More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0953 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  100 
 
 		 323 aa  641    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  35.47 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  34.92 
 
 		 363 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  35.16 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  35.04 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  35.16 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  39.2 
 
 		 389 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  32.29 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  33.58 
 
 		 309 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  33.58 
 
 		 309 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.29 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  31.12 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  33.58 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  37.91 
 
 		 337 aa  166  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  32.4 
 
 		 305 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1811  beta-lactamase  36.13 
 
 		 356 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.85 
 
 		 305 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  35.57 
 
 		 380 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  35.57 
 
 		 380 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1198  beta-lactamase  40.13 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.98564  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  30.59 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  30.59 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  33.79 
 
 		 328 aa  155  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  30.72 
 
 		 315 aa  155  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  34.88 
 
 		 397 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  31.05 
 
 		 315 aa  153  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  29.93 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  30.72 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  30.72 
 
 		 315 aa  149  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1250  Beta-lactamase  36.51 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  30.39 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  29.29 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1083  beta-lactamase  37.18 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3388  beta-lactamase  36.16 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4964  beta-lactamase  36.27 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663595  normal  0.0104106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  33.77 
 
 		 524 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  33.96 
 
 		 374 aa  143  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2259  beta-lactamase  35.56 
 
 		 337 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777809  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0910  beta-lactamase  38.21 
 
 		 353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  38.78 
 
 		 396 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  33.99 
 
 		 400 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2235  hypothetical protein  37.86 
 
 		 346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3687  beta-lactamase  35.62 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.057596  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  28.62 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  36.27 
 
 		 475 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  31.16 
 
 		 366 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  34.04 
 
 		 504 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  28.92 
 
 		 640 aa  131  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  32.91 
 
 		 503 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  32.04 
 
 		 475 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  30.51 
 
 		 530 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  26.27 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  26.15 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  31.41 
 
 		 486 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  28.71 
 
 		 598 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.83 
 
 		 449 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.41 
 
 		 415 aa  123  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  29.53 
 
 		 382 aa  121  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  32.14 
 
 		 476 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  30.26 
 
 		 505 aa  120  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02500  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  36.76 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  33.87 
 
 		 462 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  29.62 
 
 		 395 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  29.84 
 
 		 530 aa  115  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  33.02 
 
 		 456 aa  115  7.999999999999999e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  32.26 
 
 		 466 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  32.36 
 
 		 483 aa  113  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  33.33 
 
 		 327 aa  112  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  35.14 
 
 		 384 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  31.8 
 
 		 473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  30.19 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  31.48 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  31.48 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  36.05 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  32.46 
 
 		 467 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  28.06 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  31.05 
 
 		 481 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  32.13 
 
 		 467 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  30.21 
 
 		 401 aa  106  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  33.67 
 
 		 371 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  29.54 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  28.32 
 
 		 413 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.86 
 
 		 425 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  33.9 
 
 		 414 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  29.97 
 
 		 412 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.19 
 
 		 419 aa  102  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  29.87 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  26.18 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  29.49 
 
 		 505 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3770  beta-lactamase  27.85 
 
 		 428 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000344014  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  28.36 
 
 		 389 aa  99.4  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.89 
 
 		 391 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  29.38 
 
 		 368 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  31.49 
 
 		 378 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.35 
 
 		 405 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  29.03 
 
 		 491 aa  96.7  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  28.75 
 
 		 522 aa  95.9  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  33.46 
 
 		 447 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  33.46 
 
 		 447 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  33.55 
 
 		 372 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>