161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3884 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2479  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  86.86 
 
 		 449 aa  750    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3884  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  100 
 
 		 444 aa  880    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.383079 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5283  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  52.61 
 
 		 450 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5936  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  60.32 
 
 		 430 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4421  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  57.64 
 
 		 452 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3144  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  51.64 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.69 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.57 
 
 		 443 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.07 
 
 		 452 aa  209  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.08 
 
 		 467 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.41 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.08 
 
 		 467 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.26 
 
 		 442 aa  196  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.82 
 
 		 445 aa  196  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  36.07 
 
 		 397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.42 
 
 		 448 aa  188  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3290  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.11 
 
 		 446 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.13 
 
 		 449 aa  183  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.08 
 
 		 420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.56 
 
 		 410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.18 
 
 		 419 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.37 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.79 
 
 		 419 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.17 
 
 		 419 aa  169  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.81 
 
 		 419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.79 
 
 		 419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.79 
 
 		 419 aa  167  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.79 
 
 		 419 aa  167  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.66 
 
 		 439 aa  166  8e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.52 
 
 		 419 aa  163  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.89 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0338  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.1 
 
 		 446 aa  161  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.691557  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1945  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.56 
 
 		 430 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0642639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  32.87 
 
 		 389 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.93 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.85 
 
 		 395 aa  139  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.11 
 
 		 391 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.67 
 
 		 397 aa  130  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2715  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.59 
 
 		 387 aa  123  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.86 
 
 		 385 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.86 
 
 		 385 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.6 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  28.61 
 
 		 415 aa  107  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0984  beta-lactamase  24.59 
 
 		 450 aa  104  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  26.08 
 
 		 405 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.3 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.53 
 
 		 419 aa  99  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.59 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  21.75 
 
 		 395 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  26.74 
 
 		 401 aa  88.6  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  22.53 
 
 		 413 aa  88.2  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  26.69 
 
 		 426 aa  87.4  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25 
 
 		 449 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  26.2 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  29.1 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1376  hypothetical protein  25 
 
 		 431 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  25.94 
 
 		 447 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  25.94 
 
 		 447 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2086  putative beta-lactamase  24.57 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1841  hypothetical protein  24.92 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  26.55 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  28.7 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  27.93 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  25.48 
 
 		 447 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  26.27 
 
 		 414 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  25.93 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.91 
 
 		 425 aa  69.7  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  26.95 
 
 		 405 aa  67  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  24.64 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  26.53 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  27.93 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  27.18 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  25.24 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  23.84 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  24.92 
 
 		 505 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  25.52 
 
 		 530 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  21.33 
 
 		 313 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  24.27 
 
 		 456 aa  62  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  23.75 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1842  hypothetical protein  22.46 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  25 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  21.29 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  25.38 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  27.12 
 
 		 481 aa  57  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  23.95 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  24.44 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  20.97 
 
 		 315 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  28.14 
 
 		 323 aa  55.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  24.84 
 
 		 473 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  24.84 
 
 		 473 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  24.84 
 
 		 473 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  22.05 
 
 		 384 aa  54.3  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2115  Beta-lactamase  24.76 
 
 		 420 aa  54.3  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269149  normal  0.194976 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  25.82 
 
 		 467 aa  53.9  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  25 
 
 		 524 aa  53.5  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  24.53 
 
 		 359 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  23.53 
 
 		 475 aa  53.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  20 
 
 		 315 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  20.39 
 
 		 315 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2249  beta-lactamase  26.43 
 
 		 468 aa  52.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.106288 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>