More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2098 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  100 
 
 		 442 aa  920    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  62.77 
 
 		 445 aa  578  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  55.35 
 
 		 449 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  55.53 
 
 		 439 aa  483  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  52.76 
 
 		 444 aa  465  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1945  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  53.04 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0642639  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  51.32 
 
 		 448 aa  461  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  52.18 
 
 		 467 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  52.43 
 
 		 467 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  52.17 
 
 		 443 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3290  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  53.88 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  46.83 
 
 		 452 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  48.25 
 
 		 397 aa  413  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  44.85 
 
 		 408 aa  394  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  42.39 
 
 		 442 aa  339  5.9999999999999996e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.38 
 
 		 410 aa  279  9e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0338  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.94 
 
 		 446 aa  259  7e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.691557  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  39.45 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  39.73 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  38.57 
 
 		 419 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  39.4 
 
 		 419 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  39.4 
 
 		 419 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  38.9 
 
 		 419 aa  252  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.27 
 
 		 395 aa  251  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  38.86 
 
 		 419 aa  249  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  38.36 
 
 		 419 aa  247  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  38.63 
 
 		 419 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  38.04 
 
 		 419 aa  247  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.9 
 
 		 397 aa  236  8e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.06 
 
 		 420 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.33 
 
 		 385 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.33 
 
 		 385 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.9 
 
 		 385 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3144  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.49 
 
 		 439 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.94 
 
 		 391 aa  196  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3884  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.63 
 
 		 444 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.383079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  30.26 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4421  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.03 
 
 		 452 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5283  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.73 
 
 		 450 aa  182  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  31.36 
 
 		 415 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5936  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.43 
 
 		 430 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2479  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.55 
 
 		 449 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  34.71 
 
 		 389 aa  169  9e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  29.57 
 
 		 395 aa  167  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.99 
 
 		 415 aa  164  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2715  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.46 
 
 		 387 aa  160  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0984  beta-lactamase  32.77 
 
 		 450 aa  157  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  32.17 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  30.54 
 
 		 405 aa  149  9e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1376  hypothetical protein  29.46 
 
 		 431 aa  147  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2086  putative beta-lactamase  31.09 
 
 		 421 aa  146  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.36 
 
 		 425 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  29.9 
 
 		 426 aa  143  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.36 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  32.52 
 
 		 390 aa  141  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1841  hypothetical protein  29.57 
 
 		 446 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.78 
 
 		 419 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  28.97 
 
 		 505 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.87 
 
 		 449 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  29.24 
 
 		 414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  27.11 
 
 		 414 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  26.9 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  29.38 
 
 		 405 aa  121  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  29.59 
 
 		 412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  29.39 
 
 		 410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  25 
 
 		 404 aa  120  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  28.98 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  27.44 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  27.61 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  26.87 
 
 		 524 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  27.83 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  27.61 
 
 		 315 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  26.65 
 
 		 313 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  27.48 
 
 		 315 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  27.18 
 
 		 382 aa  99.8  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  27.81 
 
 		 315 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  26.57 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  28.13 
 
 		 315 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  28.13 
 
 		 315 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  27.76 
 
 		 380 aa  97.1  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  26.65 
 
 		 447 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  26.82 
 
 		 314 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  26.88 
 
 		 447 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  26.88 
 
 		 447 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  28.39 
 
 		 340 aa  93.2  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  26.58 
 
 		 315 aa  90.5  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  25.08 
 
 		 384 aa  90.1  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1842  hypothetical protein  26.6 
 
 		 457 aa  90.1  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  25.86 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  26.8 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  25.94 
 
 		 598 aa  82.8  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  26.24 
 
 		 505 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  26.64 
 
 		 530 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  24.09 
 
 		 384 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2115  Beta-lactamase  23.68 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269149  normal  0.194976 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  23.15 
 
 		 476 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  24.75 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  26.64 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  25.4 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  27.52 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>