More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3265 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3265  beta-lactamase  100 
 
 		 304 aa  611  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000437182  hitchhiker  0.000159955 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02500  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  39.56 
 
 		 308 aa  169  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  36.26 
 
 		 505 aa  145  9e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  33.21 
 
 		 503 aa  138  8.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  32.68 
 
 		 640 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  27.12 
 
 		 530 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  29.28 
 
 		 530 aa  125  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  35.25 
 
 		 487 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  33.58 
 
 		 475 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  32.82 
 
 		 504 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  30.42 
 
 		 486 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  31.92 
 
 		 483 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  32.83 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  30.83 
 
 		 462 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  33.33 
 
 		 380 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  33.33 
 
 		 380 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  31.17 
 
 		 328 aa  95.9  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  30.71 
 
 		 366 aa  95.9  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  30.26 
 
 		 397 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  31.68 
 
 		 374 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  32.63 
 
 		 323 aa  85.5  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  25.78 
 
 		 476 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  27.02 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  31.46 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  26.94 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  27.16 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  34.9 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  31.76 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  32.51 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  31.17 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  23.04 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  31.58 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  33.17 
 
 		 467 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  28.23 
 
 		 466 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.83 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  32.66 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  30.77 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  21.46 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  20.62 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  25.38 
 
 		 363 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  20.23 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  19.46 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  20.23 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  29.56 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  21.24 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  25.43 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  19.84 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  32.86 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.64 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  21.24 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  24.62 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  26.15 
 
 		 524 aa  69.3  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  25.5 
 
 		 414 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  28.37 
 
 		 468 aa  68.9  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1083  beta-lactamase  28.32 
 
 		 328 aa  68.9  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1198  beta-lactamase  31.46 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.98564  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  28.51 
 
 		 473 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  19.31 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  30.72 
 
 		 487 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  34.04 
 
 		 507 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  28.51 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  24.91 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  28.51 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  28.08 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  40.15 
 
 		 356 aa  67  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  19.46 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2235  hypothetical protein  32.45 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  29.06 
 
 		 432 aa  67  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  30.23 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  28.99 
 
 		 470 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  33.02 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  37.34 
 
 		 525 aa  66.2  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2259  beta-lactamase  30.32 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777809  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  26.26 
 
 		 396 aa  65.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  30.14 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  32.37 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  23.7 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  34.59 
 
 		 508 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3770  beta-lactamase  24.5 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000344014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  31.25 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  21.94 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  33.14 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  29.84 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  33.33 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  31.17 
 
 		 459 aa  63.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0910  beta-lactamase  31.91 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  28.57 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  27.8 
 
 		 472 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  27.88 
 
 		 447 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  27.2 
 
 		 405 aa  62.8  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  27.97 
 
 		 434 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  31.34 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.44 
 
 		 425 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  31.94 
 
 		 371 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  32.37 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  26.09 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  32.62 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  28.65 
 
 		 713 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  24.91 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  29.19 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>