168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1816 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1816  beta-lactamase  100 
 
 		 494 aa  1021    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.403938 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  63.89 
 
 		 522 aa  628  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1749  Beta-lactamase  39.46 
 
 		 496 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2093  beta-lactamase  38.62 
 
 		 497 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  32.08 
 
 		 466 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  35.29 
 
 		 481 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  36.2 
 
 		 473 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  33.61 
 
 		 449 aa  193  7e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  35.91 
 
 		 473 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  35.91 
 
 		 473 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  32.15 
 
 		 467 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  31.93 
 
 		 467 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  31.22 
 
 		 456 aa  187  3e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  32.56 
 
 		 468 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  33.33 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2872  beta-lactamase  34.36 
 
 		 475 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2612  beta-lactamase  32.62 
 
 		 472 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  31.61 
 
 		 459 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_004310  BR1041  hypothetical protein  33.64 
 
 		 440 aa  169  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1007  hypothetical protein  33.64 
 
 		 440 aa  169  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  29.11 
 
 		 491 aa  167  5e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  32.71 
 
 		 443 aa  167  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  31.74 
 
 		 378 aa  158  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.48 
 
 		 468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2913  Hydrolatse transmembrane protein  31.29 
 
 		 459 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  30.68 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2249  beta-lactamase  30.18 
 
 		 468 aa  143  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3570  beta-lactamase  29.7 
 
 		 479 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230187  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  28.91 
 
 		 374 aa  132  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  31.72 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  30.88 
 
 		 432 aa  129  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  33.22 
 
 		 368 aa  124  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  33.1 
 
 		 359 aa  121  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  32.64 
 
 		 368 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  32.54 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  32.65 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  30.91 
 
 		 372 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  29.97 
 
 		 384 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  30.16 
 
 		 378 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  27.81 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  30.48 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  29.52 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  27.81 
 
 		 371 aa  100  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  29.26 
 
 		 383 aa  93.2  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  28.12 
 
 		 323 aa  87.8  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  26.64 
 
 		 400 aa  79.7  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  26.42 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  23.38 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  27.62 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.93 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  23.39 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  25.55 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  24.33 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  24.24 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  25.25 
 
 		 305 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  24.24 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  23.31 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  25.68 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4979  beta-lactamase  23.28 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.91 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13543  putative hydrolase transmembrane protein  24.69 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  24.3 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  24.21 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  24.4 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  25.23 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  22.71 
 
 		 305 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.84 
 
 		 449 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.31 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  26.69 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.82 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  26.8 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  22.77 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  26.18 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  23.76 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.75 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0777  beta-lactamase  27.03 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0135628  normal  0.105331 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  21.28 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  25.35 
 
 		 530 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.1 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.1 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.1 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.78 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2701  hypothetical protein  31.63 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.92 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  25 
 
 		 504 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  24.22 
 
 		 387 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.75 
 
 		 420 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.45 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  23.08 
 
 		 524 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  24.23 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.87 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.33 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2508  beta-lactamase  24.6 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.650655 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1124  beta-lactamase  26.05 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  24.62 
 
 		 640 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  24.92 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  23.42 
 
 		 530 aa  57.4  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.25 
 
 		 419 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.03 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3093  beta-lactamase  34.26 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>