More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0905 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  100 
 
 		 425 aa  887    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  43.86 
 
 		 419 aa  318  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  36.99 
 
 		 412 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  35.53 
 
 		 395 aa  210  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.73 
 
 		 415 aa  209  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.14 
 
 		 449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  34.17 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.17 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  33.33 
 
 		 413 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  34.16 
 
 		 447 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  31.44 
 
 		 414 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  33.61 
 
 		 447 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  33.61 
 
 		 447 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  33.53 
 
 		 410 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  30.89 
 
 		 414 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  32.01 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  33.64 
 
 		 396 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  30.81 
 
 		 505 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  29.85 
 
 		 405 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  31.46 
 
 		 390 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  31.43 
 
 		 382 aa  156  8e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.62 
 
 		 442 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.13 
 
 		 444 aa  150  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  29.69 
 
 		 389 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  26.84 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  30.92 
 
 		 384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.36 
 
 		 442 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  32.97 
 
 		 417 aa  143  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.91 
 
 		 452 aa  143  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.39 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.73 
 
 		 449 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.96 
 
 		 448 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.55 
 
 		 467 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.61 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  27.51 
 
 		 416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  32.65 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.49 
 
 		 408 aa  132  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.2 
 
 		 439 aa  133  7.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.08 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  29.47 
 
 		 380 aa  129  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0338  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.72 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.691557  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.57 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  30 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  27.36 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.56 
 
 		 445 aa  127  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  28.3 
 
 		 389 aa  126  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.11 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.11 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.25 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.21 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.11 
 
 		 385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.32 
 
 		 419 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.99 
 
 		 419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  29.77 
 
 		 384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.32 
 
 		 397 aa  119  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.89 
 
 		 419 aa  119  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.89 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.99 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.89 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.02 
 
 		 410 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3290  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.32 
 
 		 446 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.99 
 
 		 419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1945  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.81 
 
 		 430 aa  116  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0642639  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  28.67 
 
 		 371 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  29.97 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.66 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  24.92 
 
 		 383 aa  112  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.34 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1376  hypothetical protein  24.47 
 
 		 431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  27.3 
 
 		 372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  27.84 
 
 		 387 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  28.33 
 
 		 368 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  28.52 
 
 		 360 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  26.35 
 
 		 359 aa  107  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  30.24 
 
 		 432 aa  106  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  27.89 
 
 		 378 aa  106  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  26.14 
 
 		 374 aa  106  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  28.04 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4003  hypothetical protein  29.29 
 
 		 335 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  30.63 
 
 		 505 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  27.13 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  27.4 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1841  hypothetical protein  28.52 
 
 		 446 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  28.62 
 
 		 456 aa  103  8e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  29.86 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  28.13 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  27.53 
 
 		 397 aa  99.8  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  28.14 
 
 		 473 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  28 
 
 		 363 aa  99.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  26.21 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  26.21 
 
 		 378 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  25.85 
 
 		 305 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  26.23 
 
 		 396 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  28.38 
 
 		 313 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2249  beta-lactamase  27.78 
 
 		 468 aa  97.8  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  25.51 
 
 		 305 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  27.8 
 
 		 473 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  27.8 
 
 		 473 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  27.89 
 
 		 467 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  27.55 
 
 		 467 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>