216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1974 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  100 
 
 		 385 aa  776    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  100 
 
 		 385 aa  776    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  99.48 
 
 		 385 aa  774    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  62.08 
 
 		 415 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  49.47 
 
 		 395 aa  353  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  48.81 
 
 		 397 aa  347  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  39.03 
 
 		 452 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.34 
 
 		 467 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.46 
 
 		 467 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  37.33 
 
 		 389 aa  229  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.96 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.96 
 
 		 443 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.34 
 
 		 442 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.67 
 
 		 445 aa  216  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  38.35 
 
 		 397 aa  216  7e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.33 
 
 		 442 aa  213  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.11 
 
 		 391 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.36 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.86 
 
 		 448 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.97 
 
 		 449 aa  192  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.8 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3290  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.59 
 
 		 446 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0338  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.15 
 
 		 446 aa  178  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.691557  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1945  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.29 
 
 		 430 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0642639  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.67 
 
 		 410 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  32.43 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.37 
 
 		 419 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.37 
 
 		 419 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.29 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.37 
 
 		 419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.64 
 
 		 419 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.83 
 
 		 419 aa  166  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.83 
 
 		 419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.83 
 
 		 419 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.29 
 
 		 419 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.56 
 
 		 419 aa  162  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.75 
 
 		 449 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.02 
 
 		 419 aa  155  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2715  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.85 
 
 		 387 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25 
 
 		 420 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5283  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.31 
 
 		 450 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  29.97 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3144  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.19 
 
 		 439 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1376  hypothetical protein  26.06 
 
 		 431 aa  143  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4421  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.61 
 
 		 452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  30.29 
 
 		 390 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.74 
 
 		 415 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  30.08 
 
 		 414 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  29.92 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  25.34 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.38 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1841  hypothetical protein  25.48 
 
 		 446 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.11 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5936  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.12 
 
 		 430 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  29.19 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  28.86 
 
 		 505 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  31.73 
 
 		 410 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2479  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.18 
 
 		 449 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0984  beta-lactamase  26.92 
 
 		 450 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  28.48 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3884  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.86 
 
 		 444 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.383079 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  27.87 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  27.06 
 
 		 416 aa  106  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2086  putative beta-lactamase  26.29 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  26.42 
 
 		 413 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  28.81 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  27.85 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  27.87 
 
 		 447 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  27.87 
 
 		 447 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  27.73 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  27.37 
 
 		 447 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  31.62 
 
 		 384 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  28.61 
 
 		 396 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  29.63 
 
 		 359 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1842  hypothetical protein  21.95 
 
 		 457 aa  86.3  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  30.72 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  30.27 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  25.08 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  28.35 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2115  Beta-lactamase  24.36 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269149  normal  0.194976 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  25.2 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  31.15 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  29.92 
 
 		 481 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  31.15 
 
 		 473 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  31.15 
 
 		 473 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  24.68 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  25.53 
 
 		 598 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  29 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  24.84 
 
 		 455 aa  74.3  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  23.37 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  29.26 
 
 		 432 aa  73.2  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  28.64 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  26.1 
 
 		 524 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  30.04 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  24.8 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  31.28 
 
 		 467 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  29.96 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  25.31 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  28.47 
 
 		 468 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  24.9 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>