
 
 		 385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.86 
 
 		 385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4170  hypothetical protein  61.62 
 
 		 100 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3290  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.71 
 
 		 446 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  26.97 
 
 		 384 aa  119  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.24 
 
 		 385 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.12 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  29.18 
 
 		 640 aa  114  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  27.71 
 
 		 383 aa  114  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.67 
 
 		 410 aa  113  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3688  hypothetical protein  62 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989403  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4148  hypothetical protein  58.76 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  25.58 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  28 
 
 		 380 aa  110  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  28.47 
 
 		 530 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3736  hypothetical protein  57.43 
 
 		 106 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4813  hypothetical protein  57.43 
 
 		 106 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.927854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.47 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5881  hypothetical protein  51.85 
 
 		 114 aa  107  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  29.84 
 
 		 467 aa  107  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.16 
 
 		 419 aa  106  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1945  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.48 
 
 		 430 aa  106  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0642639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.47 
 
 		 419 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  30.49 
 
 		 466 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  28.67 
 
 		 530 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  31.23 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1367  hypothetical protein  56.7 
 
 		 107 aa  104  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.61 
 
 		 419 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4626  hypothetical protein  47.27 
 
 		 116 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.61 
 
 		 419 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  30.46 
 
 		 473 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  30.46 
 
 		 473 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.36 
 
 		 408 aa  104  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  30.13 
 
 		 473 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  26.89 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.84 
 
 		 420 aa  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.84 
 
 		 419 aa  103  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  24.92 
 
 		 315 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  25 
 
 		 598 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.16 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  29.18 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>