201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2876 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  100 
 
 
410 aa  853    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  41.55 
 
 
452 aa  309  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  41.67 
 
 
443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  39.1 
 
 
467 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  39.34 
 
 
444 aa  292  8e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  38.66 
 
 
467 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  39.3 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  42.11 
 
 
445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  40.48 
 
 
442 aa  283  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.38 
 
 
442 aa  279  8e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  39.01 
 
 
408 aa  267  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  39.27 
 
 
439 aa  265  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.6 
 
 
449 aa  259  8e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.77 
 
 
448 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1945  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.62 
 
 
430 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0642639  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.04 
 
 
419 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3290  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.45 
 
 
446 aa  226  8e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0338  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.6 
 
 
446 aa  225  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.691557  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.25 
 
 
419 aa  223  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.3 
 
 
419 aa  222  8e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.3 
 
 
419 aa  222  8e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.3 
 
 
419 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.72 
 
 
420 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.04 
 
 
419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.77 
 
 
419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.04 
 
 
419 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.25 
 
 
419 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.98 
 
 
419 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5283  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.38 
 
 
450 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3144  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.83 
 
 
439 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175175  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.64 
 
 
395 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.87 
 
 
397 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4421  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.29 
 
 
452 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  30.48 
 
 
389 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.67 
 
 
385 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.67 
 
 
385 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3884  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.64 
 
 
444 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.383079 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  30.92 
 
 
415 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.38 
 
 
385 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.4 
 
 
391 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5936  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.34 
 
 
430 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2479  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.23 
 
 
449 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.35 
 
 
419 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2715  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.52 
 
 
387 aa  139  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.09 
 
 
415 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.33 
 
 
449 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  29.43 
 
 
414 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0984  beta-lactamase  30.52 
 
 
450 aa  126  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  30.33 
 
 
414 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.57 
 
 
405 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  26.67 
 
 
405 aa  125  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  25.34 
 
 
395 aa  121  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1376  hypothetical protein  27.22 
 
 
431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  27.43 
 
 
426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.02 
 
 
425 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  26.67 
 
 
505 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  26.4 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2086  putative beta-lactamase  25.63 
 
 
421 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  26.86 
 
 
416 aa  104  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  25.93 
 
 
412 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  27.41 
 
 
405 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1841  hypothetical protein  27.93 
 
 
446 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  26.89 
 
 
401 aa  99  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  26.16 
 
 
396 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  27.06 
 
 
390 aa  97.8  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  21.87 
 
 
404 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  26.67 
 
 
410 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  26.58 
 
 
413 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  28.2 
 
 
530 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  24.18 
 
 
447 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  27.62 
 
 
640 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  26.36 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0777  beta-lactamase  27.36 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0135628  normal  0.105331 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  26.07 
 
 
417 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  24.31 
 
 
447 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  24.31 
 
 
447 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  25.84 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  29.79 
 
 
503 aa  83.2  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  23.93 
 
 
315 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  25.53 
 
 
315 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  26.32 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  27.52 
 
 
462 aa  81.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  24.65 
 
 
476 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  24.57 
 
 
363 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  25.76 
 
 
315 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  23.13 
 
 
598 aa  78.2  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  27.76 
 
 
473 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  27.76 
 
 
473 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  24.78 
 
 
456 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  26.09 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  27.42 
 
 
473 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  25.17 
 
 
384 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  24.76 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  25.85 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  23.97 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  29.08 
 
 
504 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  26.45 
 
 
530 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  27.84 
 
 
505 aa  74.7  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  26.85 
 
 
467 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  24.32 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>