210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3990 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  100 
 
 		 522 aa  1061    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1816  beta-lactamase  63.89 
 
 		 494 aa  627  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.403938 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1749  Beta-lactamase  43.58 
 
 		 496 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2093  beta-lactamase  41.14 
 
 		 497 aa  289  8e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  39.38 
 
 		 481 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  37.61 
 
 		 466 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  38.35 
 
 		 473 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  38.35 
 
 		 473 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  38.05 
 
 		 473 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  34.56 
 
 		 467 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  33.48 
 
 		 467 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  30.32 
 
 		 456 aa  189  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  34.57 
 
 		 449 aa  187  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  29.75 
 
 		 491 aa  184  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  36.26 
 
 		 378 aa  184  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  33.41 
 
 		 453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  33.33 
 
 		 459 aa  173  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  31.89 
 
 		 468 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  31.67 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_004310  BR1041  hypothetical protein  31.44 
 
 		 440 aa  172  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1007  hypothetical protein  31.44 
 
 		 440 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  31.76 
 
 		 468 aa  171  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  32.44 
 
 		 475 aa  171  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  31.6 
 
 		 472 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  32.19 
 
 		 374 aa  158  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  30 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2249  beta-lactamase  29.79 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  28.86 
 
 		 459 aa  144  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  29.75 
 
 		 383 aa  143  8e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  33.45 
 
 		 432 aa  140  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  32.78 
 
 		 359 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  33.11 
 
 		 384 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3570  beta-lactamase  32.75 
 
 		 479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230187  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  33.14 
 
 		 372 aa  130  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  30.74 
 
 		 371 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  31.72 
 
 		 368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  30.17 
 
 		 360 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  30.95 
 
 		 368 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  31.7 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  31.7 
 
 		 378 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  30.22 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  29.35 
 
 		 371 aa  116  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  26.12 
 
 		 396 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  29.54 
 
 		 400 aa  107  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  28.28 
 
 		 384 aa  102  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  28.19 
 
 		 382 aa  97.1  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  25.18 
 
 		 305 aa  95.5  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  29.51 
 
 		 414 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  28.75 
 
 		 323 aa  95.1  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  29.97 
 
 		 414 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  25 
 
 		 305 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  25 
 
 		 309 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  25 
 
 		 309 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  25 
 
 		 305 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.47 
 
 		 419 aa  90.9  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  25.96 
 
 		 416 aa  90.1  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  26.53 
 
 		 383 aa  89.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  25.36 
 
 		 305 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.29 
 
 		 305 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  29.33 
 
 		 412 aa  89.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  24.56 
 
 		 305 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  23.93 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.2 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  27.27 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  26.1 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  29.62 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  25.4 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  26.43 
 
 		 505 aa  80.9  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  28 
 
 		 486 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  28.44 
 
 		 524 aa  78.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  26.9 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  22.86 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.9 
 
 		 395 aa  76.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  26.56 
 
 		 530 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13543  putative hydrolase transmembrane protein  25.95 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  26.35 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.55 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3093  beta-lactamase  25.91 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.24 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.36 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.92 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  26.44 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  26.44 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25 
 
 		 420 aa  72  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4979  beta-lactamase  23.12 
 
 		 356 aa  72  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.52 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  25.26 
 
 		 530 aa  70.1  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  26.47 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.25 
 
 		 452 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  24.19 
 
 		 505 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  25.23 
 
 		 640 aa  68.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  26.42 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  27.95 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  25.68 
 
 		 475 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  24.91 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  24.21 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  20.69 
 
 		 315 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  20.69 
 
 		 315 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25 
 
 		 449 aa  66.6  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>