More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0196 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  100 
 
 		 399 aa  825    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  39.62 
 
 		 383 aa  263  3e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  38.3 
 
 		 384 aa  262  6.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  32.79 
 
 		 382 aa  193  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  30.33 
 
 		 405 aa  142  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.14 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  32.42 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  30.9 
 
 		 395 aa  140  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  32.43 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.65 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.89 
 
 		 415 aa  133  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  29.07 
 
 		 413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  33.05 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  30.22 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  31.85 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  29.69 
 
 		 368 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  28.66 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  30.03 
 
 		 374 aa  116  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  30.19 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  27 
 
 		 380 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  27.65 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.86 
 
 		 405 aa  110  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  25.58 
 
 		 505 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.25 
 
 		 419 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.35 
 
 		 419 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  30.91 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  31 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.34 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.62 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  29.64 
 
 		 453 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  29 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  31.06 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.3 
 
 		 419 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.52 
 
 		 420 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.03 
 
 		 419 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.03 
 
 		 419 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  31.23 
 
 		 378 aa  106  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  26.44 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.35 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  29.76 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  28.97 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  29.07 
 
 		 475 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  28.87 
 
 		 396 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.3 
 
 		 419 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  30.03 
 
 		 378 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  30 
 
 		 414 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  26.52 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  30.5 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  29.67 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  29.28 
 
 		 362 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  30.03 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  29.07 
 
 		 481 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  29.07 
 
 		 473 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  28.32 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.82 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  28.76 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  29.62 
 
 		 467 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  29.93 
 
 		 443 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  30.25 
 
 		 467 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  27.5 
 
 		 328 aa  99.8  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  30.45 
 
 		 459 aa  99.8  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  28.3 
 
 		 383 aa  99  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  26.73 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  27.47 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  28.43 
 
 		 473 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  28.43 
 
 		 473 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  26.32 
 
 		 313 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  30.14 
 
 		 363 aa  97.1  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  29.01 
 
 		 372 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  27.34 
 
 		 505 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.81 
 
 		 467 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  28.57 
 
 		 468 aa  95.5  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  26.76 
 
 		 315 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  27.02 
 
 		 315 aa  94  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.81 
 
 		 439 aa  93.6  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.48 
 
 		 467 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  27.18 
 
 		 323 aa  92.8  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  27.02 
 
 		 315 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  27.02 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.5 
 
 		 445 aa  92  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  25.44 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  26.36 
 
 		 447 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  26.36 
 
 		 447 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  25.26 
 
 		 374 aa  89.7  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  26.63 
 
 		 447 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  28.92 
 
 		 455 aa  89.7  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  25.96 
 
 		 315 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  26.57 
 
 		 315 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  25.61 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  27.76 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  25.08 
 
 		 305 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  25.87 
 
 		 315 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  25.87 
 
 		 315 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1007  hypothetical protein  26.07 
 
 		 440 aa  87.4  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  25.61 
 
 		 340 aa  87.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  29.33 
 
 		 491 aa  87  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  27.11 
 
 		 640 aa  86.7  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  27.78 
 
 		 397 aa  86.3  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_004310  BR1041  hypothetical protein  25.71 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>