298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0832 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  100 
 
 		 378 aa  773    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  42.77 
 
 		 466 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  42.86 
 
 		 473 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  42.33 
 
 		 456 aa  239  5.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  42.86 
 
 		 473 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  42.86 
 
 		 473 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  41.87 
 
 		 481 aa  235  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  40.41 
 
 		 467 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  41.95 
 
 		 467 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  39.76 
 
 		 491 aa  230  3e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  39.17 
 
 		 374 aa  221  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  40 
 
 		 383 aa  209  7e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  35.65 
 
 		 449 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  38.55 
 
 		 453 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  38.94 
 
 		 468 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  38.59 
 
 		 468 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  37.17 
 
 		 522 aa  186  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  38.6 
 
 		 455 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  35.42 
 
 		 432 aa  180  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  35.88 
 
 		 443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  35.36 
 
 		 472 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2249  beta-lactamase  37.06 
 
 		 468 aa  170  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  33.84 
 
 		 459 aa  168  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  34.56 
 
 		 384 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  34.24 
 
 		 371 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  35.12 
 
 		 475 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1041  hypothetical protein  34.78 
 
 		 440 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1007  hypothetical protein  34.78 
 
 		 440 aa  159  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1816  beta-lactamase  31.74 
 
 		 494 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.403938 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  31.48 
 
 		 368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  33.66 
 
 		 459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  32.1 
 
 		 368 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  32.92 
 
 		 360 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  32.72 
 
 		 362 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  33.64 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  34.25 
 
 		 372 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  32.32 
 
 		 359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  30.94 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  32.19 
 
 		 378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1749  Beta-lactamase  35.29 
 
 		 496 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  30.07 
 
 		 416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3570  beta-lactamase  31.62 
 
 		 479 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230187  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2093  beta-lactamase  34.07 
 
 		 497 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  28.97 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  30.11 
 
 		 530 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  32.5 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  28.96 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  31.16 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  29.54 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  31.23 
 
 		 399 aa  114  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.08 
 
 		 425 aa  110  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  28.53 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  30.28 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  29.67 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  31.56 
 
 		 505 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  25.68 
 
 		 530 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  27.04 
 
 		 524 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  28.16 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  30.82 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.6 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  28.72 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  27.8 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  27.8 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.27 
 
 		 405 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  32.43 
 
 		 410 aa  106  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.16 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  27.4 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  27.3 
 
 		 505 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.94 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  28.98 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  28.81 
 
 		 397 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  28.67 
 
 		 475 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  27.17 
 
 		 305 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  25.94 
 
 		 640 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  31.49 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  28.71 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  27.8 
 
 		 305 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  27.17 
 
 		 413 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.08 
 
 		 305 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  29.07 
 
 		 366 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  28.82 
 
 		 327 aa  99.8  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.21 
 
 		 449 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  27.44 
 
 		 305 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  28.05 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  29.66 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  29.66 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.9 
 
 		 467 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3093  beta-lactamase  28.95 
 
 		 333 aa  97.1  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.9 
 
 		 467 aa  96.3  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  29.28 
 
 		 462 aa  95.9  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  27.11 
 
 		 340 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  28.71 
 
 		 504 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  32.37 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  25.95 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  26.69 
 
 		 305 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  30.05 
 
 		 417 aa  94  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  25.74 
 
 		 476 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  27.07 
 
 		 328 aa  93.2  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  28.57 
 
 		 337 aa  92.8  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  26.03 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>