More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3787 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  100 
 
 		 445 aa  907    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  61.81 
 
 		 442 aa  593  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  58.23 
 
 		 444 aa  513  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  56.94 
 
 		 449 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  59.95 
 
 		 443 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  55.53 
 
 		 452 aa  498  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  54.46 
 
 		 439 aa  486  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  58.1 
 
 		 467 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  59.1 
 
 		 467 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  51.57 
 
 		 448 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3290  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  56.45 
 
 		 446 aa  465  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1945  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  54.46 
 
 		 430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0642639  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  55.56 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  50.49 
 
 		 408 aa  422  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  47.78 
 
 		 442 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  42.11 
 
 		 410 aa  295  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0338  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.44 
 
 		 446 aa  269  7e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.691557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  38.3 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.64 
 
 		 419 aa  250  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  38.17 
 
 		 395 aa  250  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.36 
 
 		 419 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.36 
 
 		 419 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.36 
 
 		 419 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.44 
 
 		 419 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.89 
 
 		 419 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.54 
 
 		 419 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.62 
 
 		 419 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.36 
 
 		 419 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.81 
 
 		 419 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.53 
 
 		 420 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.4 
 
 		 385 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.4 
 
 		 385 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3144  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.18 
 
 		 439 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4421  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.63 
 
 		 452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.13 
 
 		 385 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5283  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.9 
 
 		 450 aa  213  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.29 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3884  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.15 
 
 		 444 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.383079 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  32.49 
 
 		 415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5936  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.73 
 
 		 430 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  33.61 
 
 		 389 aa  192  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2715  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.69 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2479  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.64 
 
 		 449 aa  176  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.42 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  34.65 
 
 		 426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.05 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1376  hypothetical protein  31.82 
 
 		 431 aa  157  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  28.06 
 
 		 395 aa  155  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  31.83 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.73 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  31.71 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  31.33 
 
 		 401 aa  146  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1841  hypothetical protein  31.15 
 
 		 446 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0984  beta-lactamase  29.02 
 
 		 450 aa  145  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2086  putative beta-lactamase  28.06 
 
 		 421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  30.41 
 
 		 505 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.38 
 
 		 419 aa  139  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  33.03 
 
 		 410 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  28.61 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  29.9 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  29.17 
 
 		 414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.56 
 
 		 425 aa  127  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  29.08 
 
 		 414 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  28.21 
 
 		 412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  30.81 
 
 		 405 aa  117  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  26.39 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  26.49 
 
 		 447 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  26.49 
 
 		 447 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  26.73 
 
 		 447 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  32.29 
 
 		 417 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  25.94 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  29.08 
 
 		 396 aa  98.2  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2115  Beta-lactamase  29.45 
 
 		 420 aa  97.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269149  normal  0.194976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  27.24 
 
 		 384 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  25.44 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1842  hypothetical protein  25.78 
 
 		 457 aa  96.3  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  28.76 
 
 		 323 aa  92.8  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  28.33 
 
 		 640 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  26.5 
 
 		 399 aa  91.7  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  26.74 
 
 		 530 aa  90.5  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  26.25 
 
 		 371 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  27.48 
 
 		 368 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  27.47 
 
 		 340 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  26.56 
 
 		 359 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  25.42 
 
 		 524 aa  89  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  23.23 
 
 		 382 aa  88.6  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  25.17 
 
 		 380 aa  87.4  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  23.26 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  25.42 
 
 		 505 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  23.97 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  28.78 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  26.49 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  28.03 
 
 		 503 aa  84  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  22.26 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  26.49 
 
 		 473 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  26.49 
 
 		 473 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  23.59 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  24.48 
 
 		 476 aa  82  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  26.25 
 
 		 530 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  26.73 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>