More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0029 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  100 
 
 		 505 aa  1041    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  48.02 
 
 		 486 aa  449  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  47.16 
 
 		 530 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  48.48 
 
 		 530 aa  438  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  55.29 
 
 		 640 aa  432  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  45.47 
 
 		 487 aa  339  7e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  46.97 
 
 		 462 aa  321  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  38.41 
 
 		 483 aa  303  6.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  38 
 
 		 503 aa  297  3e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  37.28 
 
 		 476 aa  292  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  45.14 
 
 		 504 aa  277  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  37.15 
 
 		 475 aa  276  6e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  29.82 
 
 		 476 aa  196  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  31.39 
 
 		 524 aa  177  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  31.39 
 
 		 397 aa  150  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3265  beta-lactamase  36.26 
 
 		 304 aa  142  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000437182  hitchhiker  0.000159955 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02500  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  35.74 
 
 		 308 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  29.59 
 
 		 305 aa  140  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  29.25 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  28.67 
 
 		 305 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  28.86 
 
 		 598 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  32.2 
 
 		 363 aa  133  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  30.94 
 
 		 380 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  30.94 
 
 		 380 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  28.47 
 
 		 305 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  32.97 
 
 		 401 aa  128  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  27.6 
 
 		 305 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  28.47 
 
 		 309 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  28.47 
 
 		 309 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.8 
 
 		 305 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  28.07 
 
 		 305 aa  124  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  30.41 
 
 		 328 aa  123  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  29.1 
 
 		 387 aa  123  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  28.47 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  28.21 
 
 		 400 aa  121  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  34.28 
 
 		 405 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.21 
 
 		 305 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  30.64 
 
 		 340 aa  120  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  30.07 
 
 		 323 aa  120  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3770  beta-lactamase  29.45 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000344014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  27.49 
 
 		 315 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  27.03 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  27.84 
 
 		 396 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  28.57 
 
 		 366 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  28.84 
 
 		 315 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.88 
 
 		 419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  27.81 
 
 		 416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  29.55 
 
 		 313 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  28.72 
 
 		 414 aa  113  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.03 
 
 		 415 aa  113  9e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  31.42 
 
 		 315 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  26.65 
 
 		 374 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  29.47 
 
 		 475 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  27.17 
 
 		 360 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  25.8 
 
 		 395 aa  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  27.76 
 
 		 315 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  28.29 
 
 		 389 aa  110  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  28.16 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  28.04 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  28.04 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  28.82 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  28.57 
 
 		 314 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  29.18 
 
 		 389 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  26.93 
 
 		 412 aa  107  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3104  putative Beta-lactamase  28.85 
 
 		 463 aa  106  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  25.32 
 
 		 383 aa  106  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  28.97 
 
 		 384 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.63 
 
 		 425 aa  104  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  29.2 
 
 		 417 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  26.21 
 
 		 384 aa  103  6e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  26.22 
 
 		 374 aa  103  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  27.3 
 
 		 378 aa  103  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  29.5 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  25.88 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  28.78 
 
 		 362 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2236  amide hydrolase  28.89 
 
 		 340 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4500  beta-lactamase  25.28 
 
 		 421 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00711948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  28.92 
 
 		 371 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.22 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  29.21 
 
 		 456 aa  99.4  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3093  beta-lactamase  25.93 
 
 		 333 aa  99.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4964  beta-lactamase  27.61 
 
 		 335 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663595  normal  0.0104106 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  28.15 
 
 		 432 aa  99  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  25.56 
 
 		 371 aa  99  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  30.16 
 
 		 368 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  29.63 
 
 		 473 aa  97.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  28.96 
 
 		 467 aa  97.1  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3687  beta-lactamase  28.75 
 
 		 342 aa  96.7  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.057596  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  27.91 
 
 		 396 aa  96.7  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  25 
 
 		 368 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1198  beta-lactamase  28.01 
 
 		 333 aa  96.3  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.98564  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1250  Beta-lactamase  28.86 
 
 		 338 aa  95.9  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  29.39 
 
 		 467 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3388  beta-lactamase  29.29 
 
 		 342 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.52 
 
 		 443 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  27.14 
 
 		 399 aa  95.9  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  29.22 
 
 		 473 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  29.22 
 
 		 473 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  28.05 
 
 		 481 aa  94.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  26.97 
 
 		 449 aa  94.4  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>