240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2715 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2715  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  100 
 
 		 387 aa  804    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  45.34 
 
 		 389 aa  343  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  42.64 
 
 		 391 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.99 
 
 		 452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.24 
 
 		 445 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.8 
 
 		 444 aa  193  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.43 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.87 
 
 		 443 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.91 
 
 		 467 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.79 
 
 		 397 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.38 
 
 		 467 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  31.74 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.4 
 
 		 442 aa  180  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.53 
 
 		 439 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.78 
 
 		 442 aa  170  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.12 
 
 		 448 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.9 
 
 		 449 aa  162  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  28.42 
 
 		 415 aa  160  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.85 
 
 		 385 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.85 
 
 		 385 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3290  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.44 
 
 		 446 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1945  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.32 
 
 		 430 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0642639  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.88 
 
 		 410 aa  153  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.41 
 
 		 385 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.49 
 
 		 419 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  32.21 
 
 		 426 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.22 
 
 		 419 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.22 
 
 		 419 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.01 
 
 		 419 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.84 
 
 		 408 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.22 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.95 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.53 
 
 		 419 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.77 
 
 		 419 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.73 
 
 		 420 aa  143  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.4 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.4 
 
 		 419 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  31.09 
 
 		 412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2479  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.24 
 
 		 449 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5283  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.56 
 
 		 450 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3884  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.95 
 
 		 444 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.383079 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  29.48 
 
 		 405 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4421  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.95 
 
 		 452 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0338  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.32 
 
 		 446 aa  127  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.691557  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1376  hypothetical protein  27.3 
 
 		 431 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  31.35 
 
 		 410 aa  124  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.7 
 
 		 405 aa  123  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.37 
 
 		 419 aa  119  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3144  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.15 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.22 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  25.49 
 
 		 395 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0984  beta-lactamase  25.86 
 
 		 450 aa  111  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.07 
 
 		 415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1841  hypothetical protein  25.93 
 
 		 446 aa  110  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.93 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  26.8 
 
 		 401 aa  103  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  25.72 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5936  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.93 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1842  hypothetical protein  28.48 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  32.03 
 
 		 417 aa  99.4  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  26.54 
 
 		 416 aa  95.9  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  26.04 
 
 		 405 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  27.33 
 
 		 413 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  22.62 
 
 		 404 aa  94  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  26.17 
 
 		 414 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2086  putative beta-lactamase  22.93 
 
 		 421 aa  92.8  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  25.24 
 
 		 414 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  24.76 
 
 		 447 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  25.47 
 
 		 505 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  24.45 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  25.55 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  24.45 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  26.13 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  25 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  24.52 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2115  Beta-lactamase  23.63 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269149  normal  0.194976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  28.67 
 
 		 475 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  24.41 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.64 
 
 		 468 aa  72.8  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  27.24 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  24.74 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  27.08 
 
 		 374 aa  72  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  27.19 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  23.49 
 
 		 598 aa  70.5  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  23.84 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  25.47 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  24.41 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  26.46 
 
 		 313 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  25.63 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0777  beta-lactamase  24.92 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0135628  normal  0.105331 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  24.09 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  25.7 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  26.99 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  24.23 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  22.85 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2249  beta-lactamase  24.17 
 
 		 468 aa  62.4  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  26.7 
 
 		 315 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  25.89 
 
 		 328 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  27.04 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  28.02 
 
 		 793 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>