153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1083 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1083  beta-lactamase  100 
 
 		 328 aa  647    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1198  beta-lactamase  58.56 
 
 		 333 aa  345  4e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.98564  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2259  beta-lactamase  54.46 
 
 		 337 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777809  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2235  hypothetical protein  60.84 
 
 		 346 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0910  beta-lactamase  60.84 
 
 		 353 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  44.59 
 
 		 337 aa  269  5e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  48.66 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1811  beta-lactamase  41.61 
 
 		 356 aa  229  6e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4964  beta-lactamase  42 
 
 		 335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663595  normal  0.0104106 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1250  Beta-lactamase  40.51 
 
 		 338 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3687  beta-lactamase  41.16 
 
 		 342 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.057596  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3388  beta-lactamase  40.06 
 
 		 342 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  31.75 
 
 		 363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  37.18 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  31.91 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  30.69 
 
 		 305 aa  136  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  31.29 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  30.58 
 
 		 305 aa  132  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  28.88 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  28.88 
 
 		 309 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  28.88 
 
 		 309 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.88 
 
 		 305 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  29.6 
 
 		 305 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.88 
 
 		 305 aa  126  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  29.96 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  28.04 
 
 		 387 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  30.42 
 
 		 524 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  29.87 
 
 		 374 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  31.02 
 
 		 328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  27.79 
 
 		 340 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  27.51 
 
 		 314 aa  113  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  27.51 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  26.67 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  28.06 
 
 		 640 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  30.67 
 
 		 366 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  29.63 
 
 		 327 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  26.67 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  26.67 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  27.84 
 
 		 530 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  26.88 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  26.5 
 
 		 598 aa  102  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  25.67 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  26.94 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  26 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  30.04 
 
 		 486 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  25.67 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  30.94 
 
 		 475 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  28.35 
 
 		 384 aa  99  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  29.07 
 
 		 503 aa  99  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  28.25 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  28.25 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  30.54 
 
 		 475 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  23.32 
 
 		 387 aa  92.8  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  25.81 
 
 		 530 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  28.94 
 
 		 504 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  25 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  26.83 
 
 		 505 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.04 
 
 		 476 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  27.6 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.12 
 
 		 449 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  26.07 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  28.91 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.18 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2236  amide hydrolase  26.12 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  21.73 
 
 		 476 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4003  hypothetical protein  27.08 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  26.98 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  27.74 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  28.12 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  28.57 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  29.84 
 
 		 397 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  26.58 
 
 		 396 aa  72.4  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  27.14 
 
 		 505 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  26.58 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  26.25 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  27.52 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  28.01 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  25.84 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  27.31 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  26.55 
 
 		 483 aa  69.7  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  24.7 
 
 		 383 aa  69.3  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  28.41 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  27.24 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  23.92 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.5 
 
 		 419 aa  67  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1041  hypothetical protein  26.94 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02500  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  27.49 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  27.21 
 
 		 372 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1007  hypothetical protein  26.94 
 
 		 440 aa  65.9  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3104  putative Beta-lactamase  27.97 
 
 		 463 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  23.85 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3265  beta-lactamase  28.32 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000437182  hitchhiker  0.000159955 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  24.14 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  28.57 
 
 		 413 aa  62.8  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  26.35 
 
 		 378 aa  62.4  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0993  beta-lactamase  25.58 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  27.03 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1124  beta-lactamase  25.81 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  27.61 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  26.17 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>