139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5283 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4421  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  73.97 
 
 		 452 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5283  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  100 
 
 		 450 aa  920    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3144  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  56.93 
 
 		 439 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2479  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  56.14 
 
 		 449 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3884  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  55.64 
 
 		 444 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.383079 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5936  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  57.98 
 
 		 430 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  38.73 
 
 		 442 aa  254  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  39.89 
 
 		 452 aa  246  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  38.99 
 
 		 443 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.67 
 
 		 467 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  38.48 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  37.57 
 
 		 467 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.5 
 
 		 444 aa  220  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.38 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.9 
 
 		 445 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.78 
 
 		 419 aa  202  9e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.7 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.15 
 
 		 419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.51 
 
 		 419 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.99 
 
 		 449 aa  200  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.24 
 
 		 419 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  34.24 
 
 		 419 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.79 
 
 		 419 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.97 
 
 		 419 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.24 
 
 		 419 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.88 
 
 		 419 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.97 
 
 		 419 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0338  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.93 
 
 		 446 aa  193  6e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.691557  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.31 
 
 		 408 aa  183  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.73 
 
 		 442 aa  182  9.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3290  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.99 
 
 		 446 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.17 
 
 		 439 aa  176  7e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.08 
 
 		 448 aa  170  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.69 
 
 		 395 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1945  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.56 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0642639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  30.66 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.47 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.31 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.31 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.69 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2715  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.37 
 
 		 387 aa  130  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.9 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  29.7 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  27.48 
 
 		 405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.15 
 
 		 415 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  28.78 
 
 		 426 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0984  beta-lactamase  24.25 
 
 		 450 aa  101  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.7 
 
 		 405 aa  100  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  22.54 
 
 		 395 aa  99.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.23 
 
 		 449 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  29.01 
 
 		 410 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.36 
 
 		 419 aa  92.8  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  25.76 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  27.94 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  24.8 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1841  hypothetical protein  28.96 
 
 		 446 aa  92  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  26.17 
 
 		 389 aa  88.6  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2086  putative beta-lactamase  22.32 
 
 		 421 aa  86.7  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  23.32 
 
 		 505 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1376  hypothetical protein  27.52 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  26.51 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  26.4 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.14 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  22.2 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  22.63 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4867  beta-lactamase  23.92 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5459  beta-lactamase  23.05 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5403  beta-lactamase  23.05 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00345414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  29.05 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  24.03 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  28.1 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  21.62 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  25.85 
 
 		 396 aa  67  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2115  Beta-lactamase  23.93 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269149  normal  0.194976 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  24.83 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  25.99 
 
 		 481 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4979  beta-lactamase  21.85 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  22.12 
 
 		 530 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  24.34 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  23.2 
 
 		 503 aa  58.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  21.96 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  25 
 
 		 522 aa  58.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  21.97 
 
 		 384 aa  57  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  24.01 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  24.01 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  22.29 
 
 		 315 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  21.04 
 
 		 368 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  22.82 
 
 		 453 aa  55.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  23.15 
 
 		 456 aa  54.3  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  21.99 
 
 		 475 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  22.88 
 
 		 359 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  24.07 
 
 		 467 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  24.63 
 
 		 466 aa  53.9  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  23.77 
 
 		 467 aa  53.5  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  21.05 
 
 		 315 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  22.09 
 
 		 315 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  22.09 
 
 		 315 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  26.09 
 
 		 369 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  24.76 
 
 		 372 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  20.78 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>