216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4003 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4003  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  692    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2236  amide hydrolase  55.49 
 
 		 340 aa  359  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3104  putative Beta-lactamase  46.23 
 
 		 463 aa  278  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3093  beta-lactamase  43.51 
 
 		 333 aa  232  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  28.57 
 
 		 401 aa  109  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  30.41 
 
 		 412 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.29 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  27.41 
 
 		 380 aa  99  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  27.76 
 
 		 640 aa  97.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  29.47 
 
 		 389 aa  95.9  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  30.48 
 
 		 456 aa  95.1  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  26.09 
 
 		 395 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  27.07 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  29.15 
 
 		 396 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  26.9 
 
 		 505 aa  90.9  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.98 
 
 		 419 aa  89.7  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  26.38 
 
 		 447 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  26.38 
 
 		 447 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  27.04 
 
 		 447 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.05 
 
 		 415 aa  88.6  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  28.29 
 
 		 397 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  24.41 
 
 		 363 aa  87.4  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  29.69 
 
 		 328 aa  86.7  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  27.41 
 
 		 384 aa  86.3  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  27.11 
 
 		 315 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  26.76 
 
 		 315 aa  85.9  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  26.76 
 
 		 315 aa  85.9  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  27.52 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  25 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  29.13 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  25.68 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13543  putative hydrolase transmembrane protein  25.8 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  24.3 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  26.76 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  27.18 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  30.5 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  28.29 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  23.96 
 
 		 530 aa  82.8  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.32 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  27.11 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  25.17 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  27.21 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  23.95 
 
 		 524 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3687  beta-lactamase  29.74 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.057596  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  25.31 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  25.31 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.05 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  26.36 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  25.31 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  29.73 
 
 		 384 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  27.13 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  28.96 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1198  beta-lactamase  28.63 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.98564  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3388  beta-lactamase  29.74 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1083  beta-lactamase  27.08 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4964  beta-lactamase  28.93 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663595  normal  0.0104106 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  27.18 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.42 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  29.96 
 
 		 475 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  27.96 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  28.19 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.4 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  28.51 
 
 		 483 aa  76.6  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  26.53 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.7 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  24.5 
 
 		 505 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  26.59 
 
 		 387 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  29.06 
 
 		 466 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.15 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  23.32 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2259  beta-lactamase  23.38 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777809  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  25.35 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  27.24 
 
 		 462 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  23.78 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  26.15 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  27.42 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  29.89 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  27.33 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  27.91 
 
 		 455 aa  74.3  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  28.34 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  26.4 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.92 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  24.9 
 
 		 476 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  24.43 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  24.47 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.85 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  27.05 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.85 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  26.5 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  27.31 
 
 		 380 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  27.31 
 
 		 380 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  23.49 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4979  beta-lactamase  21.79 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1250  Beta-lactamase  25.91 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02500  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.13 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  28.68 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  24.91 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.56 
 
 		 468 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.55 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  25.46 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>