218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1954 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  99.48 
 
 
385 aa  774    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  99.48 
 
 
385 aa  774    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  100 
 
 
385 aa  776    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  61.82 
 
 
415 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  49.47 
 
 
395 aa  352  4e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  48.54 
 
 
397 aa  345  1e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  38.75 
 
 
452 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.08 
 
 
467 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  37.67 
 
 
389 aa  229  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.71 
 
 
444 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.19 
 
 
467 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.96 
 
 
443 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.34 
 
 
442 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  38.07 
 
 
397 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.67 
 
 
445 aa  215  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.04 
 
 
442 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.83 
 
 
391 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.1 
 
 
439 aa  194  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.86 
 
 
448 aa  194  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.97 
 
 
449 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.8 
 
 
405 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0338  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.9 
 
 
446 aa  178  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.691557  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3290  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.11 
 
 
446 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1945  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.29 
 
 
430 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0642639  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  32.43 
 
 
405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.67 
 
 
410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.37 
 
 
419 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.37 
 
 
419 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.37 
 
 
419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.29 
 
 
408 aa  166  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.83 
 
 
419 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.64 
 
 
419 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.83 
 
 
419 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.83 
 
 
419 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.29 
 
 
419 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.56 
 
 
419 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.75 
 
 
449 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.02 
 
 
419 aa  155  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2715  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.85 
 
 
387 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5283  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.87 
 
 
450 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25 
 
 
420 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  29.97 
 
 
414 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3144  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.58 
 
 
439 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175175  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1376  hypothetical protein  26.06 
 
 
431 aa  143  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4421  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.9 
 
 
452 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  30.19 
 
 
426 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.74 
 
 
415 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  30.29 
 
 
390 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  29.97 
 
 
414 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  25.07 
 
 
395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1841  hypothetical protein  25.48 
 
 
446 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.38 
 
 
419 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.11 
 
 
425 aa  126  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  29.15 
 
 
505 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  29.19 
 
 
412 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5936  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.12 
 
 
430 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2479  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.74 
 
 
449 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0984  beta-lactamase  26.92 
 
 
450 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  28.48 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3884  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.14 
 
 
444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.383079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  31.44 
 
 
410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  27.87 
 
 
389 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  27.39 
 
 
416 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2086  putative beta-lactamase  26.29 
 
 
421 aa  106  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  27.85 
 
 
405 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  28.81 
 
 
417 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  27.87 
 
 
447 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  27.87 
 
 
447 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  26.09 
 
 
413 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  27.7 
 
 
404 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  27.37 
 
 
447 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  31.62 
 
 
384 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  28.32 
 
 
396 aa  93.6  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  29.97 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1842  hypothetical protein  21.68 
 
 
457 aa  86.3  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  30.72 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  28.66 
 
 
372 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  30.27 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  24.12 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2115  Beta-lactamase  24.36 
 
 
420 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269149  normal  0.194976 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  25.2 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  31.15 
 
 
473 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  29.92 
 
 
481 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  31.15 
 
 
473 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  31.15 
 
 
473 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  25.53 
 
 
598 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  24.26 
 
 
382 aa  75.1  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  24.84 
 
 
455 aa  73.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  23.37 
 
 
384 aa  73.6  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  29.26 
 
 
432 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  28.64 
 
 
443 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  28.67 
 
 
360 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  26.1 
 
 
524 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  30.04 
 
 
466 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  24.4 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  29.96 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  25.31 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  31.28 
 
 
467 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  31.28 
 
 
467 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  24.9 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>