184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3770 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3770  beta-lactamase  100 
 
 		 428 aa  878    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000344014  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4500  beta-lactamase  56.57 
 
 		 421 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00711948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  30.56 
 
 		 640 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  29.41 
 
 		 486 aa  119  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  29.45 
 
 		 505 aa  119  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  28.16 
 
 		 305 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  28.08 
 
 		 530 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  27.6 
 
 		 305 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  27.6 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  27.6 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  29.45 
 
 		 530 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.27 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  29.8 
 
 		 524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  27.18 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  26.86 
 
 		 305 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.83 
 
 		 305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  27.51 
 
 		 305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  28.18 
 
 		 475 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  29.45 
 
 		 487 aa  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  27.83 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  28.08 
 
 		 305 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  27.72 
 
 		 475 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  26.54 
 
 		 503 aa  102  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.43 
 
 		 476 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  26.18 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  27.85 
 
 		 323 aa  100  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  26.98 
 
 		 313 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  27.78 
 
 		 380 aa  96.7  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  27.78 
 
 		 380 aa  96.7  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  26.61 
 
 		 315 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  24.76 
 
 		 387 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  26.47 
 
 		 315 aa  94.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  26.02 
 
 		 315 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  26.47 
 
 		 315 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  26.33 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  26.47 
 
 		 315 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  26.6 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  27.11 
 
 		 315 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  26.38 
 
 		 504 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  26.37 
 
 		 397 aa  90.9  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  27.76 
 
 		 462 aa  90.9  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  27.81 
 
 		 363 aa  90.1  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  25.22 
 
 		 315 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  26.04 
 
 		 314 aa  87  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  24.85 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  24.1 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  25.16 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  26.4 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  26.42 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  24.36 
 
 		 476 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  26.77 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.77 
 
 		 468 aa  77.4  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1124  beta-lactamase  28.38 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  23.93 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  24.83 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  24.92 
 
 		 598 aa  72.8  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  24.92 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1811  beta-lactamase  25.69 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  24.5 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  24.32 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  25.8 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  24.26 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  24.6 
 
 		 360 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1749  Beta-lactamase  26.86 
 
 		 496 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  26.85 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  23.1 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.84 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  26.81 
 
 		 473 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.37 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  23.89 
 
 		 378 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.37 
 
 		 419 aa  67  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  22.94 
 
 		 328 aa  67  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  25.68 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  25.4 
 
 		 473 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  25.4 
 
 		 473 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  23.89 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.37 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  25.35 
 
 		 481 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  24.29 
 
 		 491 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.37 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  24.23 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  25.43 
 
 		 475 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  24.6 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  23.13 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  25.6 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.04 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  23.79 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  23.37 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  24.8 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  23.71 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.05 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  24.15 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  20.78 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.25 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  22.36 
 
 		 522 aa  64.3  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3245  beta-lactamase  25.2 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.622434 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  25.48 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  24.68 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  24.57 
 
 		 459 aa  63.2  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.5 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>